Анализ экспозиции вирусных инфекций, предшествующих диагностике сахарного диабета 1 типа (СД1) у детей когорты Изис-Диаб. Поиск объяснений раннего начала заболевания (ISIS-VIRUS)

«Гигиеническая гипотеза», которая была предложена для объяснения наблюдаемого роста заболеваемости СД1, основана на экспериментальных данных, полученных на моделях мышей. Однако эпидемиологических данных для подтверждения этой гипотезы у человека все еще недостаточно. Это очень важно, потому что, в отличие от гигиенической гипотезы, есть много причин полагать, что, наоборот, определенный вирус может вызвать заболевание.

Генетическая предрасположенность к тяжелой форме инфекции (особенно первичной инфекции) была продемонстрирована для нескольких инфекционных заболеваний (Casanova JL, Science 317:617-619, 2007; Casanova JL, EMBO J 26:915-922, 2007). Обычно это соответствует дефициту генов, участвующих в иммунном ответе хозяина, передача которого является менделевской. Генетические факторы влияют на способность энтеровирусов и других вирусов повреждать бета-клетки и вызывать диабет. Недавно Неженцев и др. продемонстрировали связь между энтеровирусами и генами диабета: они действительно идентифицировали 4 редких полиморфизма IFIH1, которые снижают риск развития СД1. Однако этот ген кодирует фермент, распознающий ДНК энтеровируса, вызывая активацию иммунитета; мутации подавляют активацию генов. За исключением одного исследования ВИЧ-1, насколько нам известно, нет полногеномных ассоциативных исследований (GWAS) у людей, посвященных роли генетических полиморфизмов хозяина в риске заражения, клинической экспрессии, продолжительности выделения вируса или ответе на терапию или на лечение. противовирусные вакцины.

Мы полагались на нашу когорту детей с СД1 (Изис-Диаб), чтобы исследовать возможную связь между вирусным воздействием, генетическими полиморфизмами и последующим СД1.

Поиск вирусных факторов, ответственных за повышенную распространенность СД1 у детей младшего возраста, трудновыполним. Отсутствие или дефицит инфекций трудно надежно оценить на индивидуальном уровне. Анализ образцов пищеварительного тракта, ЛОР-органов или крови при поиске самих вирусов может быть сделан только при диагностике СД1 и, следовательно, вряд ли будет положительным через несколько лет после возбудителя инфекции. Невозможно ретроспективно воссоздать вирусные события, которым человек подвергся в период между рождением и датой постановки диагноза диабета. Вот почему наш проект предлагает использовать показатель вирусных инфекций, перенесенных ребенком, для количественной оценки вирусных воздействий, которым он подвергался до постановки диагноза СД1. Мы сосредоточились на вирусных инфекциях в раннем детстве, которые могут влиять на ранние формы СД1. Мы объединяем 2 источника данных:

• Геолокация адреса ребенка найдет места, где он живет. Пространственно-временные данные Sentinel Network, собираемые с 1984 года, обеспечат доступ к следующим вирусным воздействиям: сезонный грипп, вирусная диарея (в основном энтеровирусная), эпидемический паротит, корь, ветряная оспа. Если недостаток нашего подхода в том, что он не видит реальных вирусных инфекций, пережитых детьми, а только уровень воздействия, которому они подвергались по своему адресу, то преимуществом является объективное пространственно-временное описание вирусных эпидемий вокруг детей, что делает более или менее вероятным их заражение. Такие данные Sentinel есть только у Франции.
• Прививки (в т.ч. MMR) и информация об инфекционном прошлом детей будут собираться из данных, зарегистрированных в его книге здоровья. Мы сосредоточимся на беременности матери и ребенке в возрасте от рождения до 2 лет.

Данные об окружающей среде из этих двух источников будут сопоставлены с уже имеющимися генетическими данными GWAS для выявления ассоциаций ген-вирус, потенциально определяющих возраст начала СД1. Этот анализ «высокой размерности» будет решаться с помощью программ «машинного обучения».

В случае выявления предотвратимых рисков можно было бы подумать о разработке клинических исследований для профилактики выявленных форм СД1.