Laskennallinen lääkkeiden uudelleenkäyttö kaikkiin EBS-tapauksiin
sunnuntai 11. helmikuuta 2024 päivittänyt: Joyce Teng
Laskennallinen lääkkeiden uudelleenkäyttö kaikkiin Epidermolysis Bullosa Simplex (EBS) -tapauksiin
Tutkimuksessa verrataan geenien ilmentymisen eroja rakkuloituneen ja ei-rakkuloituneen ihon välillä henkilöillä, joilla on kaikki EB:n alatyypit, sekä normaalin ihon välillä ei-EB-potilailla.
Huippuluokan laskennallinen analyysi tehdään uusien lääkkeiden tunnistamiseksi, jotka voivat auttaa kaikkia EB-haavojen paranemista ja vähentää kipua.
Tutkijat keskittyvät lääkkeisiin, jotka on jo hyväksytty muiden dermatologisten tai ei-dermatologisten sairauksien hoitoon ja jotka on siksi tarkoitettu uudelleen käytettäväksi EB:n hoitoon.
Lääkekehitys on erittäin kallis prosessi, joka kestää vuosikymmeniä.
Lääkkeiden uudelleenkäyttö puolestaan vähentää merkittävästi kustannuksia ja lyhentää aikaa, joka tarvitaan tehokkaiden hoitojen tuomiseen kliiniseen käyttöön.
Toistaiseksi ei ole olemassa erityistä hoitoa, joka kohdistuisi EB-potilaiden fysiologiaan ja immunologiseen vasteeseen haavan paranemisen aikana.
Uudelleenkäyttöisten lääkkeiden saatavuus markkinoilla tarjoaa kaikille EB-potilaille nopean pääsyn hoitoihin, mikä parantaa heidän elämänlaatuaan.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Rekrytointi
Ehdot
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Vaikka geeni-, solu- ja proteiinipohjaisia hoitoja kehitetään potilaille, jotka kärsivät kaikista epidermolysis bullosan (EB) alatyypeistä, uusia farmakologisia hoitoja tarvitaan kipeästi.
EB:n molekyylimuutosten karakterisointi, mukaan lukien geeniekspressio, voi tunnistaa uusia terapeuttisia kohteita ja lääkkeitä, jotka moduloivat näitä kohteita.
Geeniekspressiotietojen seulominen lupaavimpien lääkekohteiden tunnistamiseksi on kuitenkin monimutkainen datahaaste.
Tutkimuksen tavoitteena on tunnistaa laskennallinen lähestymistapa arvioida ja tunnistaa olemassa olevia muihin sairauksiin hyväksyttyjä lääkkeitä, joita voidaan käyttää uudelleen EB-potilaille.
Tutkimus suorittaa ennennäkemättömän karakterisoinnin geenien ilmentymisen muutoksista EB-potilailla verrattuna terveisiin, ei-EB-henkilöihin useissa kudoksissa.
Validoidun laskennallisen lääkekehitysalustan avulla tutkijat analysoivat geenien ilmentymistä ja lääketietoja käyttämällä ainutlaatuisia algoritmeja.
Ensimmäisenä vuonna tunnistetaan kymmenen turvalääkettä, jotka todennäköisemmin hoitavat EB-tautitilan.
Lupaavimmat löydetyt lääkkeet testataan sitten klinikalla.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
60
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskeluyhteys
- Nimi: Monica Martin
- Puhelinnumero: 650-723-0636
- Sähköposti: momartin@stanford.edu
Opiskelupaikat
-
-
California
-
Palo Alto, California, Yhdysvallat, 94304
- Rekrytointi
- Pediatric Dermatology Clinic at Stanford Children's Hospital
-
Päätutkija:
- Joyce M Teng, MD, PhD
-
Ottaa yhteyttä:
- Monica Martin
- Puhelinnumero: 650-723-0636
- Sähköposti: PediatricDermStudy@stanford.edu
-
Ottaa yhteyttä:
- Elidia V Tafoya, MPH
- Puhelinnumero: 650-724-1982
- Sähköposti: PediatricDermStudy@stanford.edu
-
Alatutkija:
- Kavita Sarin, MD, PhD
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
3 vuotta ja vanhemmat (Lapsi, Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Joo
Näytteenottomenetelmä
Todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Kaiken ikäiset henkilöt, joilla on joko 1) EB-potilaiden diagnoosi tai 2) terveet, ei-EB-potilaat
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Kaiken ikäisiä aiheita
- EB-potilaiden kaikkien alatyyppien diagnoosi
- Terveet, ei-EB-kohteet
- Kyky suorittaa opintokäynti kudos- ja verinäytteiden keräämiseksi
Poissulkemiskriteerit:
- Raskaus, imetys
- Aikaisempi maksasairaus
- Vakava tunnettu samanaikainen lääketieteellinen sairaus tai infektio, joka saattaa aiheuttaa turvallisuusriskin ja/tai estää kudosten keräämisen koehenkilöiltä
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Kohortti
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Kokeellinen ryhmä
Veri- ja kudosnäyte otetaan koehenkilöiltä, joilla on EB-diagnoosi.
Kudosnäyte otetaan rakkulliselta ja rakkuloimattomalta iholta.
|
Koehenkilöt, joilla on EB-diagnoosi
|
|
Ohjausryhmä
Veri- ja kudosnäyte otetaan terveiltä henkilöiltä, joilla ei ole EB.
Kudosnäyte otetaan huomaamattomalta ihoalueelta.
|
Koehenkilöt, joilla on EB-diagnoosi
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Karakterisoi geenin ilmentymisen muutoksia EB:ssä käyttämällä RNA-sekvensointia (RNA-seq) ja laskennallista profilointia mahdollisten lääkekohteiden avulla
Aikaikkuna: Opintojen suorittamisen kautta 1 vuodessa.
|
Bioinformaattisten algoritmien käyttö geenien ilmentymisen muutosten tunnistamiseen ja yli 2000 FDA:n hyväksymän lääkkeen tarkastelu perustuen geeniekspression muutosten ennustettuun modulaatioon laskennallisen evoluutioalgoritmijärjestelmän avulla.
|
Opintojen suorittamisen kautta 1 vuodessa.
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Joyce M Teng, MD, PhD, Stanford University
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.
Yleiset julkaisut
- McLaren PJ, Mayne M, Rosser S, Moffatt T, Becker KG, Plummer FA, Fowke KR. Antigen-specific gene expression profiles of peripheral blood mononuclear cells do not reflect those of T-lymphocyte subsets. Clin Diagn Lab Immunol. 2004 Sep;11(5):977-82. doi: 10.1128/CDLI.11.5.977-982.2004.
- Sleasman JW, Leon BH, Aleixo LF, Rojas M, Goodenow MM. Immunomagnetic selection of purified monocyte and lymphocyte populations from peripheral blood mononuclear cells following cryopreservation. Clin Diagn Lab Immunol. 1997 Nov;4(6):653-8. doi: 10.1128/cdli.4.6.653-658.1997.
- Bray NL, Pimentel H, Melsted P, Pachter L. Near-optimal probabilistic RNA-seq quantification. Nat Biotechnol. 2016 May;34(5):525-7. doi: 10.1038/nbt.3519. Epub 2016 Apr 4. Erratum In: Nat Biotechnol. 2016 Aug 9;34(8):888.
- Robinson MD, McCarthy DJ, Smyth GK. edgeR: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data. Bioinformatics. 2010 Jan 1;26(1):139-40. doi: 10.1093/bioinformatics/btp616. Epub 2009 Nov 11.
- Law V, Knox C, Djoumbou Y, Jewison T, Guo AC, Liu Y, Maciejewski A, Arndt D, Wilson M, Neveu V, Tang A, Gabriel G, Ly C, Adamjee S, Dame ZT, Han B, Zhou Y, Wishart DS. DrugBank 4.0: shedding new light on drug metabolism. Nucleic Acids Res. 2014 Jan;42(Database issue):D1091-7. doi: 10.1093/nar/gkt1068. Epub 2013 Nov 6.
- Sugaya N, Kanai S, Furuya T. Dr. PIAS 2.0: an update of a database of predicted druggable protein-protein interactions. Database (Oxford). 2012 Oct 10;2012:bas034. doi: 10.1093/database/bas034. Print 2012.
- Subramanian A, Kuehn H, Gould J, Tamayo P, Mesirov JP. GSEA-P: a desktop application for Gene Set Enrichment Analysis. Bioinformatics. 2007 Dec 1;23(23):3251-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btm369. Epub 2007 Jul 20.
- Cohn HI, Teng JM. Advancement in management of epidermolysis bullosa. Curr Opin Pediatr. 2016 Aug;28(4):507-16. doi: 10.1097/MOP.0000000000000380.
- Uitto J, Bruckner-Tuderman L, Christiano AM, McGrath JA, Has C, South AP, Kopelan B, Robinson EC. Progress toward Treatment and Cure of Epidermolysis Bullosa: Summary of the DEBRA International Research Symposium EB2015. J Invest Dermatol. 2016 Feb;136(2):352-358. doi: 10.1016/j.jid.2015.10.050.
- Nystrom A, Thriene K, Mittapalli V, Kern JS, Kiritsi D, Dengjel J, Bruckner-Tuderman L. Losartan ameliorates dystrophic epidermolysis bullosa and uncovers new disease mechanisms. EMBO Mol Med. 2015 Sep;7(9):1211-28. doi: 10.15252/emmm.201505061.
- Wally V, Kitzmueller S, Lagler F, Moder A, Hitzl W, Wolkersdorfer M, Hofbauer P, Felder TK, Dornauer M, Diem A, Eiler N, Bauer JW. Topical diacerein for epidermolysis bullosa: a randomized controlled pilot study. Orphanet J Rare Dis. 2013 May 7;8:69. doi: 10.1186/1750-1172-8-69.
