- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT03269474
Computational Drug Repurposing for alle EBS-tilfælde
11. februar 2024 opdateret af: Joyce Teng
Computational Drug Repurposing for alle Epidermolysis Bullosa Simplex (EBS) tilfælde
Undersøgelsen vil sammenligne genekspressionsforskelle mellem blærer og ikke-blær hud fra individer med alle undertyper af EB, samt normal hud fra ikke-EB forsøgspersoner.
State of the art beregningsanalyse vil blive udført for at hjælpe med at identificere nye lægemidler, der kan hjælpe al EB sårheling og reducere smerte.
Forskere vil fokusere på lægemidler, der allerede er godkendt til behandling af andre dermatologiske eller ikke-dermatologiske sygdomme, og derfor genbruges til behandling af EB.
Udvikling af lægemidler er en meget dyr proces, der tager årtier at udføre.
Genbrug af lægemidler på den anden side reducerer omkostningerne betydeligt og forkorter den tid, der er nødvendig for at bringe effektive behandlinger til klinisk brug.
Til dato er der ingen specifik behandling rettet mod den fysiologiske og immunologiske respons hos EB-patienter under sårheling.
Markedstilgængeligheden af genbrugsmedicin vil give alle EB-patienter hurtig adgang til behandlinger og dermed forbedre deres livskvalitet.
Studieoversigt
Status
Rekruttering
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Selvom gen-, celle- og proteinbaserede terapier er under udvikling til patienter, der lider af alle undertyper af epidermolysis bullosa (EB), er der et stort behov for nye farmakologiske behandlinger.
Karakteriserende molekylære ændringer i EB, herunder genekspression, kan identificere nye terapeutiske mål og lægemidler, der modulerer disse mål.
Imidlertid er det en kompleks dataudfordring at sigte gennem genekspressionsinformation for at identificere de mest lovende lægemiddelmål.
Målet med undersøgelsen vil identificere en beregningsmæssig tilgang til at evaluere og identificere eksisterende lægemidler, der er godkendt til andre sygdomme, som kan genbruges til EB-patienter.
Studiet vil udføre en hidtil uset karakterisering af genekspressionsændringer hos EB-patienter sammenlignet med raske, ikke-EB-individer på tværs af flere væv.
Ved hjælp af en valideret computerbaseret lægemiddelopdagelsesplatform vil forskere analysere genekspression og lægemiddeldata ved hjælp af unikke algoritmer.
I det første år vil en liste med ti sikkerhedslægemidler, der er mere sandsynlige til at behandle EB-sygdomstilstanden, blive identificeret.
De mest lovende lægemidler, der opdages, vil derefter blive testet i klinikken.
Undersøgelsestype
Observationel
Tilmelding (Anslået)
60
Kontakter og lokationer
Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.
Studiekontakt
- Navn: Monica Martin
- Telefonnummer: 650-723-0636
- E-mail: momartin@stanford.edu
Studiesteder
-
-
California
-
Palo Alto, California, Forenede Stater, 94304
- Rekruttering
- Pediatric Dermatology Clinic at Stanford Children's Hospital
-
Ledende efterforsker:
- Joyce M Teng, MD, PhD
-
Kontakt:
- Monica Martin
- Telefonnummer: 650-723-0636
- E-mail: PediatricDermStudy@stanford.edu
-
Kontakt:
- Elidia V Tafoya, MPH
- Telefonnummer: 650-724-1982
- E-mail: PediatricDermStudy@stanford.edu
-
Underforsker:
- Kavita Sarin, MD, PhD
-
-
Deltagelseskriterier
Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
3 år og ældre (Barn, Voksen, Ældre voksen)
Tager imod sunde frivillige
Ja
Prøveudtagningsmetode
Sandsynlighedsprøve
Studiebefolkning
Individ i alle aldre med enten 1) en diagnose af EB-personer eller 2) raske, ikke-EB-personer
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Emner i alle aldre
- Diagnose af alle undertyper af EB-fag
- Sunde, ikke-EB-fag
- Evne til at gennemføre studiebesøg for at indsamle vævs- og blodprøver
Ekskluderingskriterier:
- Graviditet, amning
- Tidligere historie med leversygdom
- Alvorlig kendt samtidig medicinsk sygdom eller infektion, som potentielt kan udgøre en sikkerhedsrisiko og/eller forhindre vævsopsamling fra forsøgspersoner
Studieplan
Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kohorte
- Tidsperspektiver: Fremadrettet
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Forsøgsgruppe
Blod- og vævsprøver vil blive udtaget fra forsøgspersoner med en EB-diagnose.
Vævsprøver vil blive indsamlet fra blærer og hud uden blærer.
|
Forsøgspersoner med EB-diagnose
|
|
Kontrolgruppe
Blod- og vævsprøver vil blive udtaget fra raske forsøgspersoner med ikke-EB.
Vævsprøver vil blive indsamlet fra et upåfaldende hudområde.
|
Forsøgspersoner med EB-diagnose
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Karakteriser genekspressionsændringer i EB ved hjælp af RNA-sekventering (RNA-seq) og Computational Profiling Potential Drug Targets
Tidsramme: Gennem afslutning af studiet på 1 år.
|
Brug af bioinformatiske algoritmer til at identificere ændringer i genekspression og gennemgang af over 2000 FDA-godkendte lægemidler baseret på forudsagt modulering af genekspressionsændringer ved hjælp af et beregningsmæssigt evolutionært algoritmesystem.
|
Gennem afslutning af studiet på 1 år.
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.
Sponsor
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Joyce M Teng, MD, PhD, Stanford University
Publikationer og nyttige links
Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.
Generelle publikationer
- McLaren PJ, Mayne M, Rosser S, Moffatt T, Becker KG, Plummer FA, Fowke KR. Antigen-specific gene expression profiles of peripheral blood mononuclear cells do not reflect those of T-lymphocyte subsets. Clin Diagn Lab Immunol. 2004 Sep;11(5):977-82. doi: 10.1128/CDLI.11.5.977-982.2004.
- Sleasman JW, Leon BH, Aleixo LF, Rojas M, Goodenow MM. Immunomagnetic selection of purified monocyte and lymphocyte populations from peripheral blood mononuclear cells following cryopreservation. Clin Diagn Lab Immunol. 1997 Nov;4(6):653-8. doi: 10.1128/cdli.4.6.653-658.1997.
- Bray NL, Pimentel H, Melsted P, Pachter L. Near-optimal probabilistic RNA-seq quantification. Nat Biotechnol. 2016 May;34(5):525-7. doi: 10.1038/nbt.3519. Epub 2016 Apr 4. Erratum In: Nat Biotechnol. 2016 Aug 9;34(8):888.
- Robinson MD, McCarthy DJ, Smyth GK. edgeR: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data. Bioinformatics. 2010 Jan 1;26(1):139-40. doi: 10.1093/bioinformatics/btp616. Epub 2009 Nov 11.
- Law V, Knox C, Djoumbou Y, Jewison T, Guo AC, Liu Y, Maciejewski A, Arndt D, Wilson M, Neveu V, Tang A, Gabriel G, Ly C, Adamjee S, Dame ZT, Han B, Zhou Y, Wishart DS. DrugBank 4.0: shedding new light on drug metabolism. Nucleic Acids Res. 2014 Jan;42(Database issue):D1091-7. doi: 10.1093/nar/gkt1068. Epub 2013 Nov 6.
- Sugaya N, Kanai S, Furuya T. Dr. PIAS 2.0: an update of a database of predicted druggable protein-protein interactions. Database (Oxford). 2012 Oct 10;2012:bas034. doi: 10.1093/database/bas034. Print 2012.
- Subramanian A, Kuehn H, Gould J, Tamayo P, Mesirov JP. GSEA-P: a desktop application for Gene Set Enrichment Analysis. Bioinformatics. 2007 Dec 1;23(23):3251-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btm369. Epub 2007 Jul 20.
- Cohn HI, Teng JM. Advancement in management of epidermolysis bullosa. Curr Opin Pediatr. 2016 Aug;28(4):507-16. doi: 10.1097/MOP.0000000000000380.
- Uitto J, Bruckner-Tuderman L, Christiano AM, McGrath JA, Has C, South AP, Kopelan B, Robinson EC. Progress toward Treatment and Cure of Epidermolysis Bullosa: Summary of the DEBRA International Research Symposium EB2015. J Invest Dermatol. 2016 Feb;136(2):352-358. doi: 10.1016/j.jid.2015.10.050.
- Nystrom A, Thriene K, Mittapalli V, Kern JS, Kiritsi D, Dengjel J, Bruckner-Tuderman L. Losartan ameliorates dystrophic epidermolysis bullosa and uncovers new disease mechanisms. EMBO Mol Med. 2015 Sep;7(9):1211-28. doi: 10.15252/emmm.201505061.
- Wally V, Kitzmueller S, Lagler F, Moder A, Hitzl W, Wolkersdorfer M, Hofbauer P, Felder TK, Dornauer M, Diem A, Eiler N, Bauer JW. Topical diacerein for epidermolysis bullosa: a randomized controlled pilot study. Orphanet J Rare Dis. 2013 May 7;8:69. doi: 10.1186/1750-1172-8-69.
- Li J, Zheng S, Chen B, Butte AJ, Swamidass SJ, Lu Z. A survey of current trends in computational drug repositioning. Brief Bioinform. 2016 Jan;17(1):2-12. doi: 10.1093/bib/bbv020. Epub 2015 Mar 31.
- Low YS, Daugherty AC, Schroeder EA, Chen W, Seto T, Weber S, Lim M, Hastie T, Mathur M, Desai M, Farrington C, Radin AA, Sirota M, Kenkare P, Thompson CA, Yu PP, Gomez SL, Sledge GW Jr, Kurian AW, Shah NH. Synergistic drug combinations from electronic health records and gene expression. J Am Med Inform Assoc. 2017 May 1;24(3):565-576. doi: 10.1093/jamia/ocw161.
- Bchetnia M, Tremblay ML, Leclerc G, Duperee A, Powell J, McCuaig C, Morin C, Legendre-Guillemin V, Laprise C. Expression signature of epidermolysis bullosa simplex. Hum Genet. 2012 Mar;131(3):393-406. doi: 10.1007/s00439-011-1077-7. Epub 2011 Aug 30.
- Roth W, Reuter U, Wohlenberg C, Bruckner-Tuderman L, Magin TM. Cytokines as genetic modifiers in K5-/- mice and in human epidermolysis bullosa simplex. Hum Mutat. 2009 May;30(5):832-41. doi: 10.1002/humu.20981.
- Lee B, Geyfman M, Andersen B, Dai X. Analysis of gene expression in skin using laser capture microdissection. Methods Mol Biol. 2013;989:109-17. doi: 10.1007/978-1-62703-330-5_10.
- Lovendorf MB, Mitsui H, Zibert JR, Ropke MA, Hafner M, Dyring-Andersen B, Bonefeld CM, Krueger JG, Skov L. Laser capture microdissection followed by next-generation sequencing identifies disease-related microRNAs in psoriatic skin that reflect systemic microRNA changes in psoriasis. Exp Dermatol. 2015 Mar;24(3):187-93. doi: 10.1111/exd.12604.
Datoer for undersøgelser
Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
28. november 2017
Primær færdiggørelse (Anslået)
30. december 2024
Studieafslutning (Anslået)
31. december 2024
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
21. august 2017
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
30. august 2017
Først opslået (Faktiske)
31. august 2017
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Anslået)
13. februar 2024
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
11. februar 2024
Sidst verificeret
1. februar 2024
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 41142
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
INGEN
IPD-planbeskrivelse
På nuværende tidspunkt er der ingen planer om at dele dataene med andre forskere.
Når resultatmålene er opnået, vil forskerholdet offentliggøre resultater for hele clinicaltrials.gov
samfund og forskere til denne sårbare befolkningsundersøgelse.
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Ingen
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Ingen
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Forsøgsgruppe
-
Çankırı Karatekin UniversityAfsluttetHjertefejl | Nyresvigt | Gastro esophageal refluks | Copd | Intensiv afdelings syndromKalkun
-
University of ParmaAfsluttetMotorisk aktivitet | Hemiplegisk cerebral pareseItalien
-
Hacettepe UniversityAfsluttetEffekten af Humeral Head Depressor Muscle Co-Activation Training i form af funktionelle resultaterKirurgi | Rotator Cuff RiverKalkun
-
Riphah International UniversityAfsluttet
-
University Hospital, CaenAssociation Francaise de ChirurgieIkke rekrutterer endnuDivertikulær sygdom i venstre side af tyktarmen
-
Otolith LabsMCRAAfsluttetBPPV | Svimmelhed | Godartet Paroxysmal Positionel Vertigo | Vestibulær migræne | Vestibulær lidelse | Menieres sygdom | Ménières Vertigo | Labrynthitis | Migræne Associated Vertigo | Ukompenseret ensidig vestibulopatiForenede Stater
-
University of TorontoCanadian Institutes of Health Research (CIHR)RekrutteringStillesiddende adfærd | Metabolisk forstyrrelseCanada
-
Centro de Atenção ao Assoalho PélvicoIndústria Brasileira Equipamentos Médicos - IBRAMEDRekrutteringErektil dysfunktionBrasilien
-
Samsung Medical CenterRekrutteringArtroplastik, udskiftning, skulder | Omvendt total skulderplastikKorea, Republikken