Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Globální sekvenování syfilis

11. dubna 2022 aktualizováno: London School of Hygiene and Tropical Medicine

Sekvenování celého genomu syfilis pomocí rutinních klinických vzorků

Syfilis je závažná sexuálně přenosná infekce. V posledním desetiletí došlo ve Spojeném království k epidemii syfilis mezi muži, kteří měli sex s muži. Časná infekce syfilis způsobuje genitální vřed následovaný, při absenci léčby, generalizovaným onemocněním často doprovázeným vyrážkou. Studie o syfilis byly omezené, protože není možné pěstovat syfilis mimo tělo. Nové přístupy umožňují získat celou genetickou sekvenci Treponema pallidum z výtěru.

V této studii bude k sekvenování použita reziduální DNA shromážděná jako součást rutinní péče o pacienty na klinikách sexuálního zdraví ve Spojeném království. Studie se omezuje na sekvenování celého genomu za použití reziduálního materiálu ze vzorků, není zapojen žádný kontakt s pacientem. Lepším pochopením genomu T.pallidum budou získány poznatky o patogenezi této důležité pohlavně přenosné choroby.

Přehled studie

Postavení

Dokončeno

Podmínky

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Aktuální)

726

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní místa

      • Birmingham, Spojené království
        • University Hospitals Birmingham
      • Brighton, Spojené království
        • Brighton and Sussex NHS Trust
      • Leeds, Spojené království
        • Leeds University Teaching Hospital
      • London, Spojené království
        • Mortimer Market Centre
      • Manchester, Spojené království
        • Penine Acute Hospitals Trust

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let a starší (DOSPĚLÝ, OLDER_ADULT)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Pohlaví způsobilá ke studiu

Všechno

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Pacienti přicházející do služeb sexuálního zdraví ve Spojeném království s diagnózou syfilis.

Identifikujeme reziduální DNA T.pallidum z rutinně odebraných klinických vzorků na zúčastněných klinikách/nemocnicích. Údaje doprovázející tyto vzorky budou anonymizovány a nebudou obsahovat informace umožňující identifikaci pacienta. Doprovodné údaje budou zahrnovat: město původu, věk, pohlaví, HIV status a sexuální orientaci.

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • Diagnóza syfilis

Kritéria vyloučení:

  • Žádný PCR pozitivní klinický vzorek

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Intervence / Léčba
Syfilis
Pacienti se syfilis a detekovatelnou DNA Treponema pallidum v rutinně odebraném klinickém vzorku
Reziduální DNA z klinických vzorků bude využita pro sekvenování celého genomu Treponema pallidum, původce syfilis

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Genomická diverzita Treponema Pallidum hodnocená nukleotidovou diverzitou a fylogenetickou linií
Časové okno: Měřeno ve výchozím stavu – čas zápisu. Ve studii nejsou žádné další vzorky ani návštěvy.
Sekvenování celého genomu britských a globálních vzorků syfilis v kombinaci s fylogogenomickými a populačními genomickými analýzami ke stanovení populační struktury a diverzity Treponema jak v regionálním, tak v globálním kontextu. Diverzita bude hodnocena měřením nukleotidové diverzity mezi vzorky a referenčními genomy.
Měřeno ve výchozím stavu – čas zápisu. Ve studii nejsou žádné další vzorky ani návštěvy.

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (AKTUÁLNÍ)

8. října 2018

Primární dokončení (AKTUÁLNÍ)

31. prosince 2020

Dokončení studie (AKTUÁLNÍ)

28. února 2022

Termíny zápisu do studia

První předloženo

8. října 2018

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

16. října 2018

První zveřejněno (AKTUÁLNÍ)

17. října 2018

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (AKTUÁLNÍ)

12. dubna 2022

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

11. dubna 2022

Naposledy ověřeno

1. dubna 2022

Více informací

Termíny související s touto studií

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

NEROZHODNÝ

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Sekvenování celého genomu

Předplatit