- ICH GCP
- Register voor klinische proeven in de VS.
- Klinische proef NCT06157372
Detectie van ziekteverwekker- en antibioticaresistentiegenen door gerichte sequencing van de volgende generatie bij ICU-patiënten.
Detectie van ziekteverwekker- en antibioticaresistentiegenen door gerichte sequencing van de volgende generatie vergeleken met metagenomische sequencing van de volgende generatie bij ICU-patiënten.
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Infectieziekten zijn een van de ziekten met de hoogste sterfte en morbiditeit bij de mens. Vanwege de moeilijkheid bij het identificeren van de ziekteverwekker in het vroege stadium van de infectie, moeten patiënten met ernstige infecties vaak langdurig empirisch breedspectrumantimicrobiële middelen gebruiken. De traditionele gouden standaard van etiologische detectie - etiologische cultuur, zelfs bij sepsispatiënten is slechts ongeveer 60% van de resultaten positief. Daarom is de nauwkeurige identificatie en snelle classificatie van pathogene micro-organismen erg belangrijk voor de nauwkeurige diagnose en tijdige behandeling van de patiënt.
Het is aangetoond dat metagenomische next-generation sequencing (mNGS), die de afgelopen jaren is ontstaan, vroege diagnose en gerichte medicatiebegeleiding biedt voor bloedbaaninfecties en luchtweginfecties, maar het is duur en niet in staat om gerelateerde geneesmiddelresistente genen te verschaffen. Daarom is gerichte next-generation sequencing (tNGS) afgeleid, die wordt gekenmerkt door snelle sequencing en genetische tests voor medicijnresistentie.
Het doel van deze studie is om de werkzaamheid van de etiologische diagnose te evalueren en patiënten een nauwkeurigere behandeling te bieden.
Studietype
Inschrijving (Geschat)
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: Ting Li
- Telefoonnummer: 011-86-15608657562
- E-mail: 3423580562@qq.com
Studie Contact Back-up
- Naam: Fangyi Li
- Telefoonnummer: 011-86-15603056533
- E-mail: Lify8@mailsysu.edu.cn
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Volwassen
- Oudere volwassene
Accepteert gezonde vrijwilligers
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- De aanwezigheid van een infectie of sluit de aanwezigheid van een infectie duidelijk uit.
- Etiologische cultuur en/of metagenomische sequencing-detectie van de volgende generatie van specimens die voor testen worden verzonden.
Uitsluitingscriteria:
- Vermoedelijke infectie.
- Deelname aan andere klinische onderzoeken in de afgelopen 2 maanden.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Niet-infectiegroep
Deelnemers ontvingen een traditionele etiologische cultuur van de vermoedelijke plaats van infectie.
|
Het bieden van een snelle etiologische diagnose van patiënten door middel van gerichte sequencing van de volgende generatie.
|
|
Infectie groep
Deelnemers ontvingen traditionele etiologische cultuur, metagenomische next-generation sequencing van infectieuze sites.
|
Het bieden van een snelle etiologische diagnose van patiënten door middel van gerichte sequencing van de volgende generatie.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Gevoeligheid
Tijdsspanne: 1 jaar
|
De waarschijnlijkheid om positief te zijn in de klinische samengestelde diagnose, de waarschijnlijkheid dat etiologische kweek-, mNGS- en tNGS-tests ook positief zijn, ook wel het werkelijk positieve percentage genoemd.
|
1 jaar
|
|
Specificiteit
Tijdsspanne: 1 jaar
|
Het verwijst naar de waarschijnlijkheid dat kweken, mNGS- en tNGS-tests ook negatief zijn in de aanwezigheid van niet-infectie, bevestigd door de gouden standaard.
|
1 jaar
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Vals-positief percentage
Tijdsspanne: 1 jaar
|
Het verwijst naar de waarschijnlijkheid dat de door de gouden standaard bevestigde afwezigheid van infectie ook positief is voor etiologische kweek-, mNGS- en tNGS-tests.
