- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT06157372
Påvisning af patogen- og antibiotikaresistensgener ved målrettet næste generations sekventering hos ICU-patienter.
Påvisning af patogen- og antibiotikaresistensgener ved målrettet næste generations sekvensering sammenlignet med metagenomisk næste generations sekvensering hos ICU-patienter.
Studieoversigt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Infektionssygdomme er en af de højeste dødeligheds- og sygelighedssygdomme hos mennesker. På grund af vanskeligheden ved at identificere patogenet i den tidlige fase af infektionen, har patienter med alvorlige infektioner ofte behov for empirisk at bruge bredspektrede antimikrobielle midler i lang tid. Den traditionelle guldstandard for ætiologisk påvisning - ætiologisk kultur, selv hos sepsispatienter er kun omkring 60% af resultaterne positive. Derfor er den nøjagtige identifikation og hurtige klassificering af patogene mikroorganismer meget vigtig for patientens præcise diagnose og rettidig behandling.
Metagenomic next generation sequencing (mNGS), som er dukket op i de senere år, har vist sig at give tidlig diagnose og målrettet medicinvejledning til blodbaneinfektioner og luftvejsinfektioner, men det er dyrt og ikke i stand til at give relaterede lægemiddelresistente gener. Derfor er der udledt målrettet næste generations sekventering (tNGS), som er karakteriseret ved hurtig sekventering og genetisk testning for lægemiddelresistens.
Formålet med denne undersøgelse er at evaluere effektiviteten af ætiologisk diagnose og give patienterne mere præcis behandling.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
- Navn: Ting Li
- Telefonnummer: 011-86-15608657562
- E-mail: 3423580562@qq.com
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Fangyi Li
- Telefonnummer: 011-86-15603056533
- E-mail: Lify8@mailsysu.edu.cn
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Tilstedeværelsen af en infektion eller klart udelukket tilstedeværelsen af infektion.
- Ætiologisk kultur og/eller metagenomisk næste-generations sekventeringsdetektion af prøver sendt til test.
Ekskluderingskriterier:
- Mistænkt infektion.
- Deltagelse i andre kliniske forsøg inden for de seneste 2 måneder.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Ikke-infektionsgruppe
Deltagerne modtog traditionel ætiologisk kultur af formodet infektionssted.
|
At give hurtig ætiologisk diagnose af patienter ved hjælp af målrettet næste generations sekventering.
|
|
Infektionsgruppe
Deltagerne modtog traditionel ætiologisk kultur, metagenomisk næste generations sekventering af infektiøse steder.
|
At give hurtig ætiologisk diagnose af patienter ved hjælp af målrettet næste generations sekventering.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Følsomhed
Tidsramme: 1 år
|
Sandsynligheden for at være positiv i klinisk sammensat diagnose, sandsynligheden for, at ætiologiske kultur-, mNGS- og tNGS-tests også er positive, hvilket også er kendt som den sande positive rate.
|
1 år
|
|
Specificitet
Tidsramme: 1 år
|
Det henviser til sandsynligheden for, at kulturer, mNGS- og tNGS-tests også er negative i nærværelse af ikke-infektion bekræftet af guldstandarden.
|
1 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Falsk-positiv sats
Tidsramme: 1 år
|
Det henviser til sandsynligheden for, at guldstandarden bekræftet fravær af infektion også er positiv for ætiologiske kultur-, mNGS- og tNGS-tests.
|
1 år
|
|
Falsk-negativ rate
Tidsramme: 1 år
|
Det refererer til sandsynligheden for at være positiv i den kliniske sammensatte diagnose, og sandsynligheden for, at ætiologiske kulturer, mNGS- og tNGS-tests også vil være negative.
|
1 år
|
|
Positiv prædiktiv værdi
Tidsramme: 1 år
|
Positiv prædiktiv værdi er sandsynligheden for, at forsøgspersoner med en positiv test virkelig har sygdommen.
|
1 år
|
|
Negativ prædiktiv værdi
Tidsramme: 1 år
|
Negativ prædiktiv værdi er sandsynligheden for, at forsøgspersoner med en negativ screeningstest virkelig ikke har sygdommen.
|
1 år
|
|
Kappa værdier
Tidsramme: 1 år
|
Kappa-værdier bruges til at måle overensstemmelsen mellem to bedømmere.
Rækken af mulige værdier for kappa er fra -1 til 1, selvom den normalt falder mellem 0 og 1. Enhed repræsenterer perfekt overensstemmelse, hvilket indikerer, at bedømmerne er enige i deres klassificering af hvert tilfælde.
Kappa-værdier på 0,41~0,60 er moderat konsistente, 0,61~0,80 er grundlæggende konsistente, og 0,81~1,00 er næsten identiske.
|
1 år
|
|
Lægemiddelresistent gen ved målrettet næste generations sekventering
Tidsramme: 1 år
|
Det refererer til fordelingen af lægemiddelresistens ved målrettet næste generations sekventering ved hjælp af Comprehensive Antibiotic Resistance Database.
|
1 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Efterforskere
- Studieleder: Zhijie He, Sun Yat-sen Memorial Hospital,Sun Yat-sen University
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Chiu CY, Miller SA. Clinical metagenomics. Nat Rev Genet. 2019 Jun;20(6):341-355. doi: 10.1038/s41576-019-0113-7.
