Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Mapowanie chemicznej i mikrobiologicznej heterogeniczności w eksplantowanych próbkach płuc chorych na mukowiscydozę

9 sierpnia 2023 zaktualizowane przez: University of Minnesota

Istnieje wiele dowodów sugerujących, że płuca nie są jednolite. Powierzchnia wewnętrzna jest 30 razy większa niż skóra, a różne oskrzeliki/oskrzela/pęcherzyki różnią się znacznie pod względem perfuzji krwi, temperatury, ciśnienia tlenu i pH. Ponadto, szczególnie w kontekście chorób układu oddechowego, zauważalne różnice występują w strukturze komórek nabłonka, rzęskach, wytwarzaniu śluzu i reakcjach zapalnych/odpornościowych. Wiadomo, że wszystkie te czynniki wpływają na fizjologię bakterii, jednak bardzo mało wiadomo, w jaki sposób wpływają one na a) obecność/nieobecność określonych gatunków bakterii w drogach oddechowych lub b) procesy metaboliczne stosowane przez te bakterie w środowisko żywiciela człowieka. Lepsze zrozumienie zależności między gradientami środowiskowymi (chemicznymi) w płucach chorych pacjentów (szczególnie tych z mukowiscydozą) a obecnymi społecznościami drobnoustrojów może prowadzić do nowych hipotez dotyczących manipulacji środowiskiem oddechowym w celu uzyskania korzyści terapeutycznych. Aby dokładniej to zbadać, badacze proponują wykorzystanie próbek płuc pobranych od pacjentów z mukowiscydozą w celu przetestowania następującej hipotezy:

Hipoteza: U pacjentów z mukowiscydozą skład społeczności bakteryjnej, metabolizm i chemia środowiska będą się różnić w zależności od ich przestrzennego położenia w drogach oddechowych.

Przegląd badań

Status

Rekrutacyjny

Warunki

Szczegółowy opis

Aby zbadać to bardziej szczegółowo, badacze proponują zbadanie eksplantowanej tkanki pacjentów z mukowiscydozą, którzy mają przejść operację przeszczepu pojedynczego lub podwójnego płuca jako strategię terapeutyczną choroby w późnym stadium. Populacja ta będzie ograniczona do kliniki dorosłych pacjentów z mukowiscydozą, ponieważ pacjenci pediatryczni rzadko są kandydatami do przeszczepu płuc. Klinika CF dla dorosłych wykonuje ponad 20 operacji rocznie, a usuwana tkanka jest zazwyczaj odrzucana. Korzystając z tej tkanki, badacze proponują następujące cele:

  1. Użyj niezależnego od kultury sekwencjonowania 16S, aby scharakteryzować przestrzenne rozmieszczenie patogenów bakteryjnych w płucach pacjentów z mukowiscydozą. Płuca zostaną podzielone na 5 oddzielnych płatów, a materiał śluzowy zostanie zebrany, zhomogenizowany i przetworzony w celu identyfikacji gatunków bakterii.
  2. Przeprowadź szczegółową analizę specyficznej ekspresji genów w drogach oddechowych, która posłuży jako wskaźnik zastępczy panujących tam warunków środowiskowych. Wykorzystując to samo podejście w Celu 1, bakteryjny mRNA zostanie wyekstrahowany przy użyciu ustalonych procedur. Podzbiór genów specyficznych dla środowiska zostanie wykryty, aby zapewnić odczyt metabolizmu bakterii w środowisku płuc CF.
  3. Użyj obrazowania hybrydyzacji in situ do wizualizacji przestrzennego rozmieszczenia określonych bakterii i ich profili ekspresji genów (na podstawie danych wygenerowanych w celach 1 i 2). Bakterie i kandydaci na geny zidentyfikowani/badani w Celach 1 i Celach 2 zostaną następnie poddani analizie przy użyciu obrazowania hybrydyzacji in situ. Tkanka zostanie przetworzona za pomocą mikrotomii, a sondy fluorescencyjne zostaną zastosowane do zobrazowania przestrzennego rozmieszczenia określonych gatunków bakterii i ich metabolizmu w drogach oddechowych.

Informacje zebrane w ramach tych trzech celów zostaną następnie połączone z danymi pacjenta (wiek, genotyp, wcześniejsze leczenie, dane z mikrobiologii klinicznej) w celu wygenerowania lepszych modeli roboczych późnego stadium choroby u pacjentów z mukowiscydozą.

