すべての EBS ケースの計算ドラッグ リパーパシング
2024年2月11日 更新者:Joyce Teng
すべての単純性表皮水疱症 (EBS) 症例に対する計算薬物転用
この研究では、EBのすべてのサブタイプを持つ個人の水ぶくれのある皮膚と水ぶくれのない皮膚、および非EB被験者の正常な皮膚の遺伝子発現の違いを比較します。
すべての EB 創傷治癒を助け、痛みを軽減する可能性のある新薬を特定するために、最先端のコンピューター解析が実行されます。
研究者は、他の皮膚疾患または非皮膚疾患の治療にすでに承認されている薬剤に焦点を当てているため、EB の治療に転用されます。
医薬品開発は、実行に数十年かかる非常に費用のかかるプロセスです。
一方、ドラッグリパーパシングは、コストを大幅に削減し、効果的な治療法を臨床で使用するために必要な時間を短縮します。
今日まで、創傷治癒中の EB 患者の生理学的および免疫学的反応を標的とする特定の治療法はありません。
再利用された医薬品が市場で入手できるようになると、すべての EB 患者が治療に迅速にアクセスできるようになり、生活の質が向上します。
調査の概要
詳細な説明
表皮水疱症 (EB) のすべてのサブタイプに苦しんでいる患者のための遺伝子、細胞、およびタンパク質ベースの治療法が開発されていますが、新しい薬理学的治療法が緊急に必要とされています。
遺伝子発現を含む EB の分子変化を特徴付けると、新しい治療標的とそれらの標的を調節する薬剤を特定できます。
しかし、最も有望な創薬標的を特定するために遺伝子発現情報をふるいにかけることは、複雑なデータの課題です。
この研究の目標は、EB 患者に転用できる他の疾患に承認された既存の薬を評価および特定するための計算手法を特定することです。
この研究は、複数の組織にわたる健康な非 EB 患者と比較した EB 患者の遺伝子発現変化の前例のない特徴付けを行います。
検証済みの計算創薬プラットフォームを使用して、研究者は独自のアルゴリズムを使用して遺伝子発現と薬物データを分析します。
最初の 1 年で、EB 病状を治療する可能性が高い 10 の安全な薬のリストが特定されます。
発見された最も有望な薬は、クリニックの設定でテストされます。
研究の種類
観察的
入学 (推定)
60
連絡先と場所
このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。
研究連絡先
- 名前:Monica Martin
- 電話番号:650-723-0636
- メール:momartin@stanford.edu
研究場所
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California
-
Palo Alto、California、アメリカ、94304
- 募集
- Pediatric Dermatology Clinic at Stanford Children's Hospital
-
主任研究者:
- Joyce M Teng, MD, PhD
-
コンタクト:
- Monica Martin
- 電話番号:650-723-0636
- メール:PediatricDermStudy@stanford.edu
-
コンタクト:
- Elidia V Tafoya, MPH
- 電話番号:650-724-1982
- メール:PediatricDermStudy@stanford.edu
-
副調査官:
- Kavita Sarin, MD, PhD
-
-
参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
1年歳以上 (子、大人、高齢者)
健康ボランティアの受け入れ
はい
サンプリング方法
確率サンプル
調査対象母集団
-1)EB被験者の診断、または2)健康な非EB被験者のいずれかを有するすべての年齢の被験者
説明
包含基準:
- すべての年齢の対象
- EB 被験者のすべてのサブタイプの診断
- 健康な非 EB 被験者
- -組織および血液標本を収集するための研究訪問を完了する能力
除外基準:
- 妊娠、授乳
- 肝疾患の既往歴
- -潜在的に安全上のリスクを提示する可能性がある、および/または被験者からの組織採取を妨げる可能性のある、重篤な既知の併発疾患または感染症
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:コホート
- 時間の展望:見込みのある
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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実験グループ
EBと診断された被験者から血液および組織標本を採取します。
組織標本は、水ぶくれのある皮膚と水ぶくれのない皮膚から採取されます。
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EBと診断された被験者
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対照群
血液および組織標本は、非EBの健康な被験者から収集されます。
組織標本は、目立たない皮膚領域から採取されます。
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EBと診断された被験者
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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RNA シーケンシング (RNA-seq) と潜在的な創薬標的の計算プロファイリングを使用して、EB の遺伝子発現変化を特徴付けます
時間枠:1年間の修業を経て。
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バイオインフォマティクス アルゴリズムを使用して遺伝子発現の変化を特定し、計算進化アルゴリズム システムを使用した遺伝子発現変化の予測変調に基づいて、2000 を超える FDA 承認薬をレビューします。
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1年間の修業を経て。
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協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
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捜査官
- 主任研究者:Joyce M Teng, MD, PhD、Stanford University
出版物と役立つリンク
研究に関する情報を入力する責任者は、自発的にこれらの出版物を提供します。これらは、研究に関連するあらゆるものに関するものである可能性があります。
一般刊行物
- McLaren PJ, Mayne M, Rosser S, Moffatt T, Becker KG, Plummer FA, Fowke KR. Antigen-specific gene expression profiles of peripheral blood mononuclear cells do not reflect those of T-lymphocyte subsets. Clin Diagn Lab Immunol. 2004 Sep;11(5):977-82. doi: 10.1128/CDLI.11.5.977-982.2004.
- Sleasman JW, Leon BH, Aleixo LF, Rojas M, Goodenow MM. Immunomagnetic selection of purified monocyte and lymphocyte populations from peripheral blood mononuclear cells following cryopreservation. Clin Diagn Lab Immunol. 1997 Nov;4(6):653-8. doi: 10.1128/cdli.4.6.653-658.1997.
- Bray NL, Pimentel H, Melsted P, Pachter L. Near-optimal probabilistic RNA-seq quantification. Nat Biotechnol. 2016 May;34(5):525-7. doi: 10.1038/nbt.3519. Epub 2016 Apr 4. Erratum In: Nat Biotechnol. 2016 Aug 9;34(8):888.
- Robinson MD, McCarthy DJ, Smyth GK. edgeR: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data. Bioinformatics. 2010 Jan 1;26(1):139-40. doi: 10.1093/bioinformatics/btp616. Epub 2009 Nov 11.
- Law V, Knox C, Djoumbou Y, Jewison T, Guo AC, Liu Y, Maciejewski A, Arndt D, Wilson M, Neveu V, Tang A, Gabriel G, Ly C, Adamjee S, Dame ZT, Han B, Zhou Y, Wishart DS. DrugBank 4.0: shedding new light on drug metabolism. Nucleic Acids Res. 2014 Jan;42(Database issue):D1091-7. doi: 10.1093/nar/gkt1068. Epub 2013 Nov 6.
- Sugaya N, Kanai S, Furuya T. Dr. PIAS 2.0: an update of a database of predicted druggable protein-protein interactions. Database (Oxford). 2012 Oct 10;2012:bas034. doi: 10.1093/database/bas034. Print 2012.
- Subramanian A, Kuehn H, Gould J, Tamayo P, Mesirov JP. GSEA-P: a desktop application for Gene Set Enrichment Analysis. Bioinformatics. 2007 Dec 1;23(23):3251-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btm369. Epub 2007 Jul 20.
- Cohn HI, Teng JM. Advancement in management of epidermolysis bullosa. Curr Opin Pediatr. 2016 Aug;28(4):507-16. doi: 10.1097/MOP.0000000000000380.
- Uitto J, Bruckner-Tuderman L, Christiano AM, McGrath JA, Has C, South AP, Kopelan B, Robinson EC. Progress toward Treatment and Cure of Epidermolysis Bullosa: Summary of the DEBRA International Research Symposium EB2015. J Invest Dermatol. 2016 Feb;136(2):352-358. doi: 10.1016/j.jid.2015.10.050.
- Nystrom A, Thriene K, Mittapalli V, Kern JS, Kiritsi D, Dengjel J, Bruckner-Tuderman L. Losartan ameliorates dystrophic epidermolysis bullosa and uncovers new disease mechanisms. EMBO Mol Med. 2015 Sep;7(9):1211-28. doi: 10.15252/emmm.201505061.
- Wally V, Kitzmueller S, Lagler F, Moder A, Hitzl W, Wolkersdorfer M, Hofbauer P, Felder TK, Dornauer M, Diem A, Eiler N, Bauer JW. Topical diacerein for epidermolysis bullosa: a randomized controlled pilot study. Orphanet J Rare Dis. 2013 May 7;8:69. doi: 10.1186/1750-1172-8-69.
- Li J, Zheng S, Chen B, Butte AJ, Swamidass SJ, Lu Z. A survey of current trends in computational drug repositioning. Brief Bioinform. 2016 Jan;17(1):2-12. doi: 10.1093/bib/bbv020. Epub 2015 Mar 31.
- Low YS, Daugherty AC, Schroeder EA, Chen W, Seto T, Weber S, Lim M, Hastie T, Mathur M, Desai M, Farrington C, Radin AA, Sirota M, Kenkare P, Thompson CA, Yu PP, Gomez SL, Sledge GW Jr, Kurian AW, Shah NH. Synergistic drug combinations from electronic health records and gene expression. J Am Med Inform Assoc. 2017 May 1;24(3):565-576. doi: 10.1093/jamia/ocw161.
- Bchetnia M, Tremblay ML, Leclerc G, Duperee A, Powell J, McCuaig C, Morin C, Legendre-Guillemin V, Laprise C. Expression signature of epidermolysis bullosa simplex. Hum Genet. 2012 Mar;131(3):393-406. doi: 10.1007/s00439-011-1077-7. Epub 2011 Aug 30.
- Roth W, Reuter U, Wohlenberg C, Bruckner-Tuderman L, Magin TM. Cytokines as genetic modifiers in K5-/- mice and in human epidermolysis bullosa simplex. Hum Mutat. 2009 May;30(5):832-41. doi: 10.1002/humu.20981.
- Lee B, Geyfman M, Andersen B, Dai X. Analysis of gene expression in skin using laser capture microdissection. Methods Mol Biol. 2013;989:109-17. doi: 10.1007/978-1-62703-330-5_10.
- Lovendorf MB, Mitsui H, Zibert JR, Ropke MA, Hafner M, Dyring-Andersen B, Bonefeld CM, Krueger JG, Skov L. Laser capture microdissection followed by next-generation sequencing identifies disease-related microRNAs in psoriatic skin that reflect systemic microRNA changes in psoriasis. Exp Dermatol. 2015 Mar;24(3):187-93. doi: 10.1111/exd.12604.
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始 (実際)
2017年11月28日
一次修了 (推定)
2024年12月30日
研究の完了 (推定)
2024年12月31日
試験登録日
最初に提出
2017年8月21日
QC基準を満たした最初の提出物
2017年8月30日
最初の投稿 (実際)
2017年8月31日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (推定)
2024年2月13日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2024年2月11日
最終確認日
2024年2月1日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- 41142
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
いいえ
IPD プランの説明
現在のところ、他の研究者とデータを共有する予定はありません。
結果の測定が完了すると、研究チームは臨床試験全体の結果を公開します.gov
この脆弱な人口調査のためのコミュニティと研究者。
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
いいえ
米国FDA規制機器製品の研究
いいえ
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
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