Linezolid-rezistentní Staphylococcus Epidermidis na JIP a analýza rizikových faktorů (ELiCSIR)

Rezistence na linezolid se v posledních letech zvyšuje, což naznačuje rostoucí terapeutické obtíže při zužování možností léčby těžkých nebo komplikovaných infekcí zahrnujících kmeny stafylokoků nebo enterokoků. Tento výskyt byl částečně vysvětlen po objevu chromozomálního šíření konkrétního genu, nazvaného „crf“, který propůjčuje vysokou úroveň rezistence vůči oxazolidinonům.

Navíc se ukázalo, že tento mechanismus převládá v několika zemích v Severní Americe, Asii a Evropě.

Spojení s klinickými důkazy však stále nebylo příliš dobře prokázáno.

Zejména úloha S. epidermidis se stala klinicky významnou, pokud jde o infekce krevního řečiště a infekce spojené s katetrem. Realita patogenity je více akceptována, zejména pokud jde o protetické kloubní infekce a imunokompromitované pacienty, jako v hematologii a onkologii.

Proto se jeví jako nezbytné poskytnout solidnější informace o riziku užívání tohoto antibiotika v prostředí s vysokou zátěží rezistence, kde může být v kritických situacích intenzivně předepisováno, a tedy odpovědné za vysoký selekční tlak rezistence.

Naším cílem je popsat vznik rezistence na linezolid u kmenů S. epidermidis rezistentních na meticilin na dvou 20lůžkových JIP naší fakultní nemocnice v posledních 5 letech, mezi dubnem 2011 a říjnem 2016.

Provádíme případovou a kontrolní studii mezi dvěma populacemi pacientů hospitalizovaných na jedné z těchto JIP.

Všichni představovali infekci krevního řečiště způsobenou kmenem S. epidermidis, který byl rezistentní na meticilin a prospektivně nebo retrospektivně byl diagnostikován jako rezistentní na linezolid, nebo ne. Mikrobiologická data byla skutečně snadno dostupná, protože všechny kmeny izolované z krevních vzorků jsou konzervovány po ztuhnutí po mnoho let. Chybí nám však profil směrem k citlivosti na linezolid, protože toto antibiotikum nebylo rutinně testováno před rokem 2014, což odpovídá okamžiku, kdy jsme si uvědomili problémový vzestup. Předchozí práce tedy spočívá ve stanovení výskytu rezistence.

Srovnání těchto dvou populací prostřednictvím designové studie případ-kontrola, která přijímá 2 kontrolní pacienty pro jeden případ (odpovídající době hospitalizace, úmrtnosti a skóre závažnosti při přijetí), by mohlo umožnit pochopení rizikových faktorů infekce rezistentním na linezolid a S. epidermidis rezistentní na meticilin.

Abychom šli dále, nejprve provedeme fenotypovou analýzu, abychom stanovili výskyt této rezistence v souladu s kritérii EUCAST pro rok 2016. Asociace s genotypovou analýzou pomocí gelové elektroforézy v pulzním poli a multilokusového sekvenčního typování umožní zdůraznit dopad přítomnosti genu crf a mutací popisovaných jako podílející se na vysoké úrovni rezistence (mutace v doméně V 23S ARN nebo ribozomálních proteinů L3 a L4).

Všichni dospělí pacienti přijatí na jednu z těchto dvou jednotek mohou být zahrnuti a vyhodnoceni, pokud předložili alespoň dvě hemokultury odebrané v intervalu kratším než 48 hodin a byly pozitivní na stejný kmen (v souladu s definicí CTINILS z roku 2007). Infekce spojené s katetrem jsme považovali za oddělené, pokud byly spojeny s pozitivními hemokulturami.

Také hledáme klinická kritéria, která mají být spojena s infekcí takto odolným kmenem; kontrolujeme demografické údaje, stavy při přijetí, antibiotickou léčbu před nebo při přijetí, výkony považované za vysoce rizikové pro zdravotní infekce jako je operace, zejména v období velké nestability, také endovaskulární výkony, jako je implantace katétru nebo extra- tělesná asistence (mimotělní membrána pro okysličení, Renal Replacement Therapy).

Zkoumáme terapeutické možnosti po stanovení diagnózy infekcí krevního řečiště, výběru antibiotika jako léčby a výsledku definovaného jako vyléčení nebo přežití po 28 dnech, což je období odpovídajících pacientů.