HCV Virions bundne proteiner

Fremkomsten af ​​hepatocellulært carcinom (HCC) har foranlediget en søgen efter en grundig forståelse af biologien af ​​et af dets vigtigste årsagsstoffer, hepatitis C-virus (HCV). HCV-partikler erhverver via spirende og indkapsling cellulære proteiner. Der er stigende beviser på adskillige virale arter, at virion-bundne proteiner er tilbøjelige til at være involveret enten ved replikation, knopskydning/udgang eller ind-/frigivelsestrin i den virale cyklus.

Identifikation af sådanne mål kan give ideelle kandidater til at opnå indsigt i afhængigheden af ​​HCV af en begrænset delmængde af værtsproteiner, hvilket giver raffinerede sæt af genetisk stabile mål til terapi. Dette projekts mål er at opstille passende betingelser for robust og reproducerbar oprensning af HCV-virioner i kliniske prøver, efterfulgt af identifikation af deres HCV-bundne værtsproteiner og karakterisering af deres funktioner. Proteomics-profilering af HCV-partikler oprenset fra kliniske prøver vil blive overlejret med proteiner, der er identificeret og karakteriseret i cellekultur-dyrkede HCV-partikler under min post-doktorale uddannelse, ved hjælp af kriterier for klinisk biomarkør opdagelsesgrad. Mål identificeret i begge prøvesæt vil blive udsat for in vitro undersøgelser ved hjælp af HCV-replikerende celler. Konventionelle biokemiske metoder og billeddannelsesmetoder vil blive brugt til at: (i) fastslå deres fysiske association med HCV-virioner; (ii) definere modaliteterne for deres interaktion med HCV-proteiner; (iii) dechifrere topologien og subcellulær lokalisering af deres association med HCV-proteiner og virioner; (iv) kvantitativt vurdere deres funktionelle involvering i partikel knopskydning, udgang eller sekretion og infektivitet. En kandidat, der gav tilfredsstillende resultater i disse eksperimenter, vil blive afsløret og yderligere undersøgt på det strukturelle biologiniveau i samarbejdsprogrammer.