Анализ ДНК образцов опухолевой ткани молодых пациентов с острым лимфобластным лейкозом

ОСНОВНАЯ ЦЕЛЬ:

I. Подтвердить значимые связи между SNP, исходом лечения и токсичностью в Детской онкологической группе (CCG)-1891 на независимой выборке из последующего исследования CCG по острому лимфобластному лейкозу (ОЛЛ) стандартного риска, CCG-1952.

II. Оценить роль SNP в ферментах метаболизма лекарственных средств и развитии веноокклюзионной болезни у пациентов, получавших CCG-1952.

III. Оценить взаимодействие между генотипами и другими факторами риска для ответа на лечение в комбинированном наборе данных CCG-1891 и CCG-1952 с недавно разработанными аналитическими инструментами для данных высокой размерности.

IV. Разработать прогностические модели с использованием генетической информации, полученной в рамках задачи 1.1, и клинических данных для прогнозирования реакции на лечение и токсичности.

КОНТУР:

Образцы опухолевой ткани проходят оценку генотипа на платформе Pyrosequencing. Таблицы непредвиденных обстоятельств и тест X^2 выполняют одномерный анализ риска рецидива и генотипа, а также многомерный анализ с использованием логистической регрессии. Пропорциональные опасности Кокса оценивают риск рецидива с учетом генотипа и других искажающих факторов. Паттернирование генотипа, деревья классификации и регрессии, а также многофакторное снижение размерности оценивают паттерны однонуклеотидных полиморфизмов, связанных с токсичностью и риском рецидива.