O estudo individualizado da estratégia de tratamento de TB resistente a medicamentos M(X) (InDEX)

Quando a resistência a medicamentos é detectada por métodos moleculares, como o ensaio Xpert MTB/RIF, o tratamento de segunda linha para tuberculose multirresistente a medicamentos (MDR) é iniciado na ausência completa de informações detalhadas sobre resistência. O diagnóstico de Tuberculose Multirresistente a Drogas é confirmado apenas com base na disponibilidade dos resultados do Ensaio de Sonda de Linha (LPA)/Teste de Suscetibilidade a Drogas (DST). A Tuberculose Extremamente Resistente a Drogas (XDR) é diagnosticada pela resistência fenotípica in vitro à Rifampicina, Isoniazida, fluoroquinolonas e drogas injetáveis ​​de segunda linha (isto é, amicacina, canamicina ou capreomicina). O Teste de Suscetibilidade a Drogas baseado em cultura existente fornece resultados após 6-8 semanas. Essa duração pode ser aumentada ainda mais por outros desafios laboratoriais existentes, como a contaminação da cultura.

Além disso, os regimes iniciais geralmente não são ideais e, às vezes, completamente ineficazes, pois há falta de testes de suscetibilidade a medicamentos para apoiá-los. Mais importante, até mesmo regimes ideais são alterados devido à intolerância do paciente aos efeitos colaterais da droga.

O sequenciamento completo do genoma (WGS) tem a vantagem de determinar a sequência completa do ácido desoxirribonucleico (DNA) do genoma de um organismo em um único ponto no tempo. Usando esta tecnologia, as mutações genotípicas que conferem resistência aos medicamentos antituberculose podem ser identificadas. Essas informações ajudarão a identificar não apenas drogas potencialmente resistentes, mas também drogas suscetíveis e, assim, permitir uma escolha mais precisa e adequada do regime. Além disso, medicamentos que não agregam valor ao resultado do tratamento, mas aumentam as taxas de reações adversas a medicamentos, podem ser eliminados mais cedo, melhorando os resultados do tratamento de TB resistente a medicamentos.

Nesta proposta, pretendemos usar o sequenciamento completo do genoma de Mycobacterium Tuberculosis (MTB) antes da seleção de um regime de tratamento para tuberculose resistente a medicamentos e, assim, fornecer uma estratégia de tratamento individualizada para tuberculose resistente a medicamentos. Ao adotar este método, esperamos melhorar as taxas de sobrevivência de cultura negativa em 6 meses após o início do tratamento.

Este estudo incluirá 448 pacientes adultos (idade ≥ 18 anos) que atendem aos critérios de inclusão. Pacientes encaminhados por instalações satélite provinciais com confirmação microbiológica de tuberculose resistente a medicamentos (por exemplo, Xpert MTB/RIF assay / Line Probe Assay) para King DinuZulu Hospital (KDH). Os pacientes randomizados para o braço de controle receberão tratamento padrão (SOC). Os pacientes randomizados para o braço de intervenção receberão um regime de tratamento individualizado com base no sequenciamento do genoma completo conduzido em amostras de escarro positivas de tubo indicador de crescimento de micobactérias (MGIT) coletadas na visita de triagem.