Klinická validace ThyroidPrint: Signatura genové exprese pro diagnostiku neurčitých uzlin štítné žlázy
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Detailní popis
Uzly štítné žlázy jsou velmi častým onemocněním, které postihuje až 30–40 % dospělé populace. Ačkoli většina uzlů štítné žlázy má malý klinický význam, v mnoha případech bude k určení jejich povahy provedena biopsie tenkou jehlou (FNA). V 70 % případů bude FNA hlášena jako benigní a v 10 % případů jako rakovina. Zbývajících 20 % případů však bude uzel štítné žlázy označen jako neurčitý. Posledně jmenovaní pacienti mají riziko malignity v rozmezí od 15 do 25 % a ve většině případů pacient podstoupí lobektomii štítné žlázy nebo celkovou tyreoidektomii ke stanovení konečné patologie, což má za následek nepřijatelný počet zbytečných operací. To má velký dopad na zdraví, včetně chirurgických rizik a trvalé hormonální suplementace, stejně jako neoprávněné zdravotní náklady odhadované na 1,6 miliardy USD. Proto existuje potřeba diagnostických nástrojů, aby se zlepšila diagnostická přesnost FNA a zabránilo se vysokému počtu zbytečných operací.
GeneproDx vyvinul signaturu genové exprese pro zlepšení diagnostické přesnosti biopsie FNA uzlin štítné žlázy uváděných jako neurčité. Diagnostika ThyroidPrint měří expresi 10 genů ve vzorku FNA. Kombinuje výsledky 10 biomarkerů pomocí patentovaného algoritmu k predikci benigních uzlů štítné žlázy. Tento test je klasifikován jako multianalytový algoritmický test (MAAA).
Biomarkery se skládají z multiplexních testů genové exprese TaqMan® prováděných na přístroji Qiagen Rotor-Gene Q MDx RT-PCR IVD Platform, což je přístroj schválený FDA. Panel biomarkerů tvoří následujících 10 genů: CXCR3, CCR3, CXCL10, CK19, TIMP1, CLDN1, CAR, XB130, HO-1 a CCR7. Každý gen běží v multiplexní konfiguraci se dvěma referenčními geny. Každý test se provádí pomocí souprav a činidel pouze pro výzkum (RUO) na přístroji schváleném FDA.
ThyroidPrint byl vyvinut pomocí dvou různých kohort vzorků, tréninkové sady a testovací sady. Pomocí lineární diskriminační analýzy trénovací sada identifikovala konečný panel biomarkerů včetně; CXCR3, CCR3, CXCL10, CK19, TIMP1, CLDN1, CAR, XB130, HO-1 a CCR7. Stručně řečeno, biomarkery mají následující význam. CCR3 a CCR7 jsou chemokinové receptory, které jsou vysoce exprimovány v nádorových buňkách papilárního karcinomu štítné žlázy. CXCR3 je také chemokinový receptor a spolu s jeho receptorem CXCL10 jsou detekovány u autoimunitních onemocnění štítné žlázy. CAR je receptor G-páru a bylo prokázáno, že se podílí na rakovině a má sníženou expresi v adenomu příštítných tělísek. CK19 je keratin a používá se u nádorů štítné žlázy k rozpoznání papilárních karcinomů. CLDN1 je strukturální protein a ukázalo se, že je v nádorech exprimován odlišně ve srovnání s normální tkání a má zvýšené hladiny mRNA u papilárního karcinomu štítné žlázy. XB130 je také strukturální protein a jeho exprese byla prokázána u papilárního karcinomu štítné žlázy. TIMP1 je inhibitor proteázy se zvýšenými hladinami mRNA v pokročilých stádiích karcinomu štítné žlázy. HO-1 je oxygenáza a její exprese koreluje s agresivitou nádoru u rakoviny štítné žlázy. V konečném klasifikátoru byla exprese každého genu ̈vážena ̈ na základě jeho individuální relativní klasifikační schopnosti. Hraniční skóre bylo zvoleno v ROC křivce generované v tréninkové sadě na základě minimální citlivosti 92 %, aby byla zaručena vysoká negativní prediktivní hodnota (>95 %). Toto cutoff skóre nabízelo specificitu 83 %. Nezávislá testovací sada vzorků reprodukovala diagnostický výkon pozorovaný v tréninkové sadě a vykazovala konzistentní výsledky ve vzorcích FNA. Test prokázal, že přesně predikuje benigní uzliny ve vzorcích FNA štítné žlázy s negativní prediktivní hodnotou 96 % a specificitou 83 % v obou kohortách. Definitivní validace MAAA vyžaduje finální validační sadu, která analyzuje vzorky, které budou použity v běžném klinickém prostředí; v tomto případě vzorky neurčitých uzlů štítné žlázy. Navíc, aby se prokázala klinická validita, musí být validační soubor proveden jako statisticky podložená multiinstitucionální studie, aby bylo zajištěno, že údaje jsou použitelné pro široké spektrum populace a mají vhodné intervaly spolehlivosti. V Chile právě probíhá první, statisticky podložená, multiinstitucionální studie, která má prokázat klinickou validitu. Tato zkušební verze zahrnuje 8 míst a přijme přibližně 3 000 FNA, která má být dokončena do prosince 2017.
