- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk utprøving NCT03269474
Computational Drug Repurposing for alle EBS-tilfeller
11. februar 2024 oppdatert av: Joyce Teng
Computational Drug Repurposing for alle Epidermolysis Bullosa Simplex (EBS) tilfeller
Studien vil sammenligne genuttrykksforskjeller mellom blemmer og ikke-blær hud fra individer med alle undertyper av EB, samt normal hud fra ikke-EB-personer.
State of the art beregningsanalyse vil bli utført for å hjelpe til med å identifisere nye medisiner som kan hjelpe all EB sårheling og redusere smerte.
Forskere vil fokusere på medikamenter som allerede er godkjent for behandling av andre dermatologiske eller ikke-dermatologiske sykdommer, og derfor brukes på nytt for behandling av EB.
Medikamentutvikling er en svært kostbar prosess som tar flere tiår å utføre.
Gjenbruk av medikamenter på den annen side reduserer kostnadene betydelig og forkorter tiden som er nødvendig for å bringe effektive behandlinger til klinisk bruk.
Til dags dato er det ingen spesifikk behandling rettet mot fysiologien og immunologisk respons hos EB-pasienter under sårheling.
Markedstilgjengelighet av gjenbrukte medisiner vil gi alle EB-pasienter rask tilgang til behandlinger, og dermed forbedre livskvaliteten deres.
Studieoversikt
Status
Rekruttering
Forhold
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
Selv om gen-, celle- og proteinbaserte terapier er under utvikling for pasienter som lider av alle undertyper av epidermolysis bullosa (EB), er det sårt behov for nye farmakologiske behandlinger.
Karakteriserende molekylære endringer i EB, inkludert genuttrykk, kan identifisere nye terapeutiske mål og medisiner som modulerer disse målene.
Å sile gjennom informasjon om genuttrykk for å identifisere de mest lovende medikamentmålene er imidlertid en kompleks datautfordring.
Målet med studien vil identifisere en beregningsmessig tilnærming for å evaluere og identifisere eksisterende legemidler godkjent for andre sykdommer som kan brukes på nytt for EB-pasienter.
Studien vil utføre en enestående karakterisering av genuttrykksendringer hos EB-pasienter sammenlignet med friske, ikke-EB-individer på tvers av flere vev.
Ved å bruke en validert beregningsbasert legemiddeloppdagelsesplattform, vil forskere analysere genuttrykk og legemiddeldata ved hjelp av unike algoritmer.
I det første året vil en liste på ti sikkerhetsmedisiner som er mer sannsynlig å behandle EB-sykdomstilstanden bli identifisert.
De mest lovende legemidlene som oppdages, vil deretter bli testet i klinikken.
Studietype
Observasjonsmessig
Registrering (Antatt)
60
Kontakter og plasseringer
Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.
Studiekontakt
- Navn: Monica Martin
- Telefonnummer: 650-723-0636
- E-post: momartin@stanford.edu
Studiesteder
-
-
California
-
Palo Alto, California, Forente stater, 94304
- Rekruttering
- Pediatric Dermatology Clinic at Stanford Children's Hospital
-
Hovedetterforsker:
- Joyce M Teng, MD, PhD
-
Ta kontakt med:
- Monica Martin
- Telefonnummer: 650-723-0636
- E-post: PediatricDermStudy@stanford.edu
-
Ta kontakt med:
- Elidia V Tafoya, MPH
- Telefonnummer: 650-724-1982
- E-post: PediatricDermStudy@stanford.edu
-
Underetterforsker:
- Kavita Sarin, MD, PhD
-
-
Deltakelseskriterier
Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
3 år og eldre (Barn, Voksen, Eldre voksen)
Tar imot friske frivillige
Ja
Prøvetakingsmetode
Sannsynlighetsprøve
Studiepopulasjon
Personer i alle aldre med enten 1) en diagnose av EB-personer eller 2) friske, ikke-EB-personer
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Emner i alle aldre
- Diagnostisering av alle undertyper av EB-fag
- Friske, ikke-EB-fag
- Evne til å fullføre studiebesøk for å samle vev og blodprøver
Ekskluderingskriterier:
- Graviditet, amming
- Tidligere historie med leversykdom
- Alvorlig kjent samtidig medisinsk sykdom eller infeksjon, som potensielt kan utgjøre en sikkerhetsrisiko og/eller forhindre vevsansamling fra forsøkspersoner
Studieplan
Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Observasjonsmodeller: Kohort
- Tidsperspektiver: Potensielle
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Eksperimentell gruppe
Blod- og vevsprøver vil bli tatt fra forsøkspersoner med en EB-diagnose.
Vevsprøver vil bli tatt fra blemmer og hud uten blemmer.
|
Personer med EB-diagnose
|
|
Kontrollgruppe
Blod- og vevsprøver vil bli tatt fra friske forsøkspersoner med ikke-EB.
