- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT06157372
Detekce genů rezistence patogenů a antibiotik cíleným sekvenováním nové generace u pacientů na JIP.
Detekce genů rezistence patogenů a antibiotik cíleným sekvenováním nové generace ve srovnání s metagenomickým sekvenováním nové generace u pacientů na JIP.
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Intervence / Léčba
Detailní popis
Infekční onemocnění jsou jednou z nemocí s nejvyšší úmrtností a nemocností u lidí. Vzhledem k obtížnosti identifikace patogenu v časném stadiu infekce potřebují pacienti s těžkými infekcemi často empiricky dlouhodobě používat širokospektrá antimikrobiální látky. Tradiční zlatý standard etiologické detekce – etiologická kultivace, i u sepse je pouze asi 60 % výsledků pozitivních. Proto je přesná identifikace a rychlá klasifikace patogenních mikroorganismů velmi důležitá pro přesnou diagnózu pacienta a včasnou léčbu.
Ukázalo se, že metagenomické sekvenování nové generace (mNGS), které se objevilo v posledních letech, poskytuje včasnou diagnózu a cílené vedení léků pro infekce krevního řečiště a respirační infekce, ale je drahé a není schopné poskytnout související geny rezistentní vůči lékům. Proto bylo odvozeno cílené sekvenování nové generace (tNGS), které se vyznačuje rychlým sekvenováním a genetickým testováním lékové rezistence.
Účelem této studie je zhodnotit účinnost etiologické diagnózy a poskytnout pacientům přesnější léčbu.
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Ting Li
- Telefonní číslo: 011-86-15608657562
- E-mail: 3423580562@qq.com
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Fangyi Li
- Telefonní číslo: 011-86-15603056533
- E-mail: Lify8@mailsysu.edu.cn
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Přítomnost infekce nebo jasně vyloučená přítomnost infekce.
- Etiologická kultivace a/nebo metagenomická detekce sekvenování nové generace vzorků odeslaných k testování.
Kritéria vyloučení:
- Podezření na infekci.
- Účast v jiných klinických studiích v posledních 2 měsících.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
---|---|
Neinfekční skupina
Účastníci absolvovali tradiční etiologickou kultivaci místa podezření na infekci.
|
Poskytnout rychlou etiologickou diagnostiku pacientů pomocí cíleného sekvenování nové generace.
|
Infekční skupina
Účastníci obdrželi tradiční etiologickou kulturu, metagenomické sekvenování infekčních míst nové generace.
|
Poskytnout rychlou etiologickou diagnostiku pacientů pomocí cíleného sekvenování nové generace.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
---|---|---|
Citlivost
Časové okno: 1 rok
|
Pravděpodobnost, že bude pozitivní v klinické složené diagnóze, pravděpodobnost, že etiologická kultivace, testy mNGS a tNGS jsou také pozitivní, což je také známé jako skutečná pozitivní míra.
|
1 rok
|
Specifičnost
Časové okno: 1 rok
|
Vztahuje se k pravděpodobnosti, že kultury, mNGS a tNGS testy jsou také negativní v přítomnosti neinfekce potvrzené zlatým standardem.
|
1 rok
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
---|---|---|
Falešně pozitivní sazba
Časové okno: 1 rok
|
Vztahuje se k pravděpodobnosti, že zlatý standard potvrzená nepřítomnost infekce je také pozitivní pro etiologickou kultivaci, mNGS a tNGS testy.
|
1 rok
|
Falešně negativní sazba
Časové okno: 1 rok
|
Týká se pravděpodobnosti, že bude pozitivní v klinické složené diagnóze, a pravděpodobnosti, že etiologické kultivace, testy mNGS a tNGS budou také negativní.
|
1 rok
|
Pozitivní prediktivní hodnota
Časové okno: 1 rok
|
Pozitivní prediktivní hodnota je pravděpodobnost, že subjekty s pozitivním testem skutečně mají nemoc.
|
1 rok
|
Negativní prediktivní hodnota
Časové okno: 1 rok
|
Negativní prediktivní hodnota je pravděpodobnost, že subjekty s negativním screeningovým testem skutečně nemají onemocnění.
|
1 rok
|
Kappa hodnoty
Časové okno: 1 rok
|
Hodnoty kappa se používají k měření shody mezi dvěma hodnotiteli.
Rozsah možných hodnot kappa je od -1 do 1, i když obvykle spadá mezi 0 a 1. Jednota představuje dokonalou shodu, což naznačuje, že hodnotitelé se shodují ve své klasifikaci každého případu.
Kappa hodnoty 0,41~0,60 jsou středně konzistentní, 0,61~0,80 jsou v podstatě konzistentní a 0,81~1,00 jsou téměř totožné.
|
1 rok
|
Gen rezistentní vůči lékům cíleným sekvenováním nové generace
Časové okno: 1 rok
|
Týká se distribuce lékové rezistence cíleným sekvenováním nové generace pomocí Komplexní databáze antibiotické rezistence.
|
1 rok
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Ředitel studie: Zhijie He, Sun Yat-sen Memorial Hospital,Sun Yat-sen University
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Chiu CY, Miller SA. Clinical metagenomics. Nat Rev Genet. 2019 Jun;20(6):341-355. doi: 10.1038/s41576-019-0113-7.
- Diao Z, Han D, Zhang R, Li J. Metagenomics next-generation sequencing tests take the stage in the diagnosis of lower respiratory tract infections. J Adv Res. 2021 Sep 29;38:201-212. doi: 10.1016/j.jare.2021.09.012. eCollection 2022 May.
- Miao Q, Ma Y, Wang Q, Pan J, Zhang Y, Jin W, Yao Y, Su Y, Huang Y, Wang M, Li B, Li H, Zhou C, Li C, Ye M, Xu X, Li Y, Hu B. Microbiological Diagnostic Performance of Metagenomic Next-generation Sequencing When Applied to Clinical Practice. Clin Infect Dis. 2018 Nov 13;67(suppl_2):S231-S240. doi: 10.1093/cid/ciy693.
- Pei XM, Yeung MHY, Wong ANN, Tsang HF, Yu ACS, Yim AKY, Wong SCC. Targeted Sequencing Approach and Its Clinical Applications for the Molecular Diagnosis of Human Diseases. Cells. 2023 Feb 2;12(3):493. doi: 10.3390/cells12030493.
- Li S, Tong J, Liu Y, Shen W, Hu P. Targeted next generation sequencing is comparable with metagenomic next generation sequencing in adults with pneumonia for pathogenic microorganism detection. J Infect. 2022 Nov;85(5):e127-e129. doi: 10.1016/j.jinf.2022.08.022. Epub 2022 Aug 26. No abstract available.
- Gaston DC, Miller HB, Fissel JA, Jacobs E, Gough E, Wu J, Klein EY, Carroll KC, Simner PJ. Evaluation of Metagenomic and Targeted Next-Generation Sequencing Workflows for Detection of Respiratory Pathogens from Bronchoalveolar Lavage Fluid Specimens. J Clin Microbiol. 2022 Jul 20;60(7):e0052622. doi: 10.1128/jcm.00526-22. Epub 2022 Jun 13.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Odhadovaný)
Primární dokončení (Odhadovaný)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Odhadovaný)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Odhadovaný)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- SYSKY-2023-667-03
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Infekce
-
The Immunobiological Technology Institute (Bio-Manguinhos)...Oswaldo Cruz InstituteZatím nenabírámeMalomocenstvíBrazílie
-
Institute of Tropical Medicine, BelgiumLeiden University Medical Center; Damien Foundation; Instituto Fernandes Figueira a další spolupracovníciDokončenoMalomocenstvíKomory, Madagaskar
-
Institute of Tropical Medicine, BelgiumDamien Foundation; Instituto Oswaldo Cruz; Programme National de lutte contre... a další spolupracovníciDokončeno
-
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível...Dokončeno
-
Kaiser PermanenteHealth Resources and Services Administration (HRSA)Již není k dispozici
-
National Institute of Allergy and Infectious Diseases...Dokončeno
-
Annemieke GelukThe Leprosy Mission BangladeshNábor
-
Institute of Tropical Medicine, BelgiumNábor
-
Emory UniversityDokončenoCentral Line Associated Bloodstream Infections (CLABSI) | Transplantace kostní dřeněSpojené státy
-
IDRIAmerican Leprosy MissionsDokončeno
Klinické studie na cílené sekvenování nové generace (tNGS)
-
Institut National de la Santé Et de la Recherche...Institut Bergonié; Plateforme labellisée Inca - Institut Bergonié, Bordeaux; Plateforme... a další spolupracovníciDokončenoSarkom měkkých tkání | Kolorektální karcinomFrancie
-
Tianjin Medical University Second HospitalNeznámýSolidní nádor, dospělýČína
-
Hospices Civils de LyonNeznámý
-
Dr. Rebecca SchuleGerman Federal Ministry of Education and Research; German Center for Neurodegenerative...NáborDědičná spastická paraplegieRakousko, Německo, Itálie
-
University of FloridaNational Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)Nábor
-
Dr. Rebecca SchuleGerman Research Foundation; German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE)NáborSpastická ataxieKanada, Francie, Německo, Itálie, Holandsko, Krocan, Spojené království