Variantes génétiques de gènes sélectionnés chez les patients atteints d'un cancer colo-rectal.

Identification du problème : Les cancers colorectaux (CCR) sont la troisième tumeur maligne humaine la plus courante et sont également la principale cause de décès liés au cancer dans le monde. La détection précoce des lésions précancéreuses telles que les polypes adénomateux a diminué le risque de CCR ; cependant, les cas initialement non détectés et qui évoluent vers un CCR avancé avec des métastases à distance sont toujours malheureusement incurables. Le développement du CCR est un processus complexe et hétérogène résultant d'une interaction entre de multiples facteurs étiologiques, y compris des facteurs génétiques et des facteurs environnementaux tels que l'alimentation et le mode de vie. Les défis consistent à comprendre la base moléculaire de la susceptibilité individuelle au cancer colorectal et à déterminer les facteurs qui initient le développement de la tumeur, conduisent sa progression et déterminent sa réactivité ou sa résistance aux agents antitumoraux. Les études génomiques axées sur le séquençage de nouvelle génération (NGS) signalent déjà de nouvelles caractéristiques des génomes du cancer au-delà des catégories mutationnelles traditionnelles. Les progrès récents de la technologie de séquençage ont permis un profilage complet des altérations génétiques dans le CRC. Ces méthodes facilitent une augmentation de l'efficacité et de la résolution de la détection de chacun des principaux types d'altérations du génome du cancer somatique, y compris les substitutions de nucléotides, les petites insertions et suppressions, la copie altérations du nombre, réarrangements chromosomiques, séquençage de la méthylation de l'ADN tel que le séquençage au bisulfite et les infections microbiennes. Outre l'instabilité des microsatellites (MSI), certains chercheurs ont signalé de nouvelles mutations mitochondriales dans les génomes du cancer. conception : la conception de l'étude pour tenter d'identifier le spectre mutationnel unique et les nouvelles cibles des altérations génomiques et épigénétiques chez les patients égyptiens atteints d'un cancer colorectal dans la région du Delta en utilisant l'exome entier et le séquençage profond épigénétique. Résultats attendus : l'analyse du génome basée sur le NGS facilite l'identification des gènes non reconnus mutation du cancer du CCR égyptien, en particulier dans la région du delta, qui peut être biologiquement différente du CCR occidental car les facteurs environnementaux sont différents. Importance des résultats attendus : les résultats de ce projet bénéficieront à (1) Identification de nouvelles caractéristiques ou types de mutations dans le CCR génomes dans la région du delta. (2) Comprendre l'avancement du niveau des voies dans la carcinogenèse colorectale et (3) Identifier des biomarqueurs génétiques et épigénétiques cliniquement pertinents pour un diagnostic non invasif et des cibles cliniquement exploitables pour une médecine ciblée personnalisée.