- Li J, Zheng S, Chen B, Butte AJ, Swamidass SJ, Lu Z. A survey of current trends in computational drug repositioning. Brief Bioinform. 2016 Jan;17(1):2-12. doi: 10.1093/bib/bbv020. Epub 2015 Mar 31.
- Low YS, Daugherty AC, Schroeder EA, Chen W, Seto T, Weber S, Lim M, Hastie T, Mathur M, Desai M, Farrington C, Radin AA, Sirota M, Kenkare P, Thompson CA, Yu PP, Gomez SL, Sledge GW Jr, Kurian AW, Shah NH. Synergistic drug combinations from electronic health records and gene expression. J Am Med Inform Assoc. 2017 May 1;24(3):565-576. doi: 10.1093/jamia/ocw161.
- Bchetnia M, Tremblay ML, Leclerc G, Duperee A, Powell J, McCuaig C, Morin C, Legendre-Guillemin V, Laprise C. Expression signature of epidermolysis bullosa simplex. Hum Genet. 2012 Mar;131(3):393-406. doi: 10.1007/s00439-011-1077-7. Epub 2011 Aug 30.
- Roth W, Reuter U, Wohlenberg C, Bruckner-Tuderman L, Magin TM. Cytokines as genetic modifiers in K5-/- mice and in human epidermolysis bullosa simplex. Hum Mutat. 2009 May;30(5):832-41. doi: 10.1002/humu.20981.
- Lee B, Geyfman M, Andersen B, Dai X. Analysis of gene expression in skin using laser capture microdissection. Methods Mol Biol. 2013;989:109-17. doi: 10.1007/978-1-62703-330-5_10.
- Lovendorf MB, Mitsui H, Zibert JR, Ropke MA, Hafner M, Dyring-Andersen B, Bonefeld CM, Krueger JG, Skov L. Laser capture microdissection followed by next-generation sequencing identifies disease-related microRNAs in psoriatic skin that reflect systemic microRNA changes in psoriasis. Exp Dermatol. 2015 Mar;24(3):187-93. doi: 10.1111/exd.12604.
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Tiistai 28. marraskuuta 2017
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Maanantai 30. joulukuuta 2024
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Tiistai 31. joulukuuta 2024
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Maanantai 21. elokuuta 2017
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Keskiviikko 30. elokuuta 2017
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Torstai 31. elokuuta 2017
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Arvioitu)
Tiistai 13. helmikuuta 2024
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Sunnuntai 11. helmikuuta 2024
Viimeksi vahvistettu
Torstai 1. helmikuuta 2024
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
- Synnynnäiset poikkeavuudet
- Geneettiset sairaudet, synnynnäiset
- Sidekudostaudit
- Ihosairaudet, rakkuloita
- Ihon poikkeavuudet
- Kollageenisairaudet
- Ihosairaudet
- Ihosairaudet, geneettiset
- Bullosa-epidermolyysi
- Epidermolysis Bullosa Dystrophica
- Epidermolyysi Bullosa Simplex
- Epidermolyysi Bullosa, Junctional
Muut tutkimustunnusnumerot
- 41142
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
EI
IPD-suunnitelman kuvaus
Toistaiseksi tietoja ei ole tarkoitus jakaa muiden tutkijoiden kanssa.
Kun tulosmittaukset on saatu päätökseen, tutkimusryhmä julkaisee tulokset koko klinikalle.gov.
yhteisöä ja tutkijoita tähän haavoittuva väestötutkimukseen.
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Terve
-
Chia Tai Tianqing Pharmaceutical Group Co., Ltd.ValmisMass Balance of [14C] TQ05105 in Healthy Chinese SubjectsKiina
Kliiniset tutkimukset Kokeellinen ryhmä
-
KTO Karatay UniversityValmis
-
University of SevilleValmisKrooninen kipu | Krooninen alaselän kipu | Autonominen epätasapainoEspanja
-
University of Sao Paulo General HospitalInstituto do Cancer do Estado de São Paulo; Instituto Nacional de Cancer... ja muut yhteistyökumppanitTuntematonKipu | Neuriitti | Perifeerinen neuropatia | ParestesiaBrasilia
-
Riphah International UniversityValmisInkontinenssi, VirtsatiePakistan
-
Shalamar Institute of Health SciencesAktiivinen, ei rekrytointiSynnytyksen jälkeinen lumbopelvic-kipuPakistan
-
McGill UniversityRekrytointiKirurginen koulutusKanada
-
Sunnybrook Health Sciences CentreValmisTietokoneavusteinen leikkausKanada
-
Otolith LabsMCRAValmisBPPV | Huimaus | Hyvälaatuinen kohtauksellinen asentohuimaus | Vestibulaarinen migreeni | Vestibulaarinen häiriö | Menieren tauti | Ménièren huimaus | Labryntiitti | Migreeniin liittyvä huimaus | Korvaamaton yksipuolinen vestibulopatiaYhdysvallat
-
Sunnybrook Health Sciences CentreTuntematonTietokoneavusteinen leikkaus
-
Sunnybrook Health Sciences CentreTuntematonTietokoneavusteinen leikkaus