HCV virionokhoz kötődő fehérjék

A hepatocelluláris karcinóma (HCC) megjelenése arra késztette a kutatást, hogy alaposan megértsük egyik fő kórokozója, a hepatitis C vírus (HCV) biológiáját. A HCV-részecskék bimbózó és kapszidáló sejtfehérjék révén jutnak hozzá. Egyre több vírusfajról van bizonyíték arra vonatkozóan, hogy a virionhoz kötött fehérjék hajlamosak részt venni a vírusciklus replikációjában, bimbózásában/kilépésében vagy belépési/kibocsátási lépéseiben.

Az ilyen célpontok azonosítása ideális jelölteket eredményezhet a HCV-nek a gazdafehérjék egy korlátozott részhalmazától való függőségének megismeréséhez, így finomított genetikailag stabil célcsoportokat biztosít a terápia számára. A projekt célja a klinikai mintákban található HCV virionok robusztus és reprodukálható tisztításának megfelelő feltételek megteremtése, majd a HCV-hez kötött gazdafehérjék azonosítása és funkcióik jellemzése. A klinikai mintákból tisztított HCV részecskék proteomikai profilozását a posztdoktori képzésem során sejtkultúrában növesztett HCV részecskékben azonosított és jellemzett fehérjékkel fedik le, klinikai biomarker felfedezési fokozatú kritériumok alapján. A mindkét mintakészletben azonosított célpontokat in vitro vizsgálatoknak vetik alá HCV-replikáló sejtek felhasználásával. Hagyományos biokémiai és képalkotó módszereket kell alkalmazni annak érdekében, hogy: (i) megállapítsák fizikai kapcsolatukat a HCV virionokkal; (ii) meghatározzák a HCV-fehérjékkel való kölcsönhatásuk módozatait; (iii) megfejteni a HCV fehérjékkel és virionokkal való kapcsolatuk topológiáját és szubcelluláris lokalizációját; iv. mennyiségileg értékeli funkcionális részvételüket a részecske bimbózásában, kilépésében vagy szekréciójában és fertőzőképességében. Az ezekben a kísérletekben kielégítő eredményeket elérő jelöltet nyilvánosságra hozzák, és tovább vizsgálják a szerkezetbiológia szintjén, együttműködési kutatási programok keretében.