Karakterisering av mikrobiella, immuna och epigenetiska biomarkörer för allvarlig depressiv sjukdom och ECT-behandling

Alla procedurer kommer att godkännas av ZIV Helsingfors etiska kommitté. Rekrytering och klinisk bedömning: 40 MDD-patienter kommer att rekryteras till denna studie, samt 20 friska åldersmatchade deltagare (som kontrollgrupp). En psykiater som inte är involverad i studien kommer att bedöma patienternas kvalifikationer för att underteckna informerat samtycke. Efter undertecknande av informerat samtycke kommer avförings- och blodprover (20 ml) att samlas in från alla deltagare, för bedömning av mikrobiell sammansättning och blodmätningar av inflammation och proteinuttryck. Enligt klinisk bedömning av de diagnostiserade MDD-patienterna kommer psykiatern att rekommendera SSRI- eller ECT-behandling, och patienterna kommer att delas upp i behandlingsgrupp. Klinisk status kommer att bedömas av Hamilton Depression Rating Scale (HAM-D) som bedöms av en psykiater vid startpunkten (före behandling), efter 4 veckors behandling (eftersom patienter i ECT-grupp får i genomsnitt 8-12 behandlingar). En sänkning av HAM-D-poängen kommer att betraktas som klinisk förbättring som kan tillskrivas behandlingen. Utredarna förväntar sig en behandlingsframgångsgrad på över 50 % för ECT enligt vår tidigare erfarenhet. Utredarna kommer att samla in blod- och avföringsprover från MDD-patienter efter 4 veckors behandling, upprepa inflammatoriska, proteinuttrycks- och mikrobiella mätningar och jämföra dem med initiala resultat. Ytterligare data som registreras kommer att omfatta ålder, BMI, etnicitet, tidigare läkemedelsanvändning och antal ECT-behandlingar eller aktuell medicinering.

Inklusionskriterier: MDD-patienter med stabil depression kliniskt diagnostiserade av en psykiater enligt Hamilton Depression Scale. Patientåldern kan variera mellan 18-80 år, eftersom depression är vanligare hos äldre personer som representeras av en medianålder på över 55 i den behandlade befolkningen vid Ziv Medical Center.

Uteslutningskriterier: Patienter som fått antibiotika under de senaste 3 månaderna före provtagning, patienter som lider av kroniska gastrointestinala sjukdomar eller andra kroniska sjukdomar som autoimmun eller cancer, patienter med samsjukligheter som schizofreni.

Blodprover: Helblod kommer att centrifugeras och serumprover kommer att hållas vid -80C fram till analys för inflammatoriska mätningar. Dessutom kommer lymfocyter att renas, RNA kommer att extraheras och qRT-PCR kommer att utföras för att testa immunprotein och receptoruttryck (IL-1β, IL-1R1, IL-6, TNF-α, TNF1, TNF2) samt ytterligare proteiner relaterade till MDD (t.ex. cannabinoidreceptor 1- CNR1, CD38, oxytocinreceptor-OXTR, hjärnhärledd neurotrofisk faktor - BDNF).

Inflammatoriska mätningar i serumet: Vi kommer att mäta nivåer av pro- och antiinflammatoriska cytokiner genom multiplextester inklusive IL-1, IL-6, IL-8, IL-10 och TNFα med hjälp av ett Bio-Plex-kit (Bio-Rad) . Analysplattan läses av på en MAGPIX multiplexläsare (Bio-Rad).

Avföringsprover: avföringsprover kommer att lagras inom 4 timmar från insamling vid -80C tills bearbetning.

Mikrobiell analys: Mikrobiellt DNA kommer att renas från avföring och ett streckkodat 16S rRNA-bibliotek från varje ämne kommer att genereras från vilket vi kommer att få ~300 000 läsningar per prov med hjälp av Illumina MiSeq-plattformen (NGS-sekvensering) vid Medicinska fakulteten, Bar Ilan University . Sekvenser kommer att analyseras av QIIME. Dessutom kommer mikrobiellt RNA att extraheras från avföring för att testa mikrobiellt genuttryck via metatranskriptomik (NGS-sekvensering).

Statistisk analys: Alla analyser kommer att utföras med hjälp av statistisk programvara SPSS version 24 (SPSS Inc., Chicago, IL, USA).