Vevsprøver vil bli tatt fra et lite iøynefallende hudområde.
|
Personer med EB-diagnose
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Karakteriser genuttrykksendringer i EB ved hjelp av RNA-sekvensering (RNA-seq) og beregningsmessig profilering av potensielle legemiddelmål
Tidsramme: Gjennom gjennomføring av studiet på 1 år.
|
Bruk av bioinformatiske algoritmer for å identifisere endringer i genuttrykk og gjennomgang av over 2000 FDA-godkjente legemidler basert på forutsagt modulering av genuttrykksendringer ved bruk av et beregningsmessig evolusjonært algoritmesystem.
|
Gjennom gjennomføring av studiet på 1 år.
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.
Sponsor
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Joyce M Teng, MD, PhD, Stanford University
Publikasjoner og nyttige lenker
Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.
Generelle publikasjoner
- McLaren PJ, Mayne M, Rosser S, Moffatt T, Becker KG, Plummer FA, Fowke KR. Antigen-specific gene expression profiles of peripheral blood mononuclear cells do not reflect those of T-lymphocyte subsets. Clin Diagn Lab Immunol. 2004 Sep;11(5):977-82. doi: 10.1128/CDLI.11.5.977-982.2004.
- Sleasman JW, Leon BH, Aleixo LF, Rojas M, Goodenow MM. Immunomagnetic selection of purified monocyte and lymphocyte populations from peripheral blood mononuclear cells following cryopreservation. Clin Diagn Lab Immunol. 1997 Nov;4(6):653-8. doi: 10.1128/cdli.4.6.653-658.1997.
- Bray NL, Pimentel H, Melsted P, Pachter L. Near-optimal probabilistic RNA-seq quantification. Nat Biotechnol. 2016 May;34(5):525-7. doi: 10.1038/nbt.3519. Epub 2016 Apr 4. Erratum In: Nat Biotechnol. 2016 Aug 9;34(8):888.
- Robinson MD, McCarthy DJ, Smyth GK. edgeR: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data. Bioinformatics. 2010 Jan 1;26(1):139-40. doi: 10.1093/bioinformatics/btp616. Epub 2009 Nov 11.
- Law V, Knox C, Djoumbou Y, Jewison T, Guo AC, Liu Y, Maciejewski A, Arndt D, Wilson M, Neveu V, Tang A, Gabriel G, Ly C, Adamjee S, Dame ZT, Han B, Zhou Y, Wishart DS. DrugBank 4.0: shedding new light on drug metabolism. Nucleic Acids Res. 2014 Jan;42(Database issue):D1091-7. doi: 10.1093/nar/gkt1068. Epub 2013 Nov 6.
- Sugaya N, Kanai S, Furuya T. Dr. PIAS 2.0: an update of a database of predicted druggable protein-protein interactions. Database (Oxford). 2012 Oct 10;2012:bas034. doi: 10.1093/database/bas034. Print 2012.
- Subramanian A, Kuehn H, Gould J, Tamayo P, Mesirov JP. GSEA-P: a desktop application for Gene Set Enrichment Analysis. Bioinformatics. 2007 Dec 1;23(23):3251-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btm369. Epub 2007 Jul 20.
- Cohn HI, Teng JM. Advancement in management of epidermolysis bullosa. Curr Opin Pediatr. 2016 Aug;28(4):507-16. doi: 10.1097/MOP.0000000000000380.
- Uitto J, Bruckner-Tuderman L, Christiano AM, McGrath JA, Has C, South AP, Kopelan B, Robinson EC. Progress toward Treatment and Cure of Epidermolysis Bullosa: Summary of the DEBRA International Research Symposium EB2015. J Invest Dermatol. 2016 Feb;136(2):352-358. doi: 10.1016/j.jid.2015.10.050.
- Nystrom A, Thriene K, Mittapalli V, Kern JS, Kiritsi D, Dengjel J, Bruckner-Tuderman L. Losartan ameliorates dystrophic epidermolysis bullosa and uncovers new disease mechanisms. EMBO Mol Med. 2015 Sep;7(9):1211-28. doi: 10.15252/emmm.201505061.
- Wally V, Kitzmueller S, Lagler F, Moder A, Hitzl W, Wolkersdorfer M, Hofbauer P, Felder TK, Dornauer M, Diem A, Eiler N, Bauer JW. Topical diacerein for epidermolysis bullosa: a randomized controlled pilot study. Orphanet J Rare Dis. 2013 May 7;8:69. doi: 10.1186/1750-1172-8-69.
- Li J, Zheng S, Chen B, Butte AJ, Swamidass SJ, Lu Z. A survey of current trends in computational drug repositioning. Brief Bioinform. 2016 Jan;17(1):2-12. doi: 10.1093/bib/bbv020. Epub 2015 Mar 31.
