Protéines liées aux virions du VHC

L'émergence du carcinome hépatocellulaire (CHC) a incité à rechercher une compréhension approfondie de la biologie de l'un de ses principaux agents responsables, le virus de l'hépatite C (VHC). Les particules de VHC acquièrent via des protéines cellulaires en bourgeonnement et encapsidation. Il existe de plus en plus de preuves sur plusieurs espèces virales que les protéines liées au virion sont susceptibles d'être impliquées soit aux étapes de réplication, de bourgeonnement/sortie ou d'entrée/libération du cycle viral.

L'identification de telles cibles peut donner des candidats idéaux pour mieux comprendre la dépendance du VHC à un sous-ensemble restreint de protéines hôtes, fournissant ainsi des ensembles raffinés de cibles génétiquement stables pour la thérapie. Les objectifs de ce projet sont de mettre en place des conditions adéquates pour une purification robuste et reproductible des virions du VHC dans des échantillons cliniques, suivie de l'identification de leurs protéines hôtes liées au VHC et de la caractérisation de leurs fonctions. Le profilage protéomique des particules de VHC purifiées à partir d'échantillons cliniques sera recouvert de protéines identifiées et caractérisées dans des particules de VHC cultivées en culture cellulaire au cours de ma formation post-doctorale, en utilisant des critères de qualité de découverte de biomarqueurs cliniques. Les cibles identifiées dans les deux ensembles d'échantillons seront soumises à des investigations in vitro à l'aide de cellules répliquant le VHC. Des méthodes biochimiques et d'imagerie conventionnelles seront utilisées afin de : (i) déterminer leur association physique avec les virions du VHC ; (ii) définir les modalités de leur interaction avec les protéines du VHC ; (iii) déchiffrer la topologie et la localisation subcellulaire de leur association avec les protéines et les virions du VHC ; (iv) évaluer quantitativement leur implication fonctionnelle dans le bourgeonnement, la sortie ou la sécrétion et l'infectivité des particules. Un candidat qui a donné des résultats satisfaisants dans ces expériences sera divulgué et étudié plus en détail au niveau de la biologie structurale, dans des programmes de recherche collaborative.