Tyypin 1 diabeteksen (T1D) diagnostiikkaa edeltäneiden virusinfektioiden analyysi Isis-Diab-kohortin lapsilla. Etsi selityksiä taudin varhaisesta alkamisesta (ISIS-VIRUS)

"Hygieniahypoteesi", jonka on ehdotettu selittämään havaittua T1D:n esiintyvyyden lisääntymistä, perustuu hiirimalleilla saatuihin kokeellisiin todisteisiin. Epidemiologiset tiedot eivät kuitenkaan vieläkään ole vahvistaneet tätä hypoteesia ihmisillä. Tämä on kriittistä, koska - vastoin hygieniahypoteesia - on monia syitä uskoa, että päinvastoin, tietty virus voi laukaista taudin.

Geneettinen taipumus vakavaan infektiomuotoon (erityisesti primaariseen infektioon) osoitettiin useiden tartuntatautien yhteydessä (Casanova JL, Science 317:617-619, 2007; Casanova JL, EMBO J 26:915-922, 2007). Se vastaa yleensä puutteita geeneissä, jotka osallistuvat isännän immuunivasteeseen, jonka leviäminen on mendeliläistä. Geneettiset tekijät vaikuttavat enterovirusten ja muiden virusten kykyyn vahingoittaa beetasoluja ja aiheuttaa diabetesta. Äskettäin Nejentsev et al ovat osoittaneet yhteyden enterovirusten ja diabetesgeenien välillä: he ovat todellakin tunnistaneet 4 harvinaista IFIH1-polymorfismia, jotka vähentävät T1D-riskiä. Tämä geeni kuitenkin koodaa entsyymiä, joka tunnistaa DNA-enteroviruksen, mikä aiheuttaa immuniteetin aktivoitumisen; mutaatiot estävät geenien aktivoitumista. Yhtä HIV-1-tutkimusta lukuun ottamatta tiedossamme ei ole ihmisillä tehtyjä genomin laajuisia assosiaatiotutkimuksia (GWAS) isännän geneettisten polymorfismien roolista infektioriskissä, kliinisen ilmentymisen, viruksen leviämisen keston tai hoitovasteen tai virusten vastaiset rokotteet.

Luotimme T1D-lapsiryhmäämme (Isis-Diab) tutkiaksemme mahdollista yhteyttä virusaltistuksen, geneettisten polymorfismien ja myöhemmän T1D:n välillä.

Nuorten lasten lisääntyneeseen T1D:n levinneisyyteen vaikuttavien virustekijöiden etsintä on vaikea toteuttaa. Infektioiden puuttumista tai vähäisyyttä on vaikea arvioida tarkasti yksilötasolla. Ruoansulatuskanavan, ENT- tai verinäytteiden analyysi virusten etsimisessä voidaan tehdä vain T1D-diagnoosin yhteydessä, ja siksi on epätodennäköistä, että se olisi positiivinen useita vuosia syy-infektion jälkeen. Ei ole mahdollista rekonstruoida takautuvasti virustapahtumia, joille henkilö on altistunut syntymän ja diabeteksen diagnoosin välisenä aikana. Tästä syystä projektimme ehdottaa, että käytetään lapsen risteyttämien virusinfektioiden välityspalvelinta, joka määrittää hänen virusaltistuksensa ennen T1D-diagnoosia. Keskityimme varhaislapsuuden virusinfektioihin, jotka voivat häiritä T1D:n varhaisia ​​muotoja. Yhdistämme 2 tietolähdettä:

• Lapsen osoitteen maantieteellinen sijainti paikantaa paikat, joissa hän asuu. Sentinel Networkin vuodelta 1984 kerätyt spatio-temporaaliset tiedot tarjoavat pääsyn seuraaviin virusaltistumiseen: kausi-influenssa, virusripuli (enimmäkseen enterovirus), sikotauti, tuhkarokko, vesirokko. Jos lähestymistapamme puute on se, että se ei näe todellisia lasten kokemia virusinfektioita, vaan vain sen altistumisen tason, jolle he olivat altistuneet osoitteensa mukaan, etuna on objektiivinen spatiaalinen ja ajallinen kuvaus lapsia ympäröivistä virusepidemioista, mikä tekee niistä enemmän tai vähemmän todennäköisen tartunnan. Vain Ranskalla on tällaisia ​​Sentinel-tietoja.
• Rokotukset (mukaan lukien MMR) ja tiedot lasten tarttuvasta menneisyydestä kerätään hänen terveyskirjansa tiedoista. Keskitymme äidin raskauteen ja lapseen syntymän ja 2 vuoden iän välillä.

Näistä kahdesta lähteestä peräisin olevat ympäristötiedot risteytetään GWAS:n jo saatavilla olevien geneettisten tietojen kanssa, jotta voidaan tunnistaa geeni-virusyhdistykset, jotka voivat määrittää T1D:n puhkeamisen iän. Tätä "korkean ulottuvuuden" analyysiä käsitellään "koneoppimisohjelmilla".

Jos vältettävissä olevia riskejä tunnistetaan, voidaan harkita kliinisten kokeiden suunnittelua tunnistettujen T1D-muotojen ehkäisemiseksi.