Сравнение мутационного статуса KRAS/BRAF с обычными методами и анализом образцов плазмы (KPLEX2)

Качественный и количественный анализ генетических изменений с помощью эффективного, простого и экономичного теста из образцов крови может оптимизировать принятие терапевтических решений и персонализированное лечение рака. Уровни внеклеточной ДНК (ccfDNA) в плазме больных КРР значительно выше, чем у здоровых пациентов. Эти уровни прогрессивно снижаются у пациентов без опухоли в течение периода наблюдения и повышаются у пациентов с рецидивом или метастазированием. Таким образом, в ближайшем будущем обнаружение циркулирующей ДНК (ccfDNA) может стать технологическим прорывом в диагностике, прогнозировании, обнаружении роста опухоли и последующем наблюдении за онкологическими больными.

Мы разработали усовершенствованный и инновационный метод, который позволяет одновременно определять три параметра: специфическое количественное определение ccfDNA, полученной из опухоли, индекс фрагментации ccfDNA и SNP (однонуклеотидный полиморфизм) или обнаружение точечной мутации. В дополнение к своей беспрецедентной чувствительности и специфичности, этот метод, основанный на количественной ПЦР (названный IntPlex®), недавно запатентованный CNRS, является простым и быстрым и является первым мультиплексным тестом для ccfDNA.

Оценка и валидация теста IntPlex® были рассмотрены в связи с острой необходимостью определить мутационный статус KRAS/BRAF перед терапией против EGFR у пациентов с КРР. Как следствие, метод был адаптирован для обнаружения шести более частых мутаций KRAS при CRC (G12D, G12V, G13D, G12S, G12C, G12A) и BRAF V600E. Затем мы провели первое слепое проспективное исследование для сравнения данных о мутационном статусе KRAS и BRAF, полученных при анализе опухолевой ткани стандартными методами и ДНК плазмы с использованием нашего оригинального метода (устное сообщение ASCO). Мутационный статус был определен обоими методами в 70 образцах пациентов. Наши результаты впервые ясно показали, что анализ ccfDNA на мутацию KRAS может выгодно заменить анализ срезов опухоли. Анализ CcfDNA показал 100% специфичность и чувствительность к мутации BRAF V600E. Для шести протестированных точечных мутаций KRAS метод показал 100% специфичность и 87% чувствительность при значении соответствия 96%.

Целью этого многоцентрового проспективного исследования является проверка и, в конечном счете, внедрение в рутинную клиническую практику использования анализа плазменной ДНК для определения статуса мутации KRAS у пациентов с мКРР.