Typ studie
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
Studijní kontakt
- Jméno: Hernan E Gonzalez, MD, PhD
- Telefonní číslo: +56999734312
- E-mail: hgonzale@med.puc.cl
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Natalia Mena, PhD
- Telefonní číslo: 56966770494
- E-mail: natalia.paz.mensj@gmail.com
Studijní místa
-
-
Alabama
-
Guntersville, Alabama, Spojené státy, 35976
- Nábor
- Avantt Research
-
Kontakt:
- Dr. Nixon, MD
-
-
California
-
Palo Alto, California, Spojené státy, 94305
- Nábor
- Stanford University
-
Kontakt:
- Chris Holsinger, MD
-
-
Florida
-
Tampa, Florida, Spojené státy
- Nábor
- Lee Moffit Cancer Center
-
Kontakt:
- Bryan McIver, MD, PhD
-
-
Louisiana
-
New Orleans, Louisiana, Spojené státy
- Nábor
- Tulane University
-
Kontakt:
- Emad Kandil, MD
-
-
Ohio
-
Cincinnati, Ohio, Spojené státy, 45220
- Nábor
- Universidad de Cincinnati
-
Kontakt:
- Davis Stewart, MD
-
-
Texas
-
Houston, Texas, Spojené státy, 77030
- Nábor
- University of Texas MD Anderson Cancer Center
-
Kontakt:
- Mark Zafareo, MD
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Pacienti podstupující FNA uzlu štítné žlázy.
- Uzel štítné žlázy větší 1 cm
- Věk vyšší než 18 let.
Kritéria vyloučení:
- Uzel štítné žlázy větší 1 cm
- Pacienti mladší 18 let,
- Předchozí anamnéza poruch koagulace a pacientů.
- Ultrazvukový důkaz maligní cervikální adenopatie.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Kohorta
- Časové perspektivy: Budoucí
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Schopnost předpovědět benigní uzly štítné žlázy.
Časové okno: 24 měsíců
|
To bude určeno zápornou prediktivní hodnotou
|
24 měsíců
|
|
Schopnost předpovědět maligní uzly štítné žlázy.
Časové okno: 24 měsíců
|
To bude určeno pozitivní prediktivní hodnotou
|
24 měsíců
|
|
Citlivost testu
Časové okno: 24 měsíců
|
Počet skutečně pozitivních případů
|
24 měsíců
|
|
Specifičnost testu
Časové okno: 24 měsíců
|
Počet skutečně negativních případů
|
24 měsíců
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Spolupracovníci
Spolupracovníci
Vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Mark Zafareo, MD, M.D. Anderson Cancer Center
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Sosa JA, Hanna JW, Robinson KA, Lanman RB. Increases in thyroid nodule fine-needle aspirations, operations, and diagnoses of thyroid cancer in the United States. Surgery. 2013 Dec;154(6):1420-6; discussion 1426-7. doi: 10.1016/j.surg.2013.07.006. Epub 2013 Oct 2.
- Bongiovanni M, Spitale A, Faquin WC, Mazzucchelli L, Baloch ZW. The Bethesda System for Reporting Thyroid Cytopathology: a meta-analysis. Acta Cytol. 2012;56(4):333-9. doi: 10.1159/000339959. Epub 2012 Jul 25.
- Hodak SP, Rosenthal DS; American Thyroid Association Clinical Affairs Committee. Information for clinicians: commercially available molecular diagnosis testing in the evaluation of thyroid nodule fine-needle aspiration specimens. Thyroid. 2013 Feb;23(2):131-4. doi: 10.1089/thy.2012.0320. Epub 2012 Nov 27.
- Nikiforova MN, Wald AI, Roy S, Durso MB, Nikiforov YE. Targeted next-generation sequencing panel (ThyroSeq) for detection of mutations in thyroid cancer. J Clin Endocrinol Metab. 2013 Nov;98(11):E1852-60. doi: 10.1210/jc.2013-2292. Epub 2013 Aug 26.
- Ali SZ, Fish SA, Lanman R, Randolph GW, Sosa JA. Use of the afirma(R) gene expression classifier for preoperative identification of benign thyroid nodules with indeterminate fine needle aspiration cytopathology. PLoS Curr. 2013 Feb 11;5:ecurrents.eogt.e557cbb5c7e4f66568ce582a373057e7. doi: 10.1371/currents.eogt.e557cbb5c7e4f66568ce582a373057e7.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Očekávaný)
Primární dokončení
Dokončení studie (Očekávaný)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- GPDX-001
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
produkt vyrobený a vyvážený z USA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Neurčitá cytologie štítné žlázy
-
NCT06959641NáborMetastatický diferencovaný karcinom štítné žlázy | Refrakterní diferencovaný karcinom štítné žlázy | Diferencovaný karcinom štítné žlázy stadia III AJCC v8 | Diferencovaný karcinom štítné žlázy stadia IV AJCC v8 | Metastatický folikulární karcinom štítné žlázy | Metastatický papilární karcinom štítné žlázy | Refrakterní papilární karcinom štítné žlázy | Refrakterní folikulární karcinom štítné žlázy | Metastatický onkocytární karcinom štítné žlázy | Lokálně pokročilý diferencovaný karcinom štítné žlázy
Klinické studie na Diagnostika in vitro
-
NCT07073677Zatím nenabírámeMírná až střední atopická dermatitida
-
NCT06725355Aktivní, ne náborNevalvulární fibrilace síní (NVAF)
-
NCT07311811Zatím nenabíráme
-
NCT07500532NáborExacerbace astmatu | Dětské astma | Akutní zánět středního ucha (AOM) | Strepfaryngitida
-
NCT05299099Dokončeno
-
NCT06736912Zatím nenabíráme
-
NCT04637919NeznámýOnemocnění rukou, nohou a úst
-
NCT04132830DokončenoHIV-exponovaný neinfikovaný