Влияние стационарного лечения Covid-19 на распространенность MDRO в Индонезии

Общая цель исследования — выявить влияние стационарного лечения пациентов с COVID-19 на распространенность MDRO среди пациентов с COVID-19 по сравнению с лечением в стационаре без COVID-19 и распространенность MDRO среди пациентов без COVID-19. пациентов с его основными детерминантами в больницах с ограниченными ресурсами в Индонезии.

Конкретные цели исследования:

1. Измерить распространенность MDRO в отделениях COVID-19 по сравнению с отделениями без COVID-19.
2. Исследовать передачу наиболее распространенного MDRO в отделениях COVID-19 по сравнению с отделениями без COVID-19.
3. Проанализировать соблюдение гигиены рук и использование СИЗ в отделениях COVID-19 по сравнению с отделениями без COVID-19.
4. Проанализировать использование антибиотиков в отделениях COVID-19 по сравнению с отделениями без COVID-19.

Дизайн исследования:

Проспективное обсервационное когортное исследование будет проведено как в отделениях с COVID-19, так и в отделениях без COVID-19 в больницах вторичной и третичной помощи в провинции Восточная Ява в Индонезии. Будут использоваться как отделения интенсивной терапии (ОИТ), так и не отделения интенсивной терапии. Больница третичного уровня в Маланге - это больница доктора Сайфула Анвара на 882 койки. В настоящее время ежемесячно госпитализируют 80 пациентов с COVID-19. Больница вторичной медицинской помощи рассчитана на 250 коек, и каждый месяц сюда поступает около 25 пациентов с COVID-19.

Конкретные цели будут решаться следующим образом:

1. Распространенность МРО

   Будут включены следующие МРО: MRSA, ESBL-продуцирующая Escherichia coli, ESBL-продуцирующая и продуцирующая карбапенемазы K. pneumoniae, резистентная к карбапенемам P. aeruginosa и резистентная к карбапенемам A. baumannii. Они будут искаться и собираться двумя способами:

   1. Обнаружение с помощью обычных клинических культур у пациентов во время их пребывания в больнице, как в отделениях COVID-19, так и в отделениях без COVID-19. Кровь, образцы нижних дыхательных путей, гной и моча могут быть включены в исследование. Идентификация и тестирование чувствительности МЛРО к антибиотикам будет выполняться с помощью системы Vitek2. Демографические данные и данные об истории болезни, госпитальной смертности, продолжительности пребывания и использовании антибиотиков будут собираться из медицинских карт в соответствии с национальными правилами медицинских исследований. Общее количество клинических культур и их результаты будут собраны для расчета распространенности (WHOnet).
   2. Поскольку результаты клинических культур показывают только верхушку айсберга MDRO, взрослые пациенты будут активно обследоваться на носительство MDRO в день выписки и через 30 дней после выписки из отделения COVID-19 и отделения без COVID-19, после информированное согласие. Скрининг при выписке использовался в качестве подхода в предыдущих исследованиях, и было показано, что он полезен для выявления передачи MDRO в больнице. Скрининг при поступлении также был бы полезен, но невозможен в отделениях COVID из-за рабочей нагрузки, когда пациент болен и нуждается в неотложной помощи. 30-дневный скрининг после выписки — это новый подход, который может выявить МЛРО, которые все еще не обнаруживаются (т. Все взрослые пациенты, выписанные из этих отделений, имеют право на включение в исследование. Однако пациенты, выписанные в течение 48 часов после поступления, и пациенты, которые либо проживают за пределами города Маланг, либо их адрес неясен, исключаются. 30-дневный скрининг после выписки можно организовать через местный центр общественного здравоохранения.

   Рассмотрение размера выборки:

   Мы ожидаем включить не менее 500 пациентов с COVID-19 и 500 пациентов без COVID-19 для выявления MDRO из клинической культуры и не менее 120 пациентов с COVID-19 и 120 пациентов без COVID-19 для активного скрининга.

   Микробиологические методы:

   У каждого пациента будут взяты мазки из носовых ходов и ректальные мазки для выписки и скрининга после выписки с использованием стерильных ватных тампонов и доставлены в лабораторию в транспортной среде Эмиса для дальнейшей обработки в течение 24 часов после взятия проб. Изоляция и идентификация MDRO из мазков будут выполняться, как описано ранее. Подтверждение продукции ESBL будет сделано с помощью комбинированного теста диска, продукции карбапенемазы с тестом CIM. Изоляты будут храниться в двух экземплярах, как это делалось в наших предыдущих исследованиях.

2. Анализ передачи MDRO Обнаружение общих генов устойчивости (т.е. mecA, blaNDM и т. д.) будет проводиться с помощью полимеразной цепной реакции. Клональность MDRO будет оцениваться для наиболее распространенных MDRO: с помощью spa/MLVA-типирования (MRSA) и полногеномного секвенирования (грамотрицательные MDRO; Illumina/nanopore).
3. Гигиена рук и СИЗ Метод прямого наблюдения будет применяться для определения уровня соблюдения гигиены рук и использования СИЗ (перчатки, халаты, маски). Это будет делаться ежемесячно в течение одного года сбора бактериальных изолятов.
4. Анализ использования антибиотиков Качественная оценка использования антибиотиков будет проводиться с помощью алгоритма Гиссенса и последующего сравнения пациентов с COVID-19 и пациентов без COVID-19 с инфекцией или колонизацией MDRO или без них. Кроме того, будут сравниваться значения DDD цефтриаксона, гентамицина и ципрофлоксацина.