Validation des technologies de diagnostic moléculaire pour les patients atteints d'un cancer du poumon. (NIRVANA)

B. Cancer du poumon Le cancer du poumon non à petites cellules (NSCLC) est une cause fréquente de mortalité par cancer dans le monde. En 2007, 1,5 million de nouveaux cas de cancer du poumon ont été diagnostiqués dans le monde, dont environ 733 100 cas dans la région sud-américaine.6

Environ 85 % des cancers du poumon sont histologiquement définis comme non à petites cellules et les 14 % restants comme à petites cellules. La majorité des patients atteints de NSCLC présentent une maladie localement avancée inopérable (stade IIIB) ou métastatique (stade IV) pour laquelle aucun traitement curatif n'est encore disponible. Chez les patients nouvellement diagnostiqués avec un bon indice de performance, les chimiothérapies combinées à base de platine sont associées à une survie globale (SG) médiane de 7,4 à 9,9 mois. 7, 8, 9, 10, 11, 12 Par conséquent, de nouveaux agents dotés de nouveaux mécanismes d'action sont toujours désespérément nécessaires pour cette maladie grave potentiellement mortelle. 15,16

L'identification rapide et efficace des gènes pilotes clés dans le cancer du poumon non à petites cellules (NSCLC) devient de plus en plus importante.17 Les efforts de dépistage clinique ont révélé que les mutations les plus courantes dans les échantillons de cancer du poumon impliquent EGFR et KRAS, ainsi que 10 autres gènes qui montrent une prévalence de mutation dans 5 % ou moins des tumeurs. Le gène ALK est réarrangé chez environ 3 à 5 % des patients atteints de NSCLC et a fait l'objet d'intenses recherches fondamentales et cliniques, suggérant que la fréquence du réarrangement du gène est similaire chez les patients asiatiques et occidentaux.

ROS1 est un récepteur tyrosine kinase de la famille des récepteurs de l'insuline. Les réarrangements chromosomiques impliquant le gène ROS1 ont été décrits à l'origine dans les glioblastomes, où ROS1 (chromosome 6q22) est fusionné au gène FIG (chromosome 6q22 immédiatement adjacent à ROS1), 16 et il a été démontré qu'ils se transforment chez des souris transgéniques. 17 Plus récemment, des fusions ROS1 ont été identifiées comme des mutations conductrices potentielles dans une lignée cellulaire NSCLC (HCC78 ; SLC34A2-ROS1) et un échantillon de patient NSCLC (CD74-ROS1). 18 Ces fusions ont conduit à une activité kinase constitutive et ont été associées à une sensibilité in vitro et in vivo au crizotinib. En décembre 2013, 16 variantes différentes ont été trouvées.16, 17, 18

La présente étude est conçue pour faire progresser les méthodologies de tests moléculaires pour identifier les patients atteints de NSCLC ALK+ et ROS1+. Des méthodologies avancées de dépistage par séquençage de nouvelle génération seront utilisées pour identifier les patients NSCLC dont les tumeurs contiennent une inversion ou une translocation du gène ROS1 ou une translocation ALK.

Un test parallèle pour ALK+ par le test Abbott ALK FISH ou le test Ventana ALK IHC est nécessaire pour valider le test NGS dans tous les échantillons. Un test parallèle pour ROS1+ par le test Kreatech FISH ou le test D4D6 ROS1 IHC peut être nécessaire pour valider le test NGS dans tous les échantillons.