ESBL 産生腸内細菌科の伝染
ESBL 産生腸内細菌科とその可動性遺伝要素の伝染 - 全ゲノム配列決定によるソースの同定
調査の概要
詳細な説明
背景と目的 ヒトで最も一般的な細菌性病原体には、腸内細菌科のいくつかの種が含まれます。 それらの多くは現在、抗生物質、つまり拡張スペクトル β-ラクタマーゼ (ESBL) 産生腸内細菌科 (PE) に対して耐性になっています。 長い間、病院での感染が急速な拡大の主な要因であると考えられていました。 しかし最近では、ESBL-PE は食品や廃水にも見られます。 これらの情報源は、楽しい伝染においても重要な役割を果たす可能性があります。
研究者の目的は、病院内外の情報源を考慮して、可能な限り最高の解像度で菌株の関連性を判断できる最新の全ゲノム配列決定方法論を使用して、バーゼル都市部における ESBL-PE の伝染連鎖を特定することです。
仮説 ESBL-PE の遺伝的に関連したクラスターがほとんどなく、病院との接触者との疫学的なつながりが見られたという発見は、私たちの医療環境における関連する感染を示唆しています。 対照的に、ESBL-PE の多くの遺伝的に異なるクラスターが病院への疫学的なつながりのない発見は、ESBL の流行を維持する上での病院全体の感染の重要性に疑問を投げかけるでしょう。 この区別は、効果的な予防と制御の推奨事項を導き出すために重要です。
設計、設定、患者 バーゼル大学病院で 2003 年 1 月から 2019 年 12 月までに収集された代表的な ESBL 株について、全ゲノム配列決定が行われます。 遺伝的に関連する ESBL-PE 株を持つ患者間の疫学的関係が評価されます。
2017 年 6 月から 2019 年 12 月まで、病院とバーゼル市の両方の廃水システムからの代表的なサンプル、および病院と市の両方から収集された代表的な食品サンプルから特定された ESBL 株に対して全ゲノム配列決定がさらに実行されます。バーゼルの。 患者間の疫学的関係、ならびに遺伝的に関連する ESBL-PE 株を含む環境サンプル、およびそれぞれの ESBL 遺伝子を保有する遺伝的に関連するプラスミドを含むケースが評価されます。
方法、計画された分析、およびサンプルサイズ 伝播イベントを特定するために、大学病院の臨床微生物学部門で確立され、国際標準化機構 (ISO) の認定を受けたイルミナのテクノロジーを使用した全ゲノムシーケンスを採用します。 全体的な感染/定着率のうち、ESBL産生腸内細菌科の遺伝的に関連する分離株による感染/定着の割合が決定されます。 すべての系統発生は、伝達率を定量化するために以前に開発されたツールを使用して、BEAST v2.046 を使用して推測されます。 全体として、患者のサンプルからの 2000 の分離株と、食品および廃水のサンプルからの 1000 の分離株が分析されます。
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Sarah Tschudin-Sutter, PD MD
- 電話番号:6810 ++41 61 328
- メール:sarah.tschudin@usb.ch
研究場所
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-
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Basel、スイス、4031
- 募集
- University Hospital Switzerland, Division of Infecteous Disease and Hospital Epidemiology
-
コンタクト:
- Sarah Tschudin-Sutter, PD MD
- 電話番号:6810 +41 61 328
- メール:sarah.tschudin@usb.ch
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 1歳以上
- 2019 年 1 月 1 日から 12 月 31 日までのバーゼル大学病院の外来患者および入院患者の定期的な臨床診療によって得られた検体からの証明済み ESBL-PE 運搬
除外基準:
- 包含基準を満たしていない
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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感染・定着率
時間枠:研究完了まで、平均45ヶ月
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全体的な感染/定着率のESBL産生腸内細菌科の遺伝的に関連する分離株による感染/定着の割合(主要な結果)は、種と期間の外来設定と外来設定の両方で決定され、層別化されます。
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研究完了まで、平均45ヶ月
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者:Sarah Tschudin-Sutter, PD MD、Division of Infectious Disease and Hopital Epidemiology, University Hospital Basle
出版物と役立つリンク
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (推定)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
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