Impact du virome intestinal sur la maladie intestinale inflammatoire pédiatrique (IVOIRE)

Au cours des dernières années, la dysbiose est apparue comme un déclencheur possible de l'inflammation intestinale dans les maladies inflammatoires de l'intestin (MICI) et une cible thérapeutique prometteuse. La diversité complexe du microbiote a été initialement mise en évidence par les nouveaux outils puissants de la génétique, dont le séquençage de nouvelle génération (NGS). Le NGS a permis de décrypter la composition des communautés bactériennes intestinales, mais aussi celle du virome intestinal. Depuis lors, la preuve d'une instabilité dynamique du virome entérique dans les MICI s'est considérablement accrue. Les patients atteints de MICI présentent une expansion des bactériophages (Caudovirales) associée à une diminution de la diversité bactérienne. De plus, la richesse en viromes intestinaux semble différer entre les patients atteints de la maladie de Crohn (MC) et de colite ulcéreuse (CU). Ces connaissances ouvrent la porte à de nouvelles approches diagnostiques, prédictives et thérapeutiques. Cependant, on sait peu de choses sur le virome intestinal des MICI pédiatriques en termes de variabilité et d'évolution sous l'influence de différents traitements (nutrition entérale exclusive, thérapie immunosuppressive et médicaments biologiques). Le but de cette étude est d'évaluer la diversité virale de la famille intestinale et l'abondance relative des eucaryotes et des procaryotes chez les patients pédiatriques atteints de MICI.