Caractérisation des biomarqueurs microbiens, immunitaires et épigénétiques pour le traitement du trouble dépressif majeur et de l'ECT

Toutes les procédures seront approuvées par le comité d'éthique du ZIV Helsinki. Recrutement et évaluation clinique : 40 patients atteints de TDM seront recrutés pour cette étude, ainsi que 20 participants en bonne santé appariés selon l'âge (en tant que groupe témoin). Un psychiatre non impliqué dans l'étude évaluera la qualification des patients pour la signature d'un consentement éclairé. Après la signature du consentement éclairé, des échantillons de selles et de sang (20 ml) seront prélevés sur tous les participants, pour une évaluation de la composition microbienne et des mesures sanguines de l'inflammation et de l'expression des protéines. Selon l'évaluation clinique des patients atteints de TDM diagnostiqués, le psychiatre recommandera un traitement ISRS ou ECT, et les patients seront divisés en conséquence par groupe de traitement. L'état clinique sera évalué par l'échelle d'évaluation de la dépression de Hamilton (HAM-D) notée par un psychiatre au point de départ (avant le traitement), après 4 semaines de traitement (car les patients du groupe ECT reçoivent en moyenne 8 à 12 traitements). Une baisse du score HAM-D sera considérée comme une amélioration clinique pouvant être attribuée au traitement. Les enquêteurs s'attendent à un taux de réussite du traitement de plus de 50 % pour l'ECT ​​selon notre expérience passée. Les enquêteurs prélèveront des échantillons de sang et de selles de patients atteints de TDM après 4 semaines de traitement, répéteront les mesures inflammatoires, d'expression protéique et microbienne et les compareront aux résultats initiaux. Les données supplémentaires enregistrées comprendront l'âge, l'IMC, l'origine ethnique, l'utilisation antérieure de médicaments et le nombre de traitements ECT ou de médicaments actuels.

Critères d'inclusion : patients atteints de TDM avec une dépression stable diagnostiquée cliniquement par un psychiatre selon l'échelle de dépression de Hamilton. L'âge des patients peut varier entre 18 et 80 ans, car la dépression est plus fréquente chez les personnes âgées, représentée par un âge médian de plus de 55 ans dans la population traitée au Ziv Medical Center.

Critères d'exclusion : Patients ayant reçu des antibiotiques au cours des 3 derniers mois précédant le prélèvement, patients souffrant de maladies gastro-intestinales chroniques ou d'autres maladies chroniques telles que les maladies auto-immunes ou le cancer, patients présentant des comorbidités telles que la schizophrénie.

Échantillons de sang : le sang total sera centrifugé et les échantillons de sérum seront conservés à -80 °C jusqu'à l'analyse des mesures inflammatoires. De plus, les lymphocytes seront purifiés, l'ARN sera extrait et une qRT-PCR sera effectuée pour tester l'expression des protéines immunitaires et des récepteurs (IL-1β, IL-1R1, IL-6, TNF-α, TNF1, TNF2) ainsi que d'autres protéines liées au MDD (par ex. récepteur cannabinoïde 1- CNR1, CD38, récepteur de l'ocytocine - OXTR, facteur neurotrophique dérivé du cerveau - BDNF).

Mesures inflammatoires dans le sérum : Nous mesurerons les niveaux de cytokines pro et anti-inflammatoires par des tests multiplex comprenant IL-1, IL-6, IL-8, IL-10 et TNFα à l'aide d'un kit Bio-Plex (Bio-Rad) . La plaque d'essai sera lue sur un lecteur multiplex MAGPIX (Bio-Rad).

Échantillons de selles : les échantillons de selles seront conservés dans les 4 heures suivant le prélèvement à -80 °C jusqu'au traitement.

Analyse microbienne : L'ADN microbien sera purifié à partir des selles et une bibliothèque d'ARNr 16S à code-barres de chaque sujet sera générée à partir de laquelle nous obtiendrons environ 300 000 lectures par échantillon à l'aide de la plateforme Illumina MiSeq (séquençage NGS) à la Faculté de médecine de l'Université Bar Ilan . Les séquences seront analysées par QIIME. De plus, l'ARN microbien sera extrait des selles afin de tester l'expression des gènes microbiens via la métatranscriptomique (séquençage NGS).

Analyse statistique : Tous les tests seront effectués à l'aide du logiciel statistique SPSS version 24 (SPSS Inc., Chicago, IL, USA).