- Diao Z, Han D, Zhang R, Li J. Metagenomics next-generation sequencing tests take the stage in the diagnosis of lower respiratory tract infections. J Adv Res. 2021 Sep 29;38:201-212. doi: 10.1016/j.jare.2021.09.012. eCollection 2022 May.
- Miao Q, Ma Y, Wang Q, Pan J, Zhang Y, Jin W, Yao Y, Su Y, Huang Y, Wang M, Li B, Li H, Zhou C, Li C, Ye M, Xu X, Li Y, Hu B. Microbiological Diagnostic Performance of Metagenomic Next-generation Sequencing When Applied to Clinical Practice. Clin Infect Dis. 2018 Nov 13;67(suppl_2):S231-S240. doi: 10.1093/cid/ciy693.
- Pei XM, Yeung MHY, Wong ANN, Tsang HF, Yu ACS, Yim AKY, Wong SCC. Targeted Sequencing Approach and Its Clinical Applications for the Molecular Diagnosis of Human Diseases. Cells. 2023 Feb 2;12(3):493. doi: 10.3390/cells12030493.
- Li S, Tong J, Liu Y, Shen W, Hu P. Targeted next generation sequencing is comparable with metagenomic next generation sequencing in adults with pneumonia for pathogenic microorganism detection. J Infect. 2022 Nov;85(5):e127-e129. doi: 10.1016/j.jinf.2022.08.022. Epub 2022 Aug 26. No abstract available.
- Gaston DC, Miller HB, Fissel JA, Jacobs E, Gough E, Wu J, Klein EY, Carroll KC, Simner PJ. Evaluation of Metagenomic and Targeted Next-Generation Sequencing Workflows for Detection of Respiratory Pathogens from Bronchoalveolar Lavage Fluid Specimens. J Clin Microbiol. 2022 Jul 20;60(7):e0052622. doi: 10.1128/jcm.00526-22. Epub 2022 Jun 13.
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Anslået)
Primær færdiggørelse (Anslået)
Studieafslutning (Anslået)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Anslået)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Anslået)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- SYSKY-2023-667-03
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Infektioner
-
Jianfeng XieRekrutteringCLABSI - Central Line Associated Bloodstream InfectionKina
-
Fondazione Policlinico Universitario Agostino Gemelli...Lo.Li.Pharma s.r.lIkke rekrutterer endnuHPV - Anogenital Human Papilloma Virus Infection | Infertilitet
-
University of Santiago de CompostelaOsteology FoundationRekruttering
-
University of GaziantepIkke rekrutterer endnuHPV - Anogenital Human Papilloma Virus Infection | Kræft, sund | Sundheds tro model
-
Assiut UniversityIkke rekrutterer endnuCLABSI - Central Line Associated Bloodstream Infection | Perifert indsat central kateter | Umbilical venekateter
-
Institut PasteurRekruttering
-
Universidad del DesarrolloAfsluttetHealthcare Associated InfectionChile
-
The University of Texas Health Science Center,...EurofinsAfsluttetOdontogen Deep Space Neck InfectionForenede Stater
-
Centre Hospitalier Universitaire de NiceIkke rekrutterer endnuHealth Care Associated Infection
-
Superior UniversityAktiv, ikke rekrutterendeHealthcare Associated InfectionPakistan
Kliniske forsøg med målrettet næste generations sekventering (tNGS)
-
Foundation for Innovative New Diagnostics, SwitzerlandAfsluttetTuberkulose, multiresistentGeorgien, Indien, Sydafrika
-
Jagiellonian UniversityRekruttering
-
University Hospital TuebingenAfsluttetSjældne sygdomme | Genetisk dispositionTyskland
-
Addario Lung Cancer Medical InstituteNational Cancer Institute (NCI); Dana-Farber Cancer InstituteAfsluttetIkke-småcellet lungekræftForenede Stater
-
Ambry GeneticsBeth Israel Deaconess Medical Center; HonorHealth Research Institute; University...AfsluttetDuktalt adenokarcinom i bugspytkirtlenForenede Stater
-
Imperial College London Diabetes CentreUkendtMendelske lidelser | Genetisk lidelse | Roman mutation | Arvelig lidelse | De Novo Mutation | Arvelig sygdom | Enkelt-gen-defekterForenede Arabiske Emirater
-
Peking Union Medical CollegeUkendtBryst Neoplasma Kvinde | Mutation | TerapeutikKina
-
ReprogeneticsReproductive Medicine Lab, LLCUkendt
-
University Hospital, EssenNoscendo GmbH, Germany; Health Economics and Health Care Management, Bielefeld... og andre samarbejdspartnereAfsluttetSepsis | Septisk chokTyskland
-
Tianjin Medical University Second HospitalUkendt