Globális szifilisz szekvenálás
A szifilisz teljes genomjának szekvenálása rutin klinikai minták segítségével
A szifilisz fontos szexuális úton terjedő fertőzés. Az Egyesült Királyságban az elmúlt évtizedben szifiliszjárvány volt a férfiakkal szexuális kapcsolatot tartó férfiak körében. A szifilisz korai fertőzése genitális fekélyt okoz, amelyet kezelés hiányában általános betegség követ, amelyet gyakran bőrkiütés kísér. A szifiliszre vonatkozó vizsgálatok korlátozottak, mivel nem lehetséges a szifilisz a testen kívül tenyészteni. Az új megközelítések lehetővé teszik a Treponema pallidum teljes genetikai szekvenciájának kinyerését tamponból.
Ebben a vizsgálatban az Egyesült Királyság szexuális egészségügyi klinikáin látott betegek rutin betegellátásának részeként gyűjtött maradék DNS-t szekvenáláshoz használják fel. A vizsgálat nem érinti a betegeket, hanem a teljes genom szekvenálására korlátozódik a mintákból származó maradékanyag felhasználásával. A T. pallidum genomjának jobb megértésével betekintést nyerhetünk e fontos szexuális úton terjedő betegség patogenezisébe.
A tanulmány áttekintése
Állapot
Körülmények
Beavatkozás / kezelés
Tanulmány típusa
Beiratkozás (Tényleges)
Kapcsolatok és helyek
Tanulmányi helyek
-
-
-
Birmingham, Egyesült Királyság
- University Hospitals Birmingham
-
Brighton, Egyesült Királyság
- Brighton and Sussex NHS Trust
-
Leeds, Egyesült Királyság
- Leeds University Teaching Hospital
-
London, Egyesült Királyság
- Mortimer Market Centre
-
Manchester, Egyesült Királyság
- Penine Acute Hospitals Trust
-
-
Részvételi kritériumok
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
Egészséges önkénteseket fogad
Tanulmányozható nemek
Mintavételi módszer
Tanulmányi populáció
Az Egyesült Királyság szexuális egészségügyi szolgálataihoz szifilisz diagnózisával jelentkező betegek.
A maradék T.pallidum DNS-t azonosítjuk a részt vevő klinikákon/kórházakban tartott rutinszerűen gyűjtött klinikai mintákból. Az ezeket a mintákat kísérő adatokat anonimizáljuk, és nem tartalmaznak betegek azonosítására alkalmas információkat. A kísérő adatok a következőket tartalmazzák: származási város, életkor, nem, HIV-státusz és szexuális irányultság.
Leírás
Bevételi kritériumok:
- A szifilisz diagnózisa
Kizárási kritériumok:
- Nincs PCR pozitív klinikai minta
Tanulási terv
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
Kohorszok és beavatkozások
Csoport / Kohorsz |
Beavatkozás / kezelés |
|---|---|
|
Szifilisz
Szifiliszben szenvedő és kimutatható Treponema pallidum DNS-ben szenvedő betegek rutinszerűen gyűjtött klinikai mintában
|
A klinikai mintákból származó maradék DNS-t a szifilisz kórokozója, a Treponema pallidum teljes genomjának szekvenálására használják fel.
|
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
A Treponema Pallidum genomiális diverzitása a nukleotiddiverzitás és a filogenetikai származás alapján
Időkeret: Kiinduláskor mérve – a beiratkozás ideje. Nincsenek további minták vagy látogatások a vizsgálatban.
|
Az Egyesült Királyság és a globális szifiliszminták teljes genomszekvenálása filogenomiai és populációs genomikai elemzésekkel kombinálva a Treponema populációszerkezetének és diverzitásának meghatározására regionális és globális összefüggésben.
A diverzitást a minták és a referenciagenomok közötti nukleotiddiverzitás mérésével értékelik.
|
Kiinduláskor mérve – a beiratkozás ideje. Nincsenek további minták vagy látogatások a vizsgálatban.
|
Együttműködők és nyomozók
Együttműködők
Tanulmányi rekorddátumok
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (TÉNYLEGES)
Elsődleges befejezés (TÉNYLEGES)
A tanulmány befejezése (TÉNYLEGES)
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Első közzététel (TÉNYLEGES)
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (TÉNYLEGES)
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Utolsó ellenőrzés
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- 16014
Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)
Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .
Klinikai vizsgálatok a Teljes genom szekvenálás
-
University Hospital, Strasbourg, FranceBefejezveElsődleges immunhiány (PID) gyakori változó immunhiány (CVID)Franciaország
-
Addario Lung Cancer Medical InstituteNational Cancer Institute (NCI); Dana-Farber Cancer InstituteBefejezveNem kissejtes tüdőrákEgyesült Államok
-
University of California, San FranciscoUniversity of California, Los Angeles; University of California, Davis; University... és más munkatársakToborzásUveitis | Fertőző betegségEgyesült Államok
-
Imperial College London Diabetes CentreIsmeretlenMendeli rendellenességek | Genetikai rendellenesség | Újszerű mutáció | Örökletes rendellenesség | De Novo mutáció | Öröklött betegség | Egygénes hibákEgyesült Arab Emírségek
-
ReprogeneticsReproductive Medicine Lab, LLCIsmeretlen
-
Institut National de la Santé Et de la Recherche...Commissariat A L'energie Atomique; Imagine InstituteBefejezve
-
GenEmbryomics Pty. LtdToborzásTermékenységi problémák | Egygénes hibákEgyesült Államok, Pulyka
-
First Affiliated Hospital Xi'an Jiaotong UniversityToborzás
-
Brigham and Women's HospitalEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development... és más munkatársakBefejezveBetegségre való genetikai hajlam | Örökletes betegségekEgyesült Államok
-
IRCCS Eugenio MedeaToborzásNeurofejlődési zavar (diagnózis)Olaszország