|
1 jaar
|
|
Vals-negatief percentage
Tijdsspanne: 1 jaar
|
Het verwijst naar de waarschijnlijkheid om positief te zijn in de klinische samengestelde diagnose, en de waarschijnlijkheid dat etiologische kweken, mNGS- en tNGS-tests ook negatief zullen zijn.
|
1 jaar
|
|
Positief voorspellende waarde
Tijdsspanne: 1 jaar
|
Positief voorspellende waarde is de kans dat proefpersonen met een positieve test daadwerkelijk de ziekte hebben.
|
1 jaar
|
|
Negatieve voorspellende waarde
Tijdsspanne: 1 jaar
|
Negatief voorspellende waarde is de kans dat proefpersonen met een negatieve screeningstest de ziekte werkelijk niet hebben.
|
1 jaar
|
|
Kappa-waarden
Tijdsspanne: 1 jaar
|
Kappa-waarden worden gebruikt om de overeenstemming tussen twee beoordelaars te meten.
Het bereik van mogelijke waarden van kappa loopt van -1 tot 1, hoewel deze gewoonlijk tussen 0 en 1 ligt. Eenheid vertegenwoordigt perfecte overeenstemming, wat aangeeft dat de beoordelaars het eens zijn over hun classificatie van elk geval.
Kappa-waarden van 0,41~0,60 zijn redelijk consistent, 0,61~0,80 zijn in principe consistent en 0,81~1,00 zijn vrijwel identiek.
|
1 jaar
|
|
Geneesmiddelresistent gen door gerichte sequencing van de volgende generatie
Tijdsspanne: 1 jaar
|
Het verwijst naar de verspreiding van resistentie tegen geneesmiddelen door gerichte sequencing van de volgende generatie met behulp van de Comprehensive Antibiotic Resistance Database.
|
1 jaar
|
Medewerkers en onderzoekers
Onderzoekers
- Studie directeur: Zhijie He, Sun Yat-sen Memorial Hospital,Sun Yat-sen University
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Chiu CY, Miller SA. Clinical metagenomics. Nat Rev Genet. 2019 Jun;20(6):341-355. doi: 10.1038/s41576-019-0113-7.
- Diao Z, Han D, Zhang R, Li J. Metagenomics next-generation sequencing tests take the stage in the diagnosis of lower respiratory tract infections. J Adv Res. 2021 Sep 29;38:201-212. doi: 10.1016/j.jare.2021.09.012. eCollection 2022 May.
- Miao Q, Ma Y, Wang Q, Pan J, Zhang Y, Jin W, Yao Y, Su Y, Huang Y, Wang M, Li B, Li H, Zhou C, Li C, Ye M, Xu X, Li Y, Hu B. Microbiological Diagnostic Performance of Metagenomic Next-generation Sequencing When Applied to Clinical Practice. Clin Infect Dis. 2018 Nov 13;67(suppl_2):S231-S240. doi: 10.1093/cid/ciy693.
- Pei XM, Yeung MHY, Wong ANN, Tsang HF, Yu ACS, Yim AKY, Wong SCC. Targeted Sequencing Approach and Its Clinical Applications for the Molecular Diagnosis of Human Diseases. Cells. 2023 Feb 2;12(3):493. doi: 10.3390/cells12030493.
- Li S, Tong J, Liu Y, Shen W, Hu P. Targeted next generation sequencing is comparable with metagenomic next generation sequencing in adults with pneumonia for pathogenic microorganism detection. J Infect. 2022 Nov;85(5):e127-e129. doi: 10.1016/j.jinf.2022.08.022. Epub 2022 Aug 26. No abstract available.
- Gaston DC, Miller HB, Fissel JA, Jacobs E, Gough E, Wu J, Klein EY, Carroll KC, Simner PJ. Evaluation of Metagenomic and Targeted Next-Generation Sequencing Workflows for Detection of Respiratory Pathogens from Bronchoalveolar Lavage Fluid Specimens. J Clin Microbiol. 2022 Jul 20;60(7):e0052622. doi: 10.1128/jcm.00526-22. Epub 2022 Jun 13.
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Geschat)
Primaire voltooiing (Geschat)
Studie voltooiing (Geschat)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Geschat)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Geschat)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- SYSKY-2023-667-03
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .