HIV-diverzitás és patogenezis a donor-recipiens klaszterekben

TERVEZÉSI NARRATÍV:

Az 1984 végén gyűjtött 200 000 véradó szérumból álló tároló HIV-1 elleni szűrése alapján a Transzfúzióbiztonsági Tanulmány 133 szeropozitív donort és 111 HIV-1-fertőzött transzfúziós recipienst azonosított és vont be a folyamatos nyomon követésbe. Ezek között szerepelt 38 „transzmissziós klaszter”, amelyek egy donorból és 1-6 kapcsolódó, fertőzött recipiensből, valamint négy esetben a fertőzött recipiensek szexuális partnereiből álltak. A fagyasztott sejtek és szérumok, amelyeket hat hónapos időközönként gyűjtöttek össze e klaszterek tagjaitól hat éven keresztül, rendelkezésre álltak a vizsgálathoz. A mintákhoz úgy fértek hozzá, hogy a sejtes DNS, a PCR-rel amplifikált HIV-1 szekvenciák és a vírusizolátumok altárait hozták létre ezen egyedi klaszterek jövőbeni vizsgálata céljából. A vizsgálatok kiterjedtek a szekvencia diverzitásának elemzésére a burok (env) V3, V4 és V5 hipervariábilis régiókban, mind az egyes fertőzött egyedeken belül, mind az egyes klaszterek és a különböző klaszterek különböző tagjai között. A PBMC-ből és a szérumból származó szekvenciadiverzitás-profilokat külön elemeztük, hogy megállapítsuk a különböző vérkomponensek közötti különbségeket minden egyes mintavételnél és az idő függvényében. A specifikus szekvenciavariánsok időbeli forgalmának mintázata (a vírus genotípusok evolúciója) korrelált a klinikai és immunológiai progresszióval.

Az ebben a rekordban felsorolt ​​vizsgálat befejezési dátuma a Protocol Registration and Results System (PRS) rekordba beírt "Befejezés dátuma" alapján történt.