Virkningen av Covid-19 sykehusbehandling på utbredelsen av MDRO i Indonesia

Det overordnede målet med studien er å avsløre effekten av sykehusbehandling for COVID-19-pasienter på prevalensen av MDRO blant COVID-19-pasienter, sammenlignet med ikke-COVID-19 sykehusbehandling og prevalensen av MDRO blant ikke-COVID-19 pasienter, med dens underliggende determinanter på sykehus med begrensede ressurser i Indonesia.

Spesifikke mål med studien:

1. For å måle prevalensen av MDRO i COVID-19-avdelingene sammenlignet med ikke-COVID-19-avdelinger.
2. For å undersøke overføringen av den mest utbredte MDRO i COVID-19-avdelingene sammenlignet med ikke-COVID-19-avdelinger.
3. For å analysere håndhygienesamsvar og bruk av PPE i COVID-19-avdelinger sammenlignet med ikke-COVID-19-avdelinger.
4. Å analysere antibiotikabruken i covid-19-avdelinger sammenlignet med ikke-COVID-19-avdelinger.

Design av studien:

En prospektiv, observasjonskohortstudie vil bli utført i både COVID-19-avdelinger og ikke-COVID-19-avdelinger på et sekundærsykehus og et tertiærsykehus i provinsen Øst-Java i Indonesia. Både intensivavdelinger (ICU) og ikke-ICUer vil bli brukt. Tertiærsykehuset i Malang er Dr. Saiful Anwar-sykehuset med 882 senger. For tiden er 80 COVID-19-pasienter innlagt hver måned. Sekundærsykehuset har 250 senger, og cirka 25 COVID-19-pasienter legges inn hver måned.

De spesifikke målene vil bli adressert som følger:

1. MDRO-prevalens

   Følgende MDRO vil inngå: MRSA, ESBL-produserende Escherichia coli, ESBL-produserende og karbapenemase-produserende K. pneumoniae, karbapenem-resistente P. aeruginosa og karbapenem-resistente A. baumannii. Disse vil bli søkt etter og samlet inn via to tilnærminger:

   1. Påvisning ved rutinemessige kliniske kulturer fra pasienter under sykehusoppholdet, både på covid-19-avdelinger og ikke-COVID-19-avdelinger. Blod, prøver fra nedre luftveier, puss og urin vil være kvalifisert for inkludering i studien. Identifikasjon og antibiotikaresistenstesting av MDRO-ene vil bli utført av Vitek2-systemet. Demografiske data og data om sykehistorie, sykehusdødelighet, liggetid og antibiotikabruk vil bli samlet inn fra medisinske journaler, i henhold til nasjonale forskrifter for medisinsk forskning. Det totale antallet kliniske kulturer og deres resultater vil bli samlet inn for prevalensberegninger (WHOnet).
   2. Siden resultater fra kliniske kulturer bare avslører toppen av MDRO-isfjellet, vil voksne pasienter bli aktivt screenet for MDRO-transport på utskrivningsdagen og 30 dager etter utskrivning fra COVID-19-avdelingen og ikke-COVID-19-avdelingen, etter informert samtykke. Utskrivningsscreening har vært brukt som en tilnærming i tidligere studier, og vist å være nyttig for å oppdage MDRO-overføring på sykehus. Screening ved innleggelse vil også være nyttig, men er ikke mulig på covid-avdelingene på grunn av arbeidsbelastning når en pasient er syk og trenger øyeblikkelig hjelp. 30-dagers screening etter utskrivning er en ny tilnærming som kan avsløre MDRO-er som fortsatt er uoppdagelige (dvs. ved lav belastning) i eller på pasientens kropp i utskrivningsøyeblikket, for eksempel på grunn av antibiotikabruk. Alle voksne pasienter som skrives ut fra disse avdelingene er kvalifisert for inkludering i studien. Pasienter som skrives ut innen 48 timer etter innleggelse og pasienter som enten bor utenfor byen Malang eller adressen deres er uklar, er ekskludert. 30-dagers screening etter utskrivning kan organiseres via det lokale folkehelsesenteret.

   Betraktning av prøvestørrelse:

   Vi forventer å inkludere minst 500 COVID-19-pasienter og 500 ikke-COVID-19-pasienter for MDRO-deteksjon fra klinisk kultur, og minst 120 COVID-19- og 120 ikke-COVID-19-pasienter for aktiv screening.

   Mikrobiologiske metoder:

   Fremre nese og rektale vattpinner vil bli tatt fra hver pasient for utskrivning og screening etter utskrivning med sterile bomullspinner og transportert til laboratoriet i Amies transportmedium for videre behandling innen 24 timer etter prøvetaking. Isolering og identifikasjon av MDRO-er fra vattpinnene vil bli utført som tidligere beskrevet. Bekreftelse av ESBL-produksjon vil bli gjort med kombinasjonsdisktesten, karbapenemaseproduksjon med CIM-testen. Isolater vil bli lagret i duplikat som ble gjort i våre tidligere studier.

2. Analyse av MDRO-overføring Deteksjon av vanlige resistensgener (dvs. mecA, blaNDM etc.) vil bli utført ved polymerasekjedereaksjon. Klonaliteten til MDRO-er vil bli evaluert for de mest utbredte MDRO-ene: ved spa/MLVA-typing (MRSA) og helgenomsekvensering (Gram-negativ MDRO; Illumina/nanopore).
3. Håndhygiene og PPE Den direkte observasjonsmetoden vil bli brukt for å fastslå overholdelsesgraden for håndhygiene og bruk av PPE (hansker, kjoler, masker). Dette vil bli gjort månedlig i løpet av den ettårsperioden som bakterieisolater samles inn.
4. Antibiotikabruksanalyse Kvalitativ evaluering av antibiotikabruk vil bli utført ved Gyssens' algoritme og påfølgende sammenligning av COVID-19 pasienter og ikke-COVID-19 pasienter enten med eller uten MDRO-infeksjon eller kolonisering. Videre vil DDD-verdien til ceftriaxon, gentamicin og ciprofloksacin sammenlignes.