Применение UCAD для диагностики уротелиальной карциномы.
25 июня 2019 г. обновлено: Shuxiong Zeng, Changhai Hospital
Ультрачувствительное определение хромосомной анеуплоидии (UCAD) в эксфолиированных клетках мочи для диагностики уротелиальной карциномы в эксфолиированных клетках мочи
Хромосомная нестабильность (CIN) относится к продолжающимся ошибкам сегрегации хромосом во время последовательных клеточных делений.
CIN является отличительной чертой рака человека и связан с плохим прогнозом, метастазированием и терапевтической резистентностью.
Анализ CIN ДНК, выделенной из уротелиальных клеток в образцах мочи, кажется многообещающим методом диагностики, мониторинга и прогнозирования прогноза у пациентов с раком мочевого пузыря.
CIN можно оценить с помощью экспериментальных методов, таких как объемное секвенирование ДНК, флуоресцентная гибридизация in situ (FISH) или обычное кариотипирование.
Однако эти методы либо требуют много времени, либо неспецифичны.
Здесь мы намерены изучить, можно ли использовать новый метод под названием «Сверхчувствительное определение хромосомной анеуплоидии» (UCAD), основанный на секвенировании всего генома с низким охватом, для анализа CIN, что поможет в диагностике и лечении пациентов с раком мочевого пузыря.
Обзор исследования
Статус
Неизвестный
Подробное описание
CIN возникает в результате ошибок в сегрегации хромосом во время митоза, что приводит к структурным и числовым хромосомным аномалиям. Это создаст геномную гетерогенность, которая будет служить субстратом для естественного отбора. Кроме того, доказано, что опухоли с анеуплоидиями и полиплоидиями, возникающие в результате удвоения всего генома, связаны с метастазированием, резистентностью к лечению и снижением общей выживаемости. Подсчитано, что 60-80% опухолей человека имеют хромосомные аномалии, указывающие на CIN. CIN положительно коррелирует со стадией опухоли и чаще встречается как в рецидивных, так и в метастатических образцах опухоли. Из-за повсеместного распространения CIN в раковых клетках это потенциально неинвазивный способ обнаружения CIN в уротелиальных клетках из образца мочи для диагностики и мониторинга пациентов с раком мочевого пузыря. UCAD — это новый метод обнаружения CIN в образце ДНК пациентов, включающий выделение ДНК из мочи, анализ ДНК с помощью полногеномного секвенирования с низким охватом, обработку данных с помощью биоинформационных методов и, наконец, оптимизацию ведения пациентов с раком мочевого пузыря. .
Исследователи намеревались провести проспективное исследование путем анализа образцов мочи пациентов с раком мочевого пузыря и контрольных групп, у которых не было опухоли в мочевыделительной системе или других органах, чтобы сравнить специфичность и чувствительность теста UCAD для диагностики уротелиальной карциномы с другими методами, такими как анализ мочи. цитология или флуоресцентная гибридизация in situ (FISH).
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Ожидаемый)
300
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Места учебы
-
-
Shanghai
-
Shanghai, Shanghai, Китай, 200433
- Рекрутинг
- Changhai Hospital
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
18 лет и старше (Взрослый, Пожилой взрослый)
Принимает здоровых добровольцев
Нет
Полы, имеющие право на обучение
Все
Метод выборки
Невероятностная выборка
Исследуемая популяция
Пациенты с диагнозом уротелиальная карцинома или участники контрольной группы в больнице Чанхай с мая 2019 года до конца этого исследования.
Описание
Критерии включения:
- Пациенты с диагнозом уротелиальная карцинома, которым планируется хирургическое вмешательство.
- Участники без каких-либо опухолевых заболеваний, желающие принять участие в исследовании, предоставляя утреннюю мочу.
- Пациенты мужского или женского пола в возрасте >= 18 лет.
- Участники подписали форму информированного согласия.
Критерий исключения:
- Возраст до 18 лет
- Лица, не желающие подписывать форму согласия или не желающие предоставить утреннюю мочу для анализа или не желающие предоставить медицинскую карту.
- Лица, не желающие участвовать в этом испытании.