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Szacowany)

20

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Kontakt w sprawie studiów

  • Nazwa: Ryan C Hunter, PhD
  • Numer telefonu: 612-625-1402
  • E-mail: rchunter@umn.edu

Kopia zapasowa kontaktu do badania

  • Nazwa: Jordan Dunitz, MD
  • Numer telefonu: 612-624-0999
  • E-mail: dunit001@umn.edu

Lokalizacje studiów

  • Stany Zjednoczone
    • Minnesota
      • Minneapolis, Minnesota, Stany Zjednoczone, 55455
        • Rekrutacyjny
        • University of Minnesota Medical School
        • Kontakt:
        • Główny śledczy:
          • Ryan C Hunter, PhD

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

18 lat i starsze (Dorosły, Starszy dorosły)

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie

Metoda próbkowania

Próbka bez prawdopodobieństwa

Badana populacja

Pacjenci będą obejmować osoby przechodzące pojedynczy lub podwójny przeszczep płuc w ramach normalnie zaplanowanej terapii choroby mukowiscydozy.

Opis

Kryteria przyjęcia:

  • diagnostyka mukowiscydozy
  • kwalifikuje się do przeszczepu płuc
  • wyczerpał inne dostępne terapie bez powodzenia
  • świadoma zgoda

Kryteria wyłączenia:

  • nie ma kryteriów wykluczenia

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Skład zbiorowisk bakteryjnych w eksplantowanym płucu
Ramy czasowe: Całe badanie (3 lata)
Niezależne od kultury sekwencjonowanie 16S zostanie wykorzystane do scharakteryzowania przestrzennego rozmieszczenia patogenów bakteryjnych w płucach pacjentów z mukowiscydozą. Eksplantowane próbki płuc zostaną podzielone na 5 oddzielnych płatów, a materiał śluzu zostanie zebrany, zhomogenizowany i przetworzony w celu identyfikacji gatunków bakterii.
Całe badanie (3 lata)

Miary wyników drugorzędnych

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Poziomy ekspresji genów bakteryjnych
Ramy czasowe: Całe badanie (3 lata).
Analiza ekspresji genów zostanie wykorzystana do badania fizjologii bakterii w eksplantowanych płucach i posłuży jako przybliżenie panujących tam warunków środowiskowych. Stosując to samo podejście, co w wyniku 1, bakteryjny mRNA zostanie wyekstrahowany przy użyciu ustalonych procedur. Podzbiór genów specyficznych dla środowiska zostanie wykryty, aby zapewnić odczyt metabolizmu bakterii w środowisku płuc CF.
Całe badanie (3 lata).

Inne miary wyników

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Dystrybucja ekspresji genów bakteryjnych
Ramy czasowe: Całe badanie (3 lata)
Bakterie i kandydaci na ich geny zidentyfikowani w wynikach 1 i 2 zostaną następnie poddani analizie przy użyciu obrazowania in situ. Tkanka zostanie poddana obróbce za pomocą mikrotomii, a sondy fluorescencyjne zostaną zastosowane do zobrazowania przestrzennego rozmieszczenia określonych gatunków bakterii i ich metabolizmu w drogach oddechowych.
Całe badanie (3 lata)

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Sponsor

University of Minnesota

Współpracownicy

National Heart, Lung, and Blood Institute (NHLBI)

Śledczy

  • Główny śledczy: Ryan C Hunter, PhD, University of Minnesota Medical School (Microbiology)

Publikacje i pomocne linki

Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.

Publikacje ogólne

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów

1 lipca 2014

Zakończenie podstawowe (Szacowany)

1 lipca 2025

Ukończenie studiów (Szacowany)

1 lipca 2025

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

25 kwietnia 2014

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

29 kwietnia 2014

Pierwszy wysłany (Szacowany)

1 maja 2014

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)

14 sierpnia 2023

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

9 sierpnia 2023

Ostatnia weryfikacja

1 sierpnia 2023

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Słowa kluczowe

Dodatkowe istotne warunki MeSH

Inne numery identyfikacyjne badania

  • PACCS-2018-27376
  • 4R00HL114862-02 (Grant/umowa NIH USA)

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Badania kliniczne na Mukowiscydoza

Wyszukaj podobne próby

Sponsorzy i współpracownicy

Warunki medyczne

Interwencje lekowe

CROs by country

CROs in Austria

Warunki

Rzadkie choroby

Interwencje lekowe

Suplementy diety

Sponsor / Współpracownicy

Lokalizacje

3
Subskrybuj