Белки, связанные с вирионами ВГС
Белки человека, связанные с частицами вируса гепатита С: идентификация в клинических образцах и влияние на жизненный цикл вируса
Появление гепатоцеллюлярной карциномы (ГЦК) побудило к поиску полного понимания биологии одного из ее основных возбудителей, вируса гепатита С (ВГС). Частицы HCV приобретают путем почкования и инкапсуляции клеточных белков. По некоторым видам вирусов появляется все больше свидетельств того, что связанные с вирионами белки склонны участвовать либо на стадиях репликации, отпочкования/выхода, либо на стадиях входа/высвобождения вирусного цикла.
Идентификация таких мишеней может дать идеальных кандидатов для понимания зависимости HCV от ограниченного подмножества белков-хозяев, таким образом предоставляя уточненные наборы генетически стабильных мишеней для терапии. Целью этого проекта является создание адекватных условий для надежной и воспроизводимой очистки вирионов ВГС в клинических образцах с последующей идентификацией их белков-хозяев, связанных с ВГС, и характеристикой их функций. Протеомное профилирование частиц ВГС, выделенных из клинических образцов, будет наложено на белки, идентифицированные и охарактеризованные в частицах ВГС, выращенных в клеточной культуре, во время моей постдокторской подготовки с использованием критериев степени обнаружения клинических биомаркеров. Мишени, идентифицированные в обоих наборах образцов, будут подвергнуты исследованиям in vitro с использованием реплицирующихся клеток ВГС. Обычные биохимические методы и методы визуализации будут использоваться для того, чтобы: (i) установить их физическую связь с вирионами ВГС; (ii) определить модальности их взаимодействия с белками HCV; (iii) расшифровать топологию и субклеточную локализацию их ассоциации с белками и вирионами HCV; (iv) количественно оценить их функциональное участие в почковании, выходе или секреции частиц и инфекционности. Кандидат, который дал удовлетворительные результаты в этих экспериментах, будет раскрыт и дополнительно исследован на уровне структурной биологии в рамках совместных исследовательских программ.
Обзор исследования
Тип исследования
Регистрация (Действительный)
Фаза
- Непригодный
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
-
Lyon, Франция, 69004
- Service d'Hépato-Gastroentérologie Lyon Croix-Rousse Hospices Civils de Lyon
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Описание
Критерии включения:
- Взрослые> 18 и <60 лет
- Инфицированы ВГС генотипа 1. Положительный результат на антитела к ВГС.
- положительная виремия более 6 мес.
- Виремия > 106 МЕ/мл.
- отсутствие ответа на предыдущее лечение и отсутствие противовирусного лечения в течение 2 месяцев.
- Для контрольных образцов: пациенты, ответившие на предыдущее лечение и не получавшие противовирусного лечения в течение 2 месяцев.
Критерий исключения:
- Пациент, получающий или получивший противовирусное лечение в течение двух месяцев.
- пациент с противопоказанием для забора крови 150 мл
- пациент на иммуносупрессивной терапии
- Пациент с заболеванием печени, отличным от гепатита С.
- Больные циррозом печени.
- больной гепатоцеллюлярной карциномой.
- Пациенты с одним или несколькими тяжелыми сопутствующими заболеваниями, определяемыми как:
- Коинфекция ВИЧ или ВГВ.
- гематологические злокачественные изменения или аплазия
- Инсулинозависимый диабет
- диализная хроническая почечная недостаточность
- Сердечная недостаточность
- Лица, подлежащие правовой защите или в отношении которых применяется защитная мера правосудия, не связанные со схемой социального обеспечения или не являющиеся бенефициарами такой системы
- Беременные женщины
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Основная цель: Фундаментальная наука
- Распределение: Нерандомизированный
- Интервенционная модель: Параллельное назначение
- Маскировка: Одинокий
Оружие и интервенции
Группа участников / Армия |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Экспериментальный: Виремический
|
|
|
Экспериментальный: группа реагирования
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Качественная идентификация (используемая единица: оценка Protein Protein) данного белка, связанного с вирионами, в препаратах очищенных вирионов.
Временное ограничение: Через один-два года после масс-спектрометрической идентификации кандидата
|
Баллы белкового пророка позволяют оценить надежность идентификации данного белка в подходах MS.
|
Через один-два года после масс-спектрометрической идентификации кандидата
|
|
Количественная оценка его участия в морфогенезе вируса (используемая единица: TCID50).
Временное ограничение: Через один-два года после масс-спектрометрической идентификации кандидата
|
Единицы TCID50 представляют собой единицы инфекционности, обычно используемые в исследованиях ВГС для количественной оценки вирусной инфекционности.
|
Через один-два года после масс-спектрометрической идентификации кандидата
|
|
Количественная оценка проникновения вируса (используемая единица: соотношение копий РНК ВГС/мРНК GUS).
Временное ограничение: Через один-два года после масс-спектрометрической идентификации кандидата
|
Соотношения копий РНК ВГС/мРНК GUS получают методом 2^дельта(дельта Ct).
|
Через один-два года после масс-спектрометрической идентификации кандидата
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Сравнение наборов данных клинических вирионов с наборами данных выращенных in vitro вирионов
Временное ограничение: Через один-два года после масс-спектрометрической идентификации кандидата
|
Белки, идентифицированные из вирусных частиц, очищенных из клинических образцов, будут сравниваться с белками, идентифицированными в вирусных частицах из клеток гепатокарциномы человека (Huh7.5).
инфицированы ВГС и по которым опубликованы данные.
|
Через один-два года после масс-спектрометрической идентификации кандидата
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Fabien ZOULIM, MD, Service d'Hépato-Gastroentérologie Lyon Croix-Rousse Hospices Civils de Lyon
Публикации и полезные ссылки
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования
Первичное завершение (Действительный)
Завершение исследования (Действительный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Оцененный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Оцененный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- 2009-596
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .