Válogatott gének genetikai változatai vastagbél-végbélrákos betegekben.

A probléma azonosítása: A vastagbélrák (CRC) a harmadik leggyakoribb emberi rosszindulatú daganat, és világszerte a rákkal összefüggő halálozások vezető oka. A premalignus elváltozások, például az adenomás polipok korai felismerése csökkentette a CRC-k kockázatát; azonban az eredetileg fel nem fedezett esetek, amelyek előrehaladott, távoli áttéttel járó CRC-vé alakulnak, sajnos még mindig gyógyíthatatlanok. A CRC kialakulása összetett és heterogén folyamat, amely több etiológiai tényező kölcsönhatásából ered, beleértve a genetikai tényezőket és a környezeti tényezőket, például az étrendet és az életmódot. A kihívás az, hogy megértsük a vastag- és végbélrákra való egyéni érzékenység molekuláris alapját, és meghatározzuk azokat a tényezőket, amelyek elindítják a daganat kialakulását, elősegítik annak progresszióját, és meghatározzák a daganatellenes szerekkel szembeni válaszkészségét vagy rezisztenciáját. A következő generációs szekvenálás (NGS) által vezérelt genomikai vizsgálatok már a rákgenomok hagyományos mutációs kategóriákon túlmutató új jellemzőiről számolnak be. A szekvenálási technológia közelmúltbeli fejlődése lehetővé tette a CRC genetikai elváltozásainak átfogó profilozását. Ezek a módszerek elősegítik a szomatikus rák genomváltozásainak minden fő típusának kimutatásának hatékonyságának és felbontásának növelését, beleértve a nukleotid szubsztitúciókat, kis inszerciókat és deléciókat, másolatokat. számváltozások, kromoszóma-átrendeződések, DNS-metilációs szekvenálás, például biszulfit-szekvenálás és mikrobiális fertőzések. A mikroszatellit instabilitás (MSI) mellett néhány kutató új mitokondriális mutációkról számolt be a rák genomjában. Az NGS technológia segít a kutatóknak a teljes CRC genom megértésében, és a megszerzett tudás jobb diagnózishoz és személyre szabott célzott terápiákhoz vezet a CRC kezelésében. Tervezés: A vizsgálati terv az egyiptomi vastagbélrákos betegek genomiális, epigenetikai változásainak egyedi mutációs spektrumának és új célpontjainak azonosítására tesz kísérletet Delta régióban teljes exome és epigenetikai mély szekvenálás segítségével. Várt eredmények: Az NGS-alapú genomelemzés megkönnyíti a fel nem ismert gének azonosítását. az egyiptomi CRC rák mutációja, különösen a Delta régióban, amely biológiailag eltérhet a nyugati CRC-től, mivel a környezeti tényezők eltérőek. A várt eredmények jelentősége: A projekt eredményei hasznosak lesznek a következőkben: (1) A CRC új jellemzőinek vagy mutációs típusainak azonosítása genomok Delta régióban. (2) A colorectalis karcinogenezisben az útvonal-szint előrehaladásának megértése és (3) Klinikailag releváns genetikai és epigenetikai biomarkerek azonosítása a noninvazív diagnózishoz és klinikailag megvalósítható célpontok azonosítása a személyre szabott célzott orvoslás számára.