Étude sur la stratégie de traitement individualisé de la tuberculose pharmacorésistante M(X) (InDEX)

Lorsque la résistance aux médicaments est détectée par des méthodes moléculaires telles que le test Xpert MTB/RIF, le traitement de deuxième intention de la tuberculose multirésistante (MDR) est démarré en l'absence totale d'informations détaillées sur la résistance. Le diagnostic de tuberculose multirésistante aux médicaments n'est confirmé que sur la disponibilité des résultats du test de la sonde en ligne (LPA) / du test de sensibilité aux médicaments (DST). La tuberculose extrêmement résistante aux médicaments (XDR) est diagnostiquée par une résistance phénotypique in vitro à la rifampicine, à l'isoniazide, aux fluoroquinolones et aux médicaments injectables de deuxième ligne (c'est-à-dire l'amikacine, la kanamycine ou la capréomycine). Les tests de sensibilité aux médicaments existants basés sur la culture fournissent des résultats après 6 à 8 semaines. Cette durée peut être encore augmentée par d'autres défis de laboratoire existants, tels que la contamination de la culture.

De plus, les schémas thérapeutiques initiaux ne sont souvent pas optimaux et parfois complètement inefficaces car il y a un manque de tests de sensibilité aux médicaments pour les soutenir. Plus important encore, même les schémas thérapeutiques optimaux sont modifiés en raison de l'intolérance du patient aux effets secondaires du médicament.

Le séquençage du génome entier (WGS) a l'avantage de déterminer la séquence complète d'acide désoxyribonucléique (ADN) du génome d'un organisme en un seul instant. Grâce à cette technologie, des mutations génotypiques conférant une résistance aux médicaments antituberculeux peuvent être identifiées. Ces informations aideront à identifier non seulement les médicaments potentiellement résistants, mais également les médicaments sensibles et permettront ainsi un choix plus précis et approprié du schéma thérapeutique. En outre, les médicaments qui n'ajouteront pas de valeur au résultat du traitement, mais augmenteront les taux de réactions indésirables aux médicaments, peuvent être éliminés plus tôt, améliorant ainsi les résultats du traitement de la tuberculose pharmacorésistante.

Dans cette proposition, nous visons à utiliser le séquençage du génome entier de Mycobacterium Tuberculosis (MTB) avant la sélection d'un régime de traitement de la tuberculose résistante aux médicaments et ainsi fournir une stratégie de traitement individualisée pour la tuberculose résistante aux médicaments. En adoptant cette méthode, nous espérons améliorer les taux de survie négatifs à la culture à 6 mois après le début du traitement.

Cette étude inclura 448 patients adultes (âge ≥ 18 ans) répondant aux critères d'inclusion. Patients référés par des établissements satellites provinciaux avec confirmation microbiologique de tuberculose pharmacorésistante (p. Xpert MTB/RIF assay / Line Probe Assay) au King DinuZulu Hospital (KDH) seront recrutés. Les patients randomisés dans le groupe témoin recevront un traitement standard de soins (SOC). Les patients randomisés dans le bras d'intervention recevront un schéma thérapeutique individualisé basé sur le séquençage du génome entier effectué sur des échantillons d'expectorations positifs du tube indicateur de croissance des mycobactéries (MGIT) collectés lors de la visite de dépistage.