Charakterystyka biomarkerów mikrobiologicznych, immunologicznych i epigenetycznych w leczeniu dużych zaburzeń depresyjnych i EW

Wszystkie procedury zostaną zatwierdzone przez komisję etyczną ZIV Helsinki. Rekrutacja i ocena kliniczna: Do tego badania zostanie zrekrutowanych 40 pacjentów z MDD, a także 20 zdrowych uczestników w odpowiednim wieku (jako grupa kontrolna). Psychiatra niebiorący udziału w badaniu oceni kwalifikację pacjentów do podpisania świadomej zgody. Po podpisaniu świadomej zgody od wszystkich uczestników zostaną pobrane próbki kału i krwi (20 ml) w celu oceny składu mikrobiologicznego oraz pomiaru stanu zapalnego i ekspresji białek we krwi. Na podstawie oceny klinicznej pacjentów z rozpoznaną MDD psychiatra zaleci leczenie SSRI lub EW, a pacjenci zostaną odpowiednio podzieleni na grupy terapeutyczne. Stan kliniczny będzie oceniany na podstawie Skali Depresji Hamiltona (HAM-D) ocenianej przez psychiatrę na początku leczenia (przed leczeniem), po 4 tygodniach leczenia (ponieważ pacjenci z grupy EW otrzymują średnio 8-12 zabiegów). Obniżenie wyniku w skali HAM-D będzie uważane za poprawę kliniczną, którą można przypisać leczeniu. Według naszych dotychczasowych doświadczeń badacze spodziewają się, że skuteczność leczenia EW wyniesie ponad 50%. Badacze pobiorą próbki krwi i kału od pacjentów z MDD po ​​4 tygodniach leczenia, powtórzą pomiary stanu zapalnego, ekspresji białek i drobnoustrojów i porównają je z wynikami początkowymi. Dodatkowe rejestrowane dane będą obejmować wiek, BMI, pochodzenie etniczne, wcześniejsze stosowanie leków oraz liczbę zabiegów EW lub aktualnych leków.

Kryteria włączenia: Pacjenci z MDD ze stabilną depresją klinicznie zdiagnozowaną przez psychiatrę na podstawie Skali Depresji Hamiltona. Wiek pacjentów może wynosić od 18 do 80 lat, ponieważ depresja występuje częściej u osób starszych, co reprezentuje mediana wieku powyżej 55 lat w populacji leczonej w Centrum Medycznym Ziv.

Kryteria wykluczenia: Pacjenci otrzymujący antybiotyki w ciągu ostatnich 3 miesięcy przed pobraniem próbek, pacjenci cierpiący na przewlekłe choroby przewodu pokarmowego lub inne choroby przewlekłe, takie jak choroby autoimmunologiczne lub nowotwory, pacjenci z chorobami współistniejącymi, takimi jak schizofrenia.

Próbki krwi: Krew pełna zostanie odwirowana, a próbki surowicy będą przechowywane w temperaturze -80°C do czasu analizy pod kątem pomiarów stanu zapalnego. Dodatkowo limfocyty zostaną oczyszczone, wyekstrahowane RNA i przeprowadzone qRT-PCR w celu zbadania ekspresji białek immunologicznych i receptorów (IL-1β, IL-1R1, IL-6, TNF-α, TNF1, TNF2) oraz dodatkowych białka związane z MDD (np. receptor kannabinoidowy 1- CNR1, CD38, receptor oksytocyny- OXTR, neurotroficzny czynnik pochodzenia mózgowego - BDNF).

Pomiary stanu zapalnego w surowicy: Zmierzymy poziomy cytokin pro- i przeciwzapalnych za pomocą testów multipleksowych, w tym IL-1, IL-6, IL-8, IL-10 i TNFα za pomocą zestawu Bio-Plex (Bio-Rad) . Płytka testowa zostanie odczytana na multipleksowym czytniku MAGPIX (Bio-Rad).

Próbki kału: próbki kału będą przechowywane w ciągu 4 godzin od pobrania w temperaturze -80C do momentu przetworzenia.

Analiza mikrobiologiczna: DNA drobnoustrojów zostanie oczyszczone z kału i zostanie wygenerowana biblioteka rRNA 16S z kodem kreskowym od każdego pacjenta, z której uzyskamy ~ 300 000 odczytów na próbkę przy użyciu platformy Illumina MiSeq (sekwencjonowanie NGS) na Wydziale Lekarskim Uniwersytetu Bar Ilan . Sekwencje będą analizowane przez QIIME. Ponadto mikrobiologiczne RNA zostanie wyekstrahowane z kału w celu zbadania ekspresji genów drobnoustrojów za pomocą metatranskryptomiki (sekwencjonowanie NGS).

Analiza statystyczna: Wszystkie testy zostaną przeprowadzone przy użyciu oprogramowania statystycznego SPSS wersja 24 (SPSS Inc., Chicago, IL, USA).