NGS-basierter Test von Blutproben von Sepsis-Patienten zur schnellen Identifizierung von Bakterien (BIOARTE)

Der frühzeitige Einsatz antimikrobieller Medikamente ist der Grundstein für die Behandlung kritisch erkrankter Patienten. Das geeignete Zeitfenster für diesen frühen Eingriff kann stark variieren, es wird jedoch davon ausgegangen, dass es ein bis drei Stunden nach der Aufnahme ins Krankenhaus liegt. Die Wahl der antimikrobiellen Mittel für die Frühintervention beruht jedoch auf einer empirischen Auswahl und kann aufgrund der Entstehung antimikrobieller Resistenzen mehrfach ungeeignet sein. Die einzige Möglichkeit, diese Schwierigkeit zu überwinden, ist die Führung durch frühzeitige Mikrobenidentifizierung und Antibiotika-Empfindlichkeitstests (AST). Allerdings sind die Blutkulturen bei fast 20 % der kritisch kranken Patienten positiv und die AST kann sich um bis zu 72 Stunden verzögern.

Dies bedeutet, dass ein anderer Ansatz erforderlich ist, der die größte Einschränkung der Standard-of-Care-Mikrobiologie (SoC) angeht, nämlich die Notwendigkeit, Vollblut in mit Wachstumsmedium angereicherten Flaschen zu inkubieren, was eine Subkultivierung erforderlich macht, sobald eine Blutflasche positiv wird. Es ist offensichtlich, dass die schnelle Identifizierung des Erregers mit anschließender AST mithilfe von Vollblut ohne die Notwendigkeit einer Blutkultur einen großen Fortschritt im diagnostischen Bereich darstellen kann.

Die vorliegende Studie basiert auf einer früheren Analyse von Ethylendiamintetraessigsäure (EDTA)-Vollblut von Patienten mit bekannter Blutkreislaufinfektion. Mithilfe der Next-Generation-Sequenzierung (NGS) von aus Vollblut extrahierter Bakterien-DNA konnte der richtige Erreger identifiziert werden. Ziel dieser Studie ist die Validierung dieses NGS-basierten Tests bei einer größeren Anzahl von Patienten.