Staphylococcus Epidermidis oporny na linezolid na OIOM i analiza czynników ryzyka (ELiCSIR)

Oporność na linezolid wzrasta w ostatnich latach, co sugeruje rosnące trudności terapeutyczne przy jednoczesnym zawężeniu możliwości leczenia ciężkich lub powikłanych zakażeń z udziałem szczepów Staphyloccoci lub Enterococci. To pojawienie się zostało częściowo wyjaśnione po odkryciu rozsiewu chromosomalnego określonego genu, nazwanego „crf”, nadającego wysoki poziom oporności na oksazolidynony.

Co więcej, wykazano, że mechanizm ten jest powszechny w kilku krajach Ameryki Północnej, Azji i Europy.

Ale nadal związek z dowodami klinicznymi nie został jeszcze dobrze ustalony.

W szczególności rola S. epidermidis stała się klinicznie znacząca w odniesieniu do zakażeń krwi i zakażeń odcewnikowych. Rzeczywistość patogenności jest szerzej akceptowana, zwłaszcza w przypadku infekcji protez stawowych i pacjentów z obniżoną odpornością, jak w hematologii i onkologii.

Wydaje się zatem konieczne dostarczenie bardziej rzetelnych informacji na temat ryzyka stosowania tego antybiotyku w warunkach dużego obciążenia opornością, gdzie może być przepisywany intensywnie w sytuacjach krytycznych, a tym samym odpowiedzialny za dużą presję selekcyjną oporności.

Naszym celem jest opisanie pojawienia się oporności na linezolid u metycylinoopornych szczepów S. epidermidis na dwóch 20-łóżkowych OIT naszego Szpitala Klinicznego w ciągu ostatnich 5 lat, od kwietnia 2011 do października 2016.

Przeprowadzamy badanie kliniczno-kontrolne między dwiema populacjami pacjentów hospitalizowanych na jednym z tych oddziałów intensywnej terapii.

U wszystkich wystąpiło zakażenie krwi wywołane przez szczep S. epidermidis oporny na metycylinę i zdiagnozowano prospektywnie lub retrospektywnie oporność na linezolid lub nie. Rzeczywiście, dane mikrobiologiczne były dość łatwo dostępne, ponieważ wszystkie szczepy wyizolowane z próbek krwi są konserwowane po zastygnięciu przez wiele lat. Niemniej jednak brakuje nam profilu wrażliwości na linezolid, ponieważ ten antybiotyk nie był rutynowo badany przed 2014 rokiem, co odpowiada momentowi, w którym zdaliśmy sobie sprawę z problematycznego wzrostu. Poprzednia praca polega zatem na ustaleniu częstości występowania odporności.

Porównanie tych dwóch populacji za pomocą projektu badania kliniczno-kontrolnego, przyjmującego 2 pacjentów kontrolnych dla jednego przypadku (dopasowanych pod względem okresu hospitalizacji, śmiertelności i ciężkości przy przyjęciu), może pozwolić na zrozumienie czynników ryzyka zakażenia linezolidem opornym i oporny na metycylinę Sepidermidis.

Idąc dalej, najpierw przeprowadzamy analizę fenotypową w celu ustalenia częstości występowania tej odporności, zgodnie z kryteriami EUCAST z 2016 roku. Powiązanie z analizą genotypową za pomocą elektroforezy żelowej w polu pulsacyjnym i typowania Multilocus-sequence pozwoli na podkreślenie wpływu obecności genu crf oraz mutacji opisanych jako zaangażowane w wysoki poziom oporności (mutacje w domenie V 23S ARN lub białkach rybosomalnych L3 i L4).

Każdy dorosły pacjent przyjęty do jednego z tych dwóch oddziałów może zostać włączony i oceniony, jeśli przedstawi co najmniej dwa posiewy krwi pobrane w odstępie krótszym niż 48 godzin, dając wynik pozytywny na obecność tego samego szczepu (zgodnie z definicją CTINILS z 2007 r.). Uznaliśmy, że infekcje związane z cewnikiem są oddzielne, jeśli były związane z dodatnimi posiewami krwi.

Poszukujemy również kryteriów klinicznych, które miałyby być związane z zakażeniem takim opornym szczepem; sprawdzamy dane demograficzne, stan przy przyjęciu, antybiotykoterapię przed przyjęciem lub przy przyjęciu, zabiegi uważane za obarczone wysokim ryzykiem zakażeń w służbie zdrowia, takie jak chirurgia, zwłaszcza w okresie dużej niestabilności, także zabiegi wewnątrznaczyniowe, jak implantacja cewnika czy ekstra- pomoc cielesna (pozaustrojowa membrana do natleniania, terapia nerkozastępcza).

Analizujemy możliwości terapeutyczne po postawieniu diagnozy zakażenia krwi, wyborze antybiotyku jako leczenia i wyniku definiowanym jako wyleczenie lub przeżycie po 28 dniach, czyli okresie doboru pacjentów.