Análisis de ADN de muestras de tejido tumoral de pacientes jóvenes con leucemia linfoblástica aguda

OBJETIVO PRIMARIO:

I. Validar asociaciones significativas entre los SNP y el resultado del tratamiento y la toxicidad en Children's Cancer Group (CCG)-1891 en un conjunto de muestras independiente de un estudio CCG sucesor para la leucemia linfoblástica aguda (LLA) de riesgo estándar, CCG-1952.

II. Evaluar el papel de los SNP en las enzimas metabolizadoras de fármacos y el desarrollo de la enfermedad venooclusiva en pacientes en CCG-1952.

tercero Evaluar las interacciones entre genotipos y otros factores de riesgo para la respuesta al tratamiento en un conjunto de datos combinados de CCG-1891 y CCG-1952 con herramientas analíticas desarrolladas recientemente para datos de alta dimensión.

IV. Desarrollar modelos predictivos utilizando información genética obtenida en el Objetivo 1.1 y datos clínicos para predecir la respuesta al tratamiento y la toxicidad.

DESCRIBIR:

Las muestras de tejido tumoral se someten a una evaluación del genotipo en la plataforma Pyrosequencing. Las tablas de contingencia y la prueba X^2 realizan un análisis univariante del riesgo de recaída y el genotipo, y análisis multivariante mediante regresión logística. Los riesgos proporcionales de Cox evalúan el riesgo de recaída dado el genotipo y otros factores de confusión. El patrón de genotipos, los árboles de clasificación y regresión y la reducción de la dimensionalidad multifactorial evalúan los patrones de polimorfismos de un solo nucleótido asociados con la toxicidad y el riesgo de recaída.