Proteínas unidas a viriones del VHC

La aparición del carcinoma hepatocelular (CHC) ha impulsado la búsqueda de un conocimiento profundo de la biología de uno de sus principales agentes causales, el virus de la hepatitis C (HCV). Las partículas del VHC se adquieren a través de proteínas celulares de gemación y encapsidación. Cada vez hay más evidencia en varias especies virales de que las proteínas unidas al virión son propensas a participar en los pasos de replicación, gemación/salida o entrada/liberación del ciclo viral.

La identificación de dichos objetivos puede generar candidatos ideales para obtener información sobre la dependencia del VHC de un subconjunto restringido de proteínas del huésped, lo que proporciona conjuntos refinados de objetivos genéticamente estables para la terapia. Los objetivos de este proyecto son establecer las condiciones adecuadas para una purificación robusta y reproducible de viriones del VHC en muestras clínicas, seguida de la identificación de sus proteínas huésped unidas al VHC y la caracterización de sus funciones. El perfil proteómico de partículas de VHC purificadas a partir de muestras clínicas se superpondrá con proteínas identificadas y caracterizadas en partículas de VHC cultivadas en cultivos celulares durante mi formación posdoctoral, utilizando criterios de grado de descubrimiento de biomarcadores clínicos. Los objetivos identificados en ambos conjuntos de muestras se someterán a investigaciones in vitro utilizando células replicantes del VHC. Se utilizarán métodos bioquímicos y de imagen convencionales para: (i) determinar su asociación física con los viriones del VHC; (ii) definir las modalidades de su interacción con las proteínas del VHC; (iii) descifrar la topología y localización subcelular de su asociación con proteínas y viriones del VHC; (iv) evaluar cuantitativamente su implicación funcional en la brotación, salida o secreción de partículas e infectividad. Un candidato que arrojó resultados satisfactorios en estos experimentos será divulgado e investigado más a fondo a nivel de biología estructural, en programas de investigación colaborativa.