ESBL 생성 장내세균과의 전파
ESBL 생성 장내세균과의 이동성 유전 요소의 전달 - 전체 게놈 시퀀싱에 의한 출처 식별
연구 개요
상세 설명
배경 및 목적 인간에서 가장 흔한 세균성 병원체는 장내세균과(Enterobacteriaceae) 계열의 여러 종을 포함합니다. 그들 중 다수는 이제 항생제, 즉 ESBL(extended-spectrum beta-lactamases) 생성 장내세균(PE)에 대한 내성을 갖게 되었습니다. 오랫동안 병원에서의 전염이 급속한 확산을 이끄는 주요 요인이라고 생각되었습니다. 하지만 최근에는 ESBL-PE가 음식과 폐수에서도 발견되었습니다. 이러한 출처는 또한 전송을 즐겁게 하는 데 중요한 역할을 할 가능성이 있습니다.
조사관의 목표는 병원 내부 및 외부 소스를 모두 고려하여 가장 높은 해상도로 변종의 관련성을 결정할 수 있는 최신 전체 게놈 시퀀싱 방법론을 사용하여 바젤 도시 지역에서 ESBL-PE의 전송 체인을 식별하는 것입니다.
가설 병원 접촉에 대한 역학적 연결이 있는 ESBL-PE의 유전적으로 관련된 소수의 클러스터의 발견은 우리의 의료 환경에서 관련 전파를 제안할 것입니다. 대조적으로, 병원과의 역학적 연결이 없는 ESBL-PE의 많은 유 전적으로 구별되는 클러스터의 발견은 ESBL 전염병을 유지하는 데 있어 병원 전체 전파의 중요성에 의문을 제기할 것입니다. 이러한 구분은 효과적인 예방 및 통제 권장 사항을 도출하는 데 중요합니다.
설계, 설정 및 환자 전체 게놈 시퀀싱은 2003년 1월부터 2019년 12월까지 바젤 대학 병원에서 수집된 대표적인 ESBL-변종에 대해 수행됩니다. 유전적으로 관련된 ESBL-PE 변종을 가진 환자들 사이의 역학적 관계가 평가될 것입니다.
2017년 6월부터 2019년 12월까지 병원과 바젤시 폐수 시스템의 대표 샘플과 병원과 바젤시에서 수집한 대표 식품 샘플에서 식별된 ESBL 균주에 대해 전체 게놈 시퀀싱을 추가로 수행할 예정입니다. 바젤의. ESBL-PE의 유 전적으로 관련된 변종이 있는 환경 샘플과 각 ESBL 유전자를 운반하는 유 전적으로 관련된 플라스미드가있는 경우뿐만 아니라 환자 간의 역학적 관계가 평가됩니다.
방법, 계획된 분석 및 샘플 크기 전송 이벤트를 식별하기 위해 우리는 대학 병원의 임상 미생물학과에서 확립되고 국제 표준 기구(ISO)의 인증을 받은 Illumina 기술을 사용한 전체 게놈 시퀀싱을 사용할 것입니다. 전체 감염/집락화 비율 중 ESBL 생성 장내세균과의 유전적으로 관련된 분리주와의 감염/집락화 비율이 결정될 것입니다. 전송 속도를 정량화하기 위해 이전에 개발된 도구를 사용하는 BEAST v2.046을 사용하여 모든 계통 발생을 추론합니다. 전반적으로, 환자의 샘플에서 분리된 2000개와 식품 및 폐수 샘플에서 분리된 1000개가 분석될 것입니다.
연구 유형
등록 (추정된)
연락처 및 위치
연구 연락처
- 이름: Sarah Tschudin-Sutter, PD MD
- 전화번호: 6810 ++41 61 328
- 이메일: sarah.tschudin@usb.ch
연구 장소
-
-
-
Basel, 스위스, 4031
- 모병
- University Hospital Switzerland, Division of Infecteous Disease and Hospital Epidemiology
-
연락하다:
- Sarah Tschudin-Sutter, PD MD
- 전화번호: 6810 +41 61 328
- 이메일: sarah.tschudin@usb.ch
-
-
참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- 1세 이상
- 2019년 1월 1일부터 12월 31일까지 Basle 대학 병원의 일상적인 임상 실습 및 입원 환자에서 얻은 모든 검체에서 입증된 ESBL-PE 캐리지
제외 기준:
- 포함 기준을 충족하지 않음
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
|
감염/식민화 비율
기간: 학업 완료까지 평균 45개월
|
ESBL 생성 장내세균과(일차 결과)의 유전적으로 관련된 분리주를 사용한 감염/식민화 비율은 전체 감염/집락화 비율을 결정하고 종 및 기간에 대한 입원 및 외래 환자 설정 모두에 대해 계층화합니다.
|
학업 완료까지 평균 45개월
|
공동 작업자 및 조사자
수사관
- 수석 연구원: Sarah Tschudin-Sutter, PD MD, Division of Infectious Disease and Hopital Epidemiology, University Hospital Basle
간행물 및 유용한 링크
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (추정된)
연구 완료 (추정된)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (추정된)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
이 정보는 변경 없이 clinicaltrials.gov 웹사이트에서 직접 가져온 것입니다. 귀하의 연구 세부 정보를 변경, 제거 또는 업데이트하도록 요청하는 경우 register@clinicaltrials.gov. 문의하십시오. 변경 사항이 clinicaltrials.gov에 구현되는 즉시 저희 웹사이트에도 자동으로 업데이트됩니다. .
병원 획득 감염에 대한 임상 시험
-
Weill Medical College of Cornell University완전한
-
Gümüşhane UniversıtyKaradeniz Technical University완전한Kelkit District State Hospital Home Health Unit에 등록 | 가정 간호 환자칠면조
ESBL 생성 장내세균과에 대한 임상 시험
-
Centre Hospitalier Universitaire de BesanconUniversity Hospital, Geneva; UMC Utrecht; University of Oxford; University Hospital Tuebingen; Hospital Universitario Virgen Macarena완전한
-
University of Bordeaux알려지지 않은심각한 병 | 미생물 식민지화 | 박테리아 감염을 일으키는 확장된 스펙트럼 베타-락타마제프랑스
-
University Hospital, Angers알려지지 않은ESBL 생성 장내세균 감염
-
Wyeth is now a wholly owned subsidiary of Pfizer완전한
-
Fondation Hôpital Saint-Joseph모병
-
Wyeth is now a wholly owned subsidiary of Pfizer완전한
-
Tan Tock Seng HospitalMayo Clinic알려지지 않은
-
University of SienaMerck Sharp & Dohme LLC알려지지 않은