Serum DNA-analys: potentiell tillämpning för diagnos och prognos vid hjärncancer.

Bakgrund:

Genetiska och epigenetiska skavsår som förlust av heterozygositet och hypermetylering av genpromotorer är vanliga aberrationer i gliom. Detektering av dessa avvikelser fungerar som diagnostiskt och prognostiskt verktyg. Exempel: 1. oligodendrogliompatienter med kombinerad 1p/19q LOH i tumören svarar bättre på kemoterapi och har bättre prognos, medan LOH på kromosom 10q är en markör för sämre prognos. 2. GBM-patienter med hypermetylering av promotorn för metyl-guanin-metyl-transferas (MGMT) i tumören svarar bättre på alkyleringsmedel och har bättre prognos.

Eftersom provmaterial för diagnos bör vara lättillgängligt med ett minimalt invasivt förfarande, har det funnits stort intresse för den potentiella användningen av nukleinsyramarkörer i blodet hos patienter med cancer.

Det visades att LOH såväl som hypermetylering kunde detekteras i plasma/serum hos patienter med en mängd olika maligniteter, vilket tyder på att cirkulerande tumörassocierat DNA i blodet hos patienter kan vara en nyckeldeterminant för att förutsäga genetiska och epigenetiska skavsår i tumör.

Mål för studien:

Huvudmål: att ta reda på om genetiska skrubbsår i serum-DNA representerar tumör-DNA hos patienter med hjärntumör.

Kan tumör-DNA påvisas i serum endast från höggradiga tumörer eller även i låggradiga tumörer?

Metoder:

Blodserum och tumör från patienter erhålls anonymt, efter att patienten skrivit på en samtyckesblankett, inför operation som en del av proceduren för vävnadsinsamling för hjärntumörbanken på Hadassah.

En del av tumören färgas med hematoxylin-och-eosin och histopatologisk diagnos utförs av en patolog.

DNA extraheras från helblod, serum och tumör från alla patienter med låggradiga eller höggradiga gliom.

För att avgöra om serum-DNA representerar tumör-DNA, kommer LOH på 1p,19q,10q,17p,13q, 9p samt metyleringsstatus för MGMT-promotorn att testas i DNA-prover från blod, serum och tumör.