Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Maailmanlaajuinen kupan sekvensointi

maanantai 11. huhtikuuta 2022 päivittänyt: London School of Hygiene and Tropical Medicine

Syfiliksen koko genomin sekvensointi rutiinikliinisillä näytteillä

Syfilis on tärkeä sukupuoliteitse tarttuva infektio. Yhdistyneessä kuningaskunnassa on ollut kuppaepidemia miesten kanssa seksiä harrastaneiden miesten keskuudessa viimeisen vuosikymmenen aikana. Varhainen kuppatartunta aiheuttaa sukupuolielinten haavauman, jota seuraa hoidon puuttuessa yleinen sairaus, johon usein liittyy ihottumaa. Syfilistutkimukset ovat olleet rajallisia, koska kuppaa ei ole mahdollista kasvattaa kehon ulkopuolella. Uudet lähestymistavat mahdollistavat Treponema pallidumin koko geneettisen sekvenssin saamisen vanupuikolla.

Tässä tutkimuksessa sekvensointiin käytetään sekvensointiin jäännös-DNA:ta, joka on kerätty osana rutiininomaista potilashoitoa Iso-Britannian seksuaaliklinikoilla. Potilaskontaktia ei ole mukana tutkimuksessa, joka rajoittuu koko genomin sekvensointiin käyttämällä näytteiden jäännösmateriaalia. Ymmärtämällä paremmin T. pallidumin genomia saadaan oivalluksia tämän tärkeän sukupuoliteitse tarttuvan taudin patogeneesiin.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Tila

Valmis

Ehdot

Interventio / Hoito

Opintotyyppi

Havainnollistava

Ilmoittautuminen (Todellinen)

726

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskelupaikat

  • Yhdistynyt kuningaskunta
      • Birmingham, Yhdistynyt kuningaskunta
        • University Hospitals Birmingham
      • Brighton, Yhdistynyt kuningaskunta
        • Brighton and Sussex NHS Trust
      • Leeds, Yhdistynyt kuningaskunta
        • Leeds University Teaching Hospital
      • London, Yhdistynyt kuningaskunta
        • Mortimer Market Centre
      • Manchester, Yhdistynyt kuningaskunta
        • Penine Acute Hospitals Trust

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

18 vuotta ja vanhemmat (AIKUINEN, OLDER_ADULT)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Ei

Sukupuolet, jotka voivat opiskella

Kaikki

Näytteenottomenetelmä

Ei-todennäköisyysnäyte

Tutkimusväestö

Potilaat, jotka hakeutuvat seksuaaliterveyspalveluihin Isossa-Britanniassa, joilla on diagnosoitu kuppa.

Tunnistamme jäljellä olevan T.pallidum-DNA:n osallistuvissa klinikoissa/sairaaloissa pidetyistä rutiininomaisesti kerätyistä kliinisistä näytteistä. Näihin näytteisiin liittyvät tiedot anonymisoidaan, eivätkä ne sisällä potilaan tunnistetietoja. Mukana olevat tiedot sisältävät: alkuperäkaupunki, ikä, sukupuoli, HIV-status ja seksuaalinen suuntautuminen.

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

  • Syfiliksen diagnoosi

Poissulkemiskriteerit:

  • Ei PCR-positiivista kliinistä näytettä

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

Kohortit ja interventiot

Ryhmä/Kohortti
Interventio / Hoito
Kuppa
Potilaat, joilla on kuppa ja havaittava Treponema pallidum -DNA rutiininomaisesti kerätystä kliinisestä näytteestä
Diagnostinen testi: Koko genomin sekvensointi
Kliinisistä näytteistä saatua jäännös-DNA:ta käytetään kupan aiheuttajan Treponema pallidumin koko genomin sekvensointiin

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
Treponema Pallidumin genominen monimuotoisuus nukleotidien monimuotoisuuden ja fylogeneettisen sukulinjan perusteella arvioituna
Aikaikkuna: Mitattu lähtötilanteessa - ilmoittautumisaika. Tutkimuksessa ei ole muita näytteitä tai käyntejä.
Yhdistyneen kuningaskunnan ja maailmanlaajuisten kuppanäytteiden koko genomin sekvensointi yhdistettynä filogenomiin ja populaatiogenomianalyyseihin Treponeman populaatiorakenteen ja monimuotoisuuden määrittämiseksi sekä alueellisessa että globaalissa kontekstissa. Monimuotoisuus arvioidaan mittaamalla nukleotididiversiteetti näytteiden ja vertailugenomien välillä.
Mitattu lähtötilanteessa - ilmoittautumisaika. Tutkimuksessa ei ole muita näytteitä tai käyntejä.

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Sponsori

London School of Hygiene and Tropical Medicine

Yhteistyökumppanit

Wellcome Sanger Institute

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus (TODELLINEN)

Maanantai 8. lokakuuta 2018

Ensisijainen valmistuminen (TODELLINEN)

Torstai 31. joulukuuta 2020

Opintojen valmistuminen (TODELLINEN)

Maanantai 28. helmikuuta 2022

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Maanantai 8. lokakuuta 2018

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Tiistai 16. lokakuuta 2018

Ensimmäinen Lähetetty (TODELLINEN)

Keskiviikko 17. lokakuuta 2018

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (TODELLINEN)

Tiistai 12. huhtikuuta 2022

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Maanantai 11. huhtikuuta 2022

Viimeksi vahvistettu

Perjantai 1. huhtikuuta 2022

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja

Muut tutkimustunnusnumerot

  • 16014

Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)

Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?

PÄÄTTÄMÄTÖN

Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta

Ei

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta

Ei

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Kliiniset tutkimukset Koko genomin sekvensointi

Hae vastaavia kokeiluja

Sponsorit ja yhteistyökumppanit

Sairaudet

Huumeiden interventiot

CROs by country

CROs in Senegal

Ehdot

Harvinaiset sairaudet

Huumeiden interventiot

Ravintolisät

Sponsori / yhteistyökumppanit

Sijainnit

3
Tilaa