Gruppo A StrePtococcus (GRASP)
Espressione genica negli isolati di streptococchi di gruppo A recuperati da pazienti portatori
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
L'obiettivo generale di questa indagine è comprendere le differenze negli streptococchi di gruppo A nei bambini con infezione acuta rispetto a quelli che sono portatori. L'ipotesi è che quando si trova nello stato di portatore, GAS esibisce profili trascrizionali unici che differiscono da quelli dello stato di infezione acuta. Gli investigatori si aspettano che i profili trascrizionali del GAS forniscano informazioni importanti sui cambiamenti che l'organismo subisce durante la transizione tra infezione acuta e trasporto.
Gli obiettivi specifici di questo studio sono:
- Raccogliere campioni longitudinali dei partecipanti dalle fasi acute e portatrici dell'infezione da GAS e confrontare i profili trascrittomici e le sequenze dell'intero genoma di GAS recuperate da tamponi faringei acuti e portatori ottenuti dagli stessi partecipanti.
- Valutare come i geni identificati differenzialmente espressi, o i polimorfismi genetici osservati, influenzano i modelli GAS di colonizzazione e patogenesi batterica.
Per fare ciò, gli investigatori identificheranno 12 bambini con faringite acuta dovuta a streptococco di gruppo A (GAS) che sono portatori faringei di GAS. Il 30% dei bambini dai 4 ai 16 anni con faringite acuta verificatasi tra ottobre e maggio avrà una coltura positiva o un test rapido di rilevamento dell'antigene per GAS. Circa l'8-10% di questi bambini con faringite e una coltura positiva o un test di rilevamento rapido dell'antigene (RADT) per GAS saranno portatori. Pertanto, 180 partecipanti dovranno essere iscritti.
Tipo di studio
Iscrizione (Stimato)
Contatti e Sedi
Contatto studio
- Nome: Cherie Schommer, BA
- Numero di telefono: 608-262-2631
- Email: schommer2@wisc.edu
Luoghi di studio
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Wisconsin
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Madison, Wisconsin, Stati Uniti, 53717
- Reclutamento
- UW Health Pediatric Clinics
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Investigatore principale:
- Gregory DeMuri, MD
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Sub-investigatore:
- Ellen R Wald, MD
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Contatto:
- Bridget Johnson, BAN,RN,CCRC
- Numero di telefono: 608-264-1400
- Email: bridget.johnson@pediatrics.wisc.edu
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Bambini dai 5 ai 15 anni
- Test rapido di rilevazione dell'antigene positivo per streptococco di gruppo A
- parlando inglese
Criteri di esclusione:
- Trattamento con antibiotici negli ultimi 30 giorni.
- Allergia agli antibiotici beta lattamici.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Coorte
- Prospettive temporali: Prospettiva
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
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Positivo allo streptococco rapido
I bambini saranno idonei per questo studio se hanno un'età compresa tra 5 e 15 anni e a cui è stata diagnosticata una faringite acuta causata da GAS con un test rapido di rilevamento dell'antigene (RADT) positivo.
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All'ingresso nello studio, a 14 giorni, e se il follow-up è positivo, sempre tra 14-21 giorni: coltura standard per GAS e analisi dell'mRNA.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Identificare i bambini che sono portatori faringei di streptococco di gruppo A
Lasso di tempo: 2 settimane
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Lo scopo specifico di questo studio è identificare 30 bambini con faringite acuta da streptococco di gruppo A (GAS) e 30 bambini portatori faringei di GAS. Il 30% dei bambini dai 4 ai 16 anni con faringite acuta verificatasi tra ottobre e maggio avrà una coltura positiva o un test rapido di rilevamento dell'antigene per GAS. Circa il 10-15% di questi bambini con faringite e una coltura positiva o un test rapido di rilevazione dell'antigene (RADT) per GAS saranno portatori |
2 settimane
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Investigatori
- Investigatore principale: Gregory DeMuri, MD, University of Wisconsin, Madison
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Bisno AL. Acute pharyngitis. N Engl J Med. 2001 Jan 18;344(3):205-11. doi: 10.1056/NEJM200101183440308.
- Carapetis JR, Steer AC, Mulholland EK, Weber M. The global burden of group A streptococcal diseases. Lancet Infect Dis. 2005 Nov;5(11):685-94. doi: 10.1016/S1473-3099(05)70267-X.
- Musser JM, Shelburne SA 3rd. A decade of molecular pathogenomic analysis of group A Streptococcus. J Clin Invest. 2009 Sep;119(9):2455-63. doi: 10.1172/JCI38095.
- Pichichero ME. Group A beta-hemolytic streptococcal infections. Pediatr Rev. 1998 Sep;19(9):291-302. doi: 10.1542/pir.19-9-291.
- Jiang H, Wong WH. Statistical inferences for isoform expression in RNA-Seq. Bioinformatics. 2009 Apr 15;25(8):1026-32. doi: 10.1093/bioinformatics/btp113. Epub 2009 Feb 25.
- Li J, Jiang H, Wong WH. Modeling non-uniformity in short-read rates in RNA-Seq data. Genome Biol. 2010;11(5):R50. doi: 10.1186/gb-2010-11-5-r50. Epub 2010 May 11.
- Anders S, Huber W. Differential expression analysis for sequence count data. Genome Biol. 2010;11(10):R106. doi: 10.1186/gb-2010-11-10-r106. Epub 2010 Oct 27.
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Completamento primario (Stimato)
Completamento dello studio (Stimato)
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Primo Inserito (Stimato)
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Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- 2015-1456 (Institutional Review Board - 5 year replacement)
- 2011-0058 (Altro identificatore: IRB number - replaced)
- A536700 (Altro identificatore: UW Madison)
- SMPH\PEDIATRICS\PEDIATRICS (Altro identificatore: UW Madison)
- 1R21AI147502-01 (Sovvenzione/contratto NIH degli Stati Uniti)
- Protocol Version 9/14/2023 (Altro identificatore: UW Madison)
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