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Кейс-контроль
- Временные перспективы: Перспективный
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Группа уротелиальной карциномы
Предоперационные пациенты с уротелиальной карциномой будут экспериментальной группой для определения чувствительности и специфичности анализа UCAD, результат будет сравниваться с цитологией и FISH.
|
Уровень CIN ДНК, извлеченная из утренней мочи, будет проанализирована с помощью UCAD для определения уровня CIN.
|
|
Группа участников, не страдающих раком
Пациенты, проходящие лечение от других заболеваний, но без какой-либо опухоли, обеспечат отрицательный контроль, чтобы предоставить данные для определения чувствительности и специфичности анализа UCAD.
|
Уровень CIN ДНК, извлеченная из утренней мочи, будет проанализирована с помощью UCAD для определения уровня CIN.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Чувствительность анализа мочи по анализу UCAD
Временное ограничение: До 1 года
|
Количество пациентов, «объявленных положительными» с помощью теста UCAD среди пациентов, страдающих уротелиальной карциномой.
|
До 1 года
|
|
Специфичность анализа мочи по анализу UCAD
Временное ограничение: По завершении обучения, в среднем 12 месяцев
|
Количество пациентов с «декларированным отрицательным результатом» теста UCAD среди пациентов без рака.
|
По завершении обучения, в среднем 12 месяцев
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Сравнение чувствительности анализа UCAD с цитологией мочи
Временное ограничение: До 1 года
|
Количество пациентов, «объявленных положительными» с помощью анализа UCAD, по сравнению с пациентами, «объявленными положительными» с помощью цитологии мочи.
|
До 1 года
|
|
Сравнение специфичности анализа UCAD с цитологией мочи
Временное ограничение: До 1 года
|
Количество пациентов, «объявленных отрицательными» при анализе UCAD, по сравнению с пациентами, «заявленными отрицательными» при цитологическом исследовании мочи.
|
До 1 года
|
Другие показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Выявление корреляции между уровнем ЦИН и степенью злокачественности образца опухоли
Временное ограничение: До 1 года
|
Уровень CIN в образце мочи по сравнению со степенью опухоли, подтвержденной гистопатологическим исследованием
|
До 1 года
|
|
Выявление корреляции между уровнем ЦИН и стадией образца опухоли
Временное ограничение: До 1 года
|
Уровень CIN в образце мочи по сравнению со стадией опухоли, подтвержденной гистопатологическим исследованием.
|
До 1 года
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Спонсор
Следователи
- Учебный стул: Chuangliang Xu, M.D., Ph.D, Changhai Hospital
Публикации и полезные ссылки
Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.
Общие публикации
- Wadhwa N, Mathew BB, Jatawa SK, Tiwari A. Genetic instability in urinary bladder cancer: An evolving hallmark. J Postgrad Med. 2013 Oct-Dec;59(4):284-8. doi: 10.4103/0022-3859.123156.
- Bakhoum SF, Ngo B, Laughney AM, Cavallo JA, Murphy CJ, Ly P, Shah P, Sriram RK, Watkins TBK, Taunk NK, Duran M, Pauli C, Shaw C, Chadalavada K, Rajasekhar VK, Genovese G, Venkatesan S, Birkbak NJ, McGranahan N, Lundquist M, LaPlant Q, Healey JH, Elemento O, Chung CH, Lee NY, Imielenski M, Nanjangud G, Pe'er D, Cleveland DW, Powell SN, Lammerding J, Swanton C, Cantley LC. Chromosomal instability drives metastasis through a cytosolic DNA response. Nature. 2018 Jan 25;553(7689):467-472. doi: 10.1038/nature25432. Epub 2018 Jan 17.
- Liu H, He W, Wang B, Xu K, Han J, Zheng J, Ren J, Shao L, Bo S, Lu S, Lin T, Huang J. MALBAC-based chromosomal imbalance analysis: a novel technique enabling effective non-invasive diagnosis and monitoring of bladder cancer. BMC Cancer. 2018 Jun 15;18(1):659. doi: 10.1186/s12885-018-4571-7.
- Hieronymus H, Murali R, Tin A, Yadav K, Abida W, Moller H, Berney D, Scher H, Carver B, Scardino P, Schultz N, Taylor B, Vickers A, Cuzick J, Sawyers CL. Tumor copy number alteration burden is a pan-cancer prognostic factor associated with recurrence and death. Elife. 2018 Sep 4;7:e37294. doi: 10.7554/eLife.37294.
- Zeng S, Ying Y, Xing N, Wang B, Qian Z, Zhou Z, Zhang Z, Xu W, Wang H, Dai L, Gao L, Zhou T, Ji J, Xu C. Noninvasive Detection of Urothelial Carcinoma by Cost-effective Low-coverage Whole-genome Sequencing from Urine-Exfoliated Cell DNA. Clin Cancer Res. 2020 Nov 1;26(21):5646-5654. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-20-0401. Epub 2020 Oct 9.
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
5 мая 2019 г.
Первичное завершение (Ожидаемый)
5 мая 2020 г.
Завершение исследования (Ожидаемый)
5 мая 2020 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
19 июня 2019 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
25 июня 2019 г.
Первый опубликованный (Действительный)
26 июня 2019 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
26 июня 2019 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
25 июня 2019 г.
Последняя проверка
1 июня 2019 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- CH-urology-bladder marker-002
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Нет
Описание плана IPD
Мы постараемся защитить информацию включенных участников
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
продукт, произведенный в США и экспортированный из США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .