- ICH GCP
- Реестр клинических исследований США
- Клиническое испытание NCT03269474
Вычислительное перепрофилирование лекарств для всех случаев EBS
11 февраля 2024 г. обновлено: Joyce Teng
Вычислительное перепрофилирование лекарств для всех случаев простого буллезного эпидермолиза (EBS)
В исследовании будут сравниваться различия в экспрессии генов между кожей с волдырями и без волдырей у людей со всеми подтипами БЭ, а также с нормальной кожей у субъектов без БЭ.
Будет проведен современный вычислительный анализ, чтобы помочь определить новые лекарства, которые могут помочь заживлению всех ран БЭ и уменьшить боль.
Исследователи сосредоточатся на препаратах, которые уже были одобрены для лечения других дерматологических или недерматологических заболеваний и, следовательно, могут быть перепрофилированы для лечения БЭ.
Разработка лекарств — очень дорогой процесс, на выполнение которого уходят десятилетия.
С другой стороны, перепрофилирование лекарств значительно снижает стоимость и сокращает время, необходимое для доведения эффективных методов лечения до клинического применения.
На сегодняшний день не существует специфического лечения, направленного на физиологический и иммунологический ответ у пациентов с БЭ во время заживления ран.
Наличие на рынке перепрофилированных препаратов обеспечит всем пациентам с БЭ быстрый доступ к лечению, что улучшит качество их жизни.
Обзор исследования
Статус
Рекрутинг
Условия
Вмешательство/лечение
Подробное описание
Хотя генные, клеточные и белковые методы лечения находятся в стадии разработки для пациентов, страдающих всеми подтипами буллезного эпидермолиза (БЭ), остро нуждаются в новых фармакологических методах лечения.
Характеристика молекулярных изменений при БЭ, включая экспрессию генов, может выявить новые терапевтические мишени и препараты, которые модулируют эти мишени.
Тем не менее, просеивание информации об экспрессии генов для определения наиболее перспективных мишеней для лекарств является сложной задачей.
Целью исследования будет определение вычислительного подхода для оценки и определения существующих лекарств, одобренных для лечения других заболеваний, которые можно перепрофилировать для пациентов с БЭ.
В ходе исследования будет проведена беспрецедентная характеристика изменений экспрессии генов у пациентов с БЭ по сравнению со здоровыми людьми без БЭ в различных тканях.
Используя проверенную вычислительную платформу для обнаружения лекарств, исследователи будут анализировать экспрессию генов и данные о лекарствах, используя уникальные алгоритмы.
В течение первого года будет определен список из десяти безопасных препаратов, которые с наибольшей вероятностью помогут в лечении болезненного состояния БЭ.
Обнаруженные наиболее многообещающие лекарства затем будут испытаны в условиях клиники.
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Оцененный)
60
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Контакты исследования
- Имя: Monica Martin
- Номер телефона: 650-723-0636
- Электронная почта: momartin@stanford.edu
Места учебы
-
-
California
-
Palo Alto, California, Соединенные Штаты, 94304
- Рекрутинг
- Pediatric Dermatology Clinic at Stanford Children's Hospital
-
Главный следователь:
- Joyce M Teng, MD, PhD
-
Контакт:
- Monica Martin
- Номер телефона: 650-723-0636
- Электронная почта: PediatricDermStudy@stanford.edu
-
Контакт:
- Elidia V Tafoya, MPH
- Номер телефона: 650-724-1982
- Электронная почта: PediatricDermStudy@stanford.edu
-
Младший исследователь:
- Kavita Sarin, MD, PhD
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
3 года и старше (Ребенок, Взрослый, Пожилой взрослый)
Принимает здоровых добровольцев
Да
Метод выборки
Вероятностная выборка
Исследуемая популяция
Субъекты всех возрастов с 1) диагнозом БЭ или 2) здоровыми субъектами без БЭ.
Описание
Критерии включения:
- Субъекты всех возрастов
- Диагностика всех подтипов БЭ
- Здоровые субъекты без EB
- Возможность завершить учебный визит для сбора образцов тканей и крови
Критерий исключения:
- Беременность, кормление грудью
- Заболевания печени в анамнезе
- Серьезное известное сопутствующее заболевание или инфекция, которые потенциально могут представлять угрозу безопасности и/или препятствовать сбору тканей у субъектов.
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Когорта
- Временные перспективы: Перспективный
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Экспериментальная группа
Образцы крови и тканей будут взяты у субъектов с диагнозом БЭ.
Образец ткани берут с кожи с волдырями и без волдырей.
|
Субъекты с диагнозом БЭ
|
|
Контрольная группа
Образцы крови и тканей будут взяты у здоровых людей, не страдающих БЭ.
Образец ткани будет взят с незаметного участка кожи.
|
Субъекты с диагнозом БЭ
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Охарактеризовать изменения экспрессии генов при БЭ с помощью секвенирования РНК (RNA-seq) и компьютерного профилирования потенциальных мишеней для лекарств.
Временное ограничение: По окончании обучения за 1 год.
|
Использование биоинформационных алгоритмов для выявления изменений в экспрессии генов и обзор более 2000 одобренных FDA препаратов на основе предсказанной модуляции изменений экспрессии генов с использованием системы вычислительных эволюционных алгоритмов.
|
По окончании обучения за 1 год.
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Joyce M Teng, MD, PhD, Stanford University
Публикации и полезные ссылки
Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.
Общие публикации
- McLaren PJ, Mayne M, Rosser S, Moffatt T, Becker KG, Plummer FA, Fowke KR. Antigen-specific gene expression profiles of peripheral blood mononuclear cells do not reflect those of T-lymphocyte subsets. Clin Diagn Lab Immunol. 2004 Sep;11(5):977-82. doi: 10.1128/CDLI.11.5.977-982.2004.
- Sleasman JW, Leon BH, Aleixo LF, Rojas M, Goodenow MM. Immunomagnetic selection of purified monocyte and lymphocyte populations from peripheral blood mononuclear cells following cryopreservation. Clin Diagn Lab Immunol. 1997 Nov;4(6):653-8. doi: 10.1128/cdli.4.6.653-658.1997.
- Bray NL, Pimentel H, Melsted P, Pachter L. Near-optimal probabilistic RNA-seq quantification. Nat Biotechnol. 2016 May;34(5):525-7. doi: 10.1038/nbt.3519. Epub 2016 Apr 4. Erratum In: Nat Biotechnol. 2016 Aug 9;34(8):888.
- Robinson MD, McCarthy DJ, Smyth GK. edgeR: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data. Bioinformatics. 2010 Jan 1;26(1):139-40. doi: 10.1093/bioinformatics/btp616. Epub 2009 Nov 11.
- Law V, Knox C, Djoumbou Y, Jewison T, Guo AC, Liu Y, Maciejewski A, Arndt D, Wilson M, Neveu V, Tang A, Gabriel G, Ly C, Adamjee S, Dame ZT, Han B, Zhou Y, Wishart DS. DrugBank 4.0: shedding new light on drug metabolism. Nucleic Acids Res. 2014 Jan;42(Database issue):D1091-7. doi: 10.1093/nar/gkt1068. Epub 2013 Nov 6.
- Sugaya N, Kanai S, Furuya T. Dr. PIAS 2.0: an update of a database of predicted druggable protein-protein interactions. Database (Oxford). 2012 Oct 10;2012:bas034. doi: 10.1093/database/bas034. Print 2012.
- Subramanian A, Kuehn H, Gould J, Tamayo P, Mesirov JP. GSEA-P: a desktop application for Gene Set Enrichment Analysis. Bioinformatics. 2007 Dec 1;23(23):3251-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btm369. Epub 2007 Jul 20.
- Cohn HI, Teng JM. Advancement in management of epidermolysis bullosa. Curr Opin Pediatr. 2016 Aug;28(4):507-16. doi: 10.1097/MOP.0000000000000380.
- Uitto J, Bruckner-Tuderman L, Christiano AM, McGrath JA, Has C, South AP, Kopelan B, Robinson EC. Progress toward Treatment and Cure of Epidermolysis Bullosa: Summary of the DEBRA International Research Symposium EB2015. J Invest Dermatol. 2016 Feb;136(2):352-358. doi: 10.1016/j.jid.2015.10.050.
- Nystrom A, Thriene K, Mittapalli V, Kern JS, Kiritsi D, Dengjel J, Bruckner-Tuderman L. Losartan ameliorates dystrophic epidermolysis bullosa and uncovers new disease mechanisms. EMBO Mol Med. 2015 Sep;7(9):1211-28. doi: 10.15252/emmm.201505061.
- Wally V, Kitzmueller S, Lagler F, Moder A, Hitzl W, Wolkersdorfer M, Hofbauer P, Felder TK, Dornauer M, Diem A, Eiler N, Bauer JW. Topical diacerein for epidermolysis bullosa: a randomized controlled pilot study. Orphanet J Rare Dis. 2013 May 7;8:69. doi: 10.1186/1750-1172-8-69.
- Li J, Zheng S, Chen B, Butte AJ, Swamidass SJ, Lu Z. A survey of current trends in computational drug repositioning. Brief Bioinform. 2016 Jan;17(1):2-12. doi: 10.1093/bib/bbv020. Epub 2015 Mar 31.
- Low YS, Daugherty AC, Schroeder EA, Chen W, Seto T, Weber S, Lim M, Hastie T, Mathur M, Desai M, Farrington C, Radin AA, Sirota M, Kenkare P, Thompson CA, Yu PP, Gomez SL, Sledge GW Jr, Kurian AW, Shah NH. Synergistic drug combinations from electronic health records and gene expression. J Am Med Inform Assoc. 2017 May 1;24(3):565-576. doi: 10.1093/jamia/ocw161.
- Bchetnia M, Tremblay ML, Leclerc G, Duperee A, Powell J, McCuaig C, Morin C, Legendre-Guillemin V, Laprise C. Expression signature of epidermolysis bullosa simplex. Hum Genet. 2012 Mar;131(3):393-406. doi: 10.1007/s00439-011-1077-7. Epub 2011 Aug 30.
- Roth W, Reuter U, Wohlenberg C, Bruckner-Tuderman L, Magin TM. Cytokines as genetic modifiers in K5-/- mice and in human epidermolysis bullosa simplex. Hum Mutat. 2009 May;30(5):832-41. doi: 10.1002/humu.20981.
- Lee B, Geyfman M, Andersen B, Dai X. Analysis of gene expression in skin using laser capture microdissection. Methods Mol Biol. 2013;989:109-17. doi: 10.1007/978-1-62703-330-5_10.
- Lovendorf MB, Mitsui H, Zibert JR, Ropke MA, Hafner M, Dyring-Andersen B, Bonefeld CM, Krueger JG, Skov L. Laser capture microdissection followed by next-generation sequencing identifies disease-related microRNAs in psoriatic skin that reflect systemic microRNA changes in psoriasis. Exp Dermatol. 2015 Mar;24(3):187-93. doi: 10.1111/exd.12604.
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
28 ноября 2017 г.
Первичное завершение (Оцененный)
30 декабря 2024 г.
Завершение исследования (Оцененный)
31 декабря 2024 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
21 августа 2017 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
30 августа 2017 г.
Первый опубликованный (Действительный)
31 августа 2017 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Оцененный)
13 февраля 2024 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
11 февраля 2024 г.
Последняя проверка
1 февраля 2024 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
- Врожденные аномалии
- Генетические заболевания, врожденные
- Заболевания соединительной ткани
- Кожные заболевания, везикулобуллезный
- Аномалии кожи
- Коллагеновые заболевания
- Кожные заболевания
- Кожные заболевания, генетические
- Буллезный эпидермолиз
- Дистрофический буллезный эпидермолиз
- Простой буллезный эпидермолиз
- Буллезный эпидермолиз, узловой
Другие идентификационные номера исследования
- 41142
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
НЕТ
Описание плана IPD
На данный момент нет планов делиться данными с другими исследователями.
После того, как будут определены результаты, исследовательская группа опубликует результаты для всего сайта Clinicaltrials.gov.
сообщества и исследователей для этого исследования уязвимых групп населения.
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .
Клинические исследования Здоровый
-
Biotie Therapies Inc.PRA Health Sciences; Tandem Labs; Xceleron IncЗавершенныйН/Д, как Healthy VolunteersНидерланды
-
NW PharmaTech LtdЗавершенныйПК в Healthy VolunteersСоединенное Королевство
-
PharmaEssentiaNovotech CROЗавершенныйПК в Healthy VolunteersТайвань
-
Newcastle UniversityЗавершенныйGI гликемический индекс здоровых добровольцев | Гликемическая нагрузка GL Healthy VolunteersСоединенное Королевство
-
Drugs for Neglected DiseasesSanofiЗавершенныйПК в Healthy VolunteersФранция
-
CEN BiotechCEN Nutriment; Biovet Conseil; Amadeite SASЗавершенныйАнгедония в Healthy Volunteers
-
Jennifer MitchellЕще не набираютПожилые люди (50-90 лет) | Ангедония в Healthy VolunteersСоединенные Штаты
Клинические исследования Экспериментальная группа
-
McGill UniversityЗавершенный
-
University of BernЗавершенныйЗдоровый | Когнитивные нарушения | Легкое когнитивное нарушение | Приобретенная черепно-мозговая травмаШвейцария
-
General Hospital of Ningxia Medical UniversityЕще не набираютПослеоперационный делирий | Послеоперационная когнитивная дисфункция
-
Tarsus UniversityРекрутинг
-
Federal University of VicosaЗавершенныйТактический индекс | Индекс критического мышленияКолумбия
-
Riphah International UniversityЕще не набираютБоль в пояснице | Стеноз позвоночного каналаПакистан
-
Batman UniversityЗавершенныйМенопауза | Тучные пациенты | Качество жизни и менопауза | Упражнения ПилатесТурция
-
University of BurgundyЗавершенный
-
Izmir Democracy UniversityРекрутинг