Biomarcadores para predecir la respuesta al tratamiento en pacientes con cáncer de cabeza y cuello en estadio III o estadio IV recién diagnosticado tratados con carboplatino, paclitaxel y radioterapia

OBJETIVOS:

• Determinar si los patrones de expresión génica que se correlacionan con la respuesta al tratamiento y la supervivencia pueden identificarse mediante micromatrices de ADN en pacientes con carcinoma de células escamosas de cabeza y cuello (HNSCC) recién diagnosticado tratados con carboplatino, paclitaxel y radioterapia.
• Determinar si los patrones de expresión de proteínas que se correlacionan con la respuesta al tratamiento y la supervivencia en HNSCC se pueden identificar mediante espectrometría de masas de tiempo de vuelo de ionización de desorción láser asistida por matriz (MALDI-TOFMS).
• Determinar si la firma molecular de la infección por el virus del papiloma humano 16 puede determinarse mediante microarrays de ADN y MALDI-TOFMS y correlacionarse con la expresión génica y proteica, la respuesta al tratamiento y la supervivencia.

ESQUEMA: Las muestras de tejido tumoral se analizan mediante análisis de micromatrices de ADN y se validan mediante reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (PCR) cuantitativa. Los patrones de expresión de proteínas y genes se analizan mediante espectrometría de masas de tiempo de vuelo de ionización por desorción láser, cromatografía líquida de alta resolución, cromatografía líquida-espectrometría de masas en tándem y PCR. Las muestras también se analizan mediante micromatrices de tejidos e inmunohistoquímica.