Staphylococcus Epidermidis résistant au linézolide en soins intensifs et analyse des facteurs de risque (ELiCSIR)

La résistance au linézolide a augmenté au cours des dernières années, suggérant des difficultés thérapeutiques croissantes tout en réduisant les options de traitement des infections graves ou compliquées impliquant des souches de staphylocoques ou d'entérocoques. Cette émergence a été en partie expliquée après la découverte de la dissémination chromosomique d'un gène particulier, nommé « crf », conférant un haut niveau de résistance aux oxazolidinones.

De plus, ce mécanisme a été démontré comme étant répandu dans plusieurs pays d'Amérique du Nord, d'Asie et d'Europe.

Mais encore le lien avec les évidences cliniques n'est pas encore très bien établi.

En particulier, le rôle de S. epidermidis est devenu cliniquement significatif concernant les infections de la circulation sanguine et les infections liées aux cathéters. La réalité de la pathogénicité est plus largement admise, notamment en ce qui concerne les infections des prothèses articulaires, et des patients immunodéprimés, comme en hématologie et en oncologie.

Ainsi, il apparaît nécessaire d'apporter des informations plus solides concernant le risque d'utilisation de cet antibiotique dans un contexte de forte charge de résistance, où il pourrait être prescrit de manière intensive sur des situations critiques, et donc responsable d'une forte pression sélective de résistance.

Notre objectif est de décrire l'émergence de la résistance au linézolide chez les souches de S. epidermidis résistantes à la méticilline dans les deux USI de 20 lits de notre CHU, au cours des 5 dernières années, entre avril 2011 et octobre 2016.

Nous menons une étude cas-témoin entre deux populations de patients hospitalisés dans l'une de ces unités de soins intensifs.

Ils présentaient tous une bactériémie causée par une souche de S. epidermidis résistante à la méticilline, et diagnostiquée prospectivement ou rétrospectivement également résistante au linézolide ou non. En effet, les données microbiologiques étaient assez facilement disponibles car toutes les souches isolées à partir d'échantillons sanguins sont conservées après congélation pendant de nombreuses années. Néanmoins, il nous manque le profil de sensibilité au linézolide car cet antibiotique n'a pas été testé en routine avant 2014, correspondant au moment où nous avons pris conscience de la montée problématique. Un travail préalable consiste donc à établir l'incidence de la résistance.

La comparaison de ces deux populations par le biais d'une étude cas-témoins, acceptant 2 patients-témoins pour un cas (appariés sur la durée d'hospitalisation, la mortalité et le score de gravité à l'admission), pourrait permettre de comprendre les facteurs de risque d'être infecté par un linézolide résistant. et S. epidermidis résistant à la méticilline.

Alors pour aller plus loin, nous effectuons d'abord une analyse phénotypique afin d'établir l'incidence de cette résistance, conformément aux critères EUCAST 2016. L'association avec l'analyse génotypique par électrophorèse en champ pulsé et typage multilocus permettra de souligner l'impact de la présence du gène crf, et des mutations décrites comme étant impliquées dans la résistance de haut niveau (mutations dans le domaine V de l'ARN 23S ou des protéines ribosomiques L3 et L4).

Tout patient adulte admis dans l'un de ces deux services peut être inclus et évalué s'il a présenté au moins deux hémocultures prélevées à moins de 48 heures d'intervalle, positives pour la même souche (conformément à la définition CTINILS 2007). Nous avons considéré les infections liées au cathéter comme étant à part si elles étaient associées à des hémocultures positives.

Nous recherchons également des critères cliniques supposés être liés à une infection par une telle souche résistante ; nous vérifions les données démographiques, les conditions à l'admission, le traitement antibiotique avant ou à l'admission, les procédures considérées à haut risque d'infections de santé telles que la chirurgie, en particulier en période de grande instabilité, ainsi que les procédures endovasculaires, comme l'implantation de cathéter ou extra- assistance corporelle (membrane extra-corporelle pour l'oxygénation, thérapie de remplacement rénal).

Nous examinons les options thérapeutiques une fois le diagnostic d'infections sanguines posé, le choix de l'antibiotique comme traitement et le résultat défini comme la guérison ou la survie à 28 jours, qui est la période d'appariement des patients.