- Low YS, Daugherty AC, Schroeder EA, Chen W, Seto T, Weber S, Lim M, Hastie T, Mathur M, Desai M, Farrington C, Radin AA, Sirota M, Kenkare P, Thompson CA, Yu PP, Gomez SL, Sledge GW Jr, Kurian AW, Shah NH. Synergistic drug combinations from electronic health records and gene expression. J Am Med Inform Assoc. 2017 May 1;24(3):565-576. doi: 10.1093/jamia/ocw161.
- Bchetnia M, Tremblay ML, Leclerc G, Duperee A, Powell J, McCuaig C, Morin C, Legendre-Guillemin V, Laprise C. Expression signature of epidermolysis bullosa simplex. Hum Genet. 2012 Mar;131(3):393-406. doi: 10.1007/s00439-011-1077-7. Epub 2011 Aug 30.
- Roth W, Reuter U, Wohlenberg C, Bruckner-Tuderman L, Magin TM. Cytokines as genetic modifiers in K5-/- mice and in human epidermolysis bullosa simplex. Hum Mutat. 2009 May;30(5):832-41. doi: 10.1002/humu.20981.
- Lee B, Geyfman M, Andersen B, Dai X. Analysis of gene expression in skin using laser capture microdissection. Methods Mol Biol. 2013;989:109-17. doi: 10.1007/978-1-62703-330-5_10.
- Lovendorf MB, Mitsui H, Zibert JR, Ropke MA, Hafner M, Dyring-Andersen B, Bonefeld CM, Krueger JG, Skov L. Laser capture microdissection followed by next-generation sequencing identifies disease-related microRNAs in psoriatic skin that reflect systemic microRNA changes in psoriasis. Exp Dermatol. 2015 Mar;24(3):187-93. doi: 10.1111/exd.12604.
Studierekorddatoer
Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
28. november 2017
Primær fullføring (Antatt)
30. desember 2024
Studiet fullført (Antatt)
31. desember 2024
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
21. august 2017
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
30. august 2017
Først lagt ut (Faktiske)
31. august 2017
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Antatt)
13. februar 2024
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
11. februar 2024
Sist bekreftet
1. februar 2024
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- 41142
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
NEI
IPD-planbeskrivelse
Per nå er det ingen planer om å dele dataene med andre forskere.
Når utfallsmålene er oppnådd, vil forskerteamet publisere resultater for hele clinicaltrials.gov
samfunnet og forskere for denne sårbare befolkningsstudien.
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Nei
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Nei
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .
Kliniske studier på Sunn
-
Universidad Católica del MauleRekruttering
-
Universidad Católica del MauleFullført
-
Universidade do PortoFoundation for Science and Technology (FCT); Faculdade de Desporto da Universidade...Aktiv, ikke rekrutterendeHealthy People-programmerPortugal
-
VA Office of Research and DevelopmentFullført
-
University Rovira i VirgiliFullførtHealthy People-programmer | Forebygging og kontrollSpania
-
Universidade do PortoFoundation for Science and Technology, PortugalAktiv, ikke rekrutterende
-
University Hospital, GhentRekrutteringHealthy Controls Group - alders- og kjønnsmatchet | Repeterende negativ tenkningBelgia
-
University of MiamiJames and Esther King Biomedical Research ProgramAvsluttetHealthy Lifetime Ikke-røykereForente stater
-
Fundació Institut de Recerca de l'Hospital de la...FullførtHealthy People-programmerSpania
-
University of North Carolina, Chapel HillNorth Carolina Translational and Clinical Sciences InstituteRekrutteringHealthy Controls Group - alders- og kjønnsmatchet | Borderline personlighetsforstyrrelse (BPD)Forente stater
Kliniske studier på Eksperimentell gruppe
-
Riphah International UniversityFullført
-
University Hospital, CaenAssociation Francaise de ChirurgieHar ikke rekruttert ennåDivertikulær sykdom på venstre side av tykktarmen
-
HITEC-Institute of Medical SciencesFullførtPulpal betennelsePakistan
-
Centre Hospitalier Intercommunal Robert BallangerRekrutteringAutismespektrumforstyrrelse (ASD)Frankrike
-
University of BurgundyFullført
-
Shengjing HospitalRekruttering
-
Riphah International UniversityRekrutteringFriske mannlige og kvinnelige emnerPakistan
-
RenJi HospitalHar ikke rekruttert ennåVæskerespons | Slagvolumvariasjon | SVV-FloTrac | Thorax elektrisk bioimpedansKina
-
RenJi HospitalHar ikke rekruttert ennåVæskerespons | Slagvolumvariasjon | SVV-FloTrac | Thorax elektrisk bioimpedansKina
-
AdventHealthAdventist UniversityFullførtSvimmelhetForente stater