Lo studio sulla strategia di trattamento della tubercolosi resistente ai farmaci individualizzato M (X). (InDEX)

Quando la resistenza ai farmaci viene rilevata mediante metodi molecolari come il test Xpert MTB/RIF, il trattamento della tubercolosi multiresistente ai farmaci (MDR) di seconda linea viene avviato in completa assenza di informazioni dettagliate sulla resistenza. La diagnosi di tubercolosi multiresistente ai farmaci è confermata solo in base alla disponibilità dei risultati del Line Probe Assay (LPA)/Drug Susceptibility Testing (DST). La tubercolosi estremamente resistente ai farmaci (XDR) viene diagnosticata mediante resistenza fenotipica in vitro a rifampicina, isoniazide, fluorochinoloni e farmaci iniettabili di seconda linea (ad es. amikacina, kanamicina o capreomicina). I test di sensibilità ai farmaci basati sulla coltura esistenti forniscono risultati dopo 6-8 settimane. Questa durata può essere ulteriormente aumentata da altre sfide di laboratorio esistenti, come la contaminazione della cultura.

Inoltre, i regimi iniziali spesso non sono ottimali e talvolta completamente inefficaci in quanto mancano test di sensibilità ai farmaci che li supportino. Ancora più importante, anche i regimi ottimali vengono modificati a causa dell'intolleranza del paziente agli effetti collaterali del farmaco.

Il sequenziamento dell'intero genoma (WGS) ha il vantaggio di determinare la sequenza completa dell'acido desossiribonucleico (DNA) del genoma di un organismo in un singolo momento. Utilizzando questa tecnologia, è possibile identificare le mutazioni genotipiche che conferiscono resistenza ai farmaci antitubercolari. Queste informazioni aiuteranno a identificare non solo potenziali farmaci resistenti, ma anche farmaci suscettibili e quindi consentire una scelta più accurata e appropriata del regime. Inoltre, i farmaci che non aggiungeranno valore al risultato del trattamento, ma aumenteranno i tassi di reazioni avverse al farmaco, possono essere eliminati prima, migliorando i risultati del trattamento della tubercolosi resistente ai farmaci.

In questa proposta, miriamo a utilizzare il sequenziamento dell'intero genoma del Mycobacterium Tuberculosis (MTB) prima della selezione di un regime di trattamento della tubercolosi resistente ai farmaci e quindi fornire una strategia di trattamento individualizzata per la tubercolosi resistente ai farmaci. Adottando questo metodo, speriamo di migliorare i tassi di sopravvivenza negativi alla coltura a 6 mesi dall'inizio del trattamento .

Questo studio includerà 448 pazienti adulti (età ≥ 18 anni) che soddisfano i criteri di inclusione. Pazienti indirizzati da strutture satellite provinciali con conferma microbiologica di tubercolosi farmacoresistente (es. Xpert MTB/RIF assay / Line Probe Assay) al King DinuZulu Hospital (KDH). I pazienti randomizzati al braccio di controllo riceveranno un trattamento standard di cura (SOC). Ai pazienti randomizzati al braccio di intervento verrà somministrato un regime di trattamento individualizzato basato sul sequenziamento dell'intero genoma condotto su campioni di espettorato positivi della provetta con indicatore di crescita dei micobatteri (MGIT) raccolti durante la visita di screening.