Biomarcadores na previsão da resposta ao tratamento em pacientes com câncer de cabeça e pescoço recentemente diagnosticado em estágio III ou estágio IV, tratados com carboplatina, paclitaxel e radioterapia

OBJETIVOS:

• Determinar se os padrões de expressão gênica que se correlacionam com a resposta ao tratamento e a sobrevida podem ser identificados usando microarranjos de DNA em pacientes com carcinoma espinocelular de cabeça e pescoço recém-diagnosticado (HNSCC) tratados com carboplatina, paclitaxel e radioterapia.
• Determine se os padrões de expressão de proteínas que se correlacionam com a resposta ao tratamento e a sobrevivência em HNSCC podem ser identificados usando espectrometria de massa de ionização por dessorção a laser assistida por matriz (MALDI-TOFMS).
• Determinar se a assinatura molecular da infecção pelo vírus do papiloma humano-16 pode ser determinada usando DNA microarray e MALDI-TOFMS e correlacionar com a expressão de genes e proteínas, resposta ao tratamento e sobrevivência.

ESBOÇO: Amostras de tecido tumoral são analisadas por análise de DNA microarray e validadas por reação em cadeia da polimerase de transcrição reversa quantitativa (PCR). Os padrões de expressão de proteínas e genes são analisados ​​por espectrometria de massa com ionização por dessorção a laser, tempo de voo, cromatografia líquida de alta eficiência, cromatografia líquida-espectrometria de massa em tandem e PCR. As amostras também são analisadas por microarray de tecido e imuno-histoquímica.