Risiko for gentagelse af de Novo-mutationer: forskning og kvantificering af paternal germinal mosaicisme ved kombineret brug af genomiske værktøjer (RRMUT)
- Inklusion af 5 familier Inklusioner vil blive foretaget af den kliniske genetikafdeling på Rouen Universitetshospital (monocentrisk undersøgelse) og vil svare til trioer af forældre + barn med uforklarlige udviklingsmæssige abnormiteter. Inklusionen af patienter vil blive integreret i rutinemæssig behandling og vil have som umiddelbar fordel for de inkluderede familier den omfattende analyse af probanden og deres forældres genomer ved hjælp af korte og lange læste sekventeringsteknikker, som repræsenterer de mest omfattende diagnostiske tests for udviklingssygdomme, og som i øjeblikket ikke er rutinemæssigt tilgængelige. Inkludering i klinisk genetik af klinikere, der er vant til at ordinere genom-dækkende analyser, vil give klar og fuldstændig information til familier. Indsamling af samtykker. Trioens DNA vil allerede være tilgængeligt på det molekylærgenetiske laboratorium, og en ny blodprøve kan blive foreslået, hvis det bliver nødvendigt. Indsamling af sæd fra faderen.
- Identifikation af et stort sæt de novo mutationer. Udvinding af blod-DNA og afsendelse til sekventering af det komplette genom til National Center for Research in Human Genomics (CNRGH, Evry), inden for rammerne af et allerede igangsat samarbejde. Analyse af sekventeringsdataene takket være den allerede eksisterende ekspertise i Rouen. Identifikation af omkring 40-120 de novo mutationer pr. trio. På dette stadium: fortolkning af variationerne identificeret med det sekundære mål at identificere årsagen til sygdommen hos børn. Langt læste genomer vil tillade at fase de novo-varianterne til den faderlige eller til den maternelle haplotype.
- Søg efter de novo mutationer i fædres sædprøver. Ekstraktion af spermatisk DNA. Design af et sekventeringspanel rettet mod de genetiske variationer identificeret i de forskellige trioer. Forberedelse af bibliotekerne, målrettet sekventering med høj gennemløb i stor dybde takket være de teknikker og det udstyr, der allerede er i drift. Specifik søgning efter de novo variationer identificeret i probanderne (i 2.), med for hver evaluering af (i) tilstedeværelsen af variationen i sædprøven, (ii) mængden af mosaicisme, hvilket afspejler andelen af bærerspermatozoer og derfor risikoen for tilbagefald, (iii) tilstedeværelsen af min variation i blodprøven fra begge forældre i dyb sekventering.
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Tilmelding
Fase
Fase
- Ikke anvendelig
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: François LECOQUIERRE, MD
- Telefonnummer: 8858 +3323288
- E-mail: francois.lecoquierre@chu-rouen.fr
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Julien BLOT
- Telefonnummer: +3323288
- E-mail: julien.blot@chu-rouen.fr
Studiesteder
-
-
-
Rouen, Frankrig
- Rouen University Hospital
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Trio bestående af et barn med udviklingsforstyrrelse og begge upåvirkede forældre
- Fravær af ætiologi efter klinisk ekspertise og genetisk testning
- Indikation af en genom-dækkende sekventeringsanalyse
- Barn fra spontan graviditet uden ægløsningsstimulerende behandling
- Tilgængelighed af DNA-blodprøver
- Tilslutning til en socialforsikring
- Patient eller patientens juridiske repræsentant, der har læst og forstået informationsskrivelsen og har underskrevet samtykkeerklæringen
Ekskluderingskriterier:
- Manglende indikation for en genom-dækkende analyse i probandet
- Ætiologien af udviklingsforstyrrelsen allerede identificeret
- Proband født efter in-vitro-fertilisering
- Umulighed af ikke-invasiv sædopsamling fra faderen
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Primært formål: Diagnostisk
- Tildeling: N/A
- Interventionel model: Enkelt gruppeopgave
- Maskning: Ingen (Åben etiket)
Antal våben
Våben og indgreb
Deltagergruppe / ArmDeltagergruppe / Arm |
Intervention / BehandlingIntervention / Behandling |
|---|---|
|
Eksperimentel: Indikation for en helgenomanalyse i probanden
|
genom-dækkende analyser vil blive udført hos patienter og forældre (far, mor)
Spermanalyse vil blive udført i faderlige prøver
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tidsramme |
|---|---|
|
Andel af patientens de novo mutationer, der kan påvises i faderens sæd
Tidsramme: Dag 1
|
Dag 1
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tidsramme |
|---|---|
|
Antal patienter, for hvem der er opnået molekylær diagnose (årsag til udviklingshæmning identificeret) ≥1
Tidsramme: Dag 1
|
Dag 1
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: François LECOQUIERRE, MD, University Hospital, Rouen
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Lecoquierre F, Drouot N, Coutant S, Quenez O, Fourneaux S, Jumeau F, Rives N, Charbonnier F, Derambure C, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Goldenberg A, Guerrot AM, Charbonnier C, Nicolas G. Parental germline mosaicism in genome-wide phased de novo variants: Recurrence risk assessment and implications for precision genetic counselling. PLoS Genet. 2025 Mar 31;21(3):e1011651. doi: 10.1371/journal.pgen.1011651. eCollection 2025 Mar.
- Lecoquierre F, Quenez O, Fourneaux S, Coutant S, Vezain M, Rolain M, Drouot N, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Dabbagh D, Gilles I, Gayet C, Saugier-Veber P, Goldenberg A, Guerrot AM, Nicolas G. High diagnostic potential of short and long read genome sequencing with transcriptome analysis in exome-negative developmental disorders. Hum Genet. 2023 Jun;142(6):773-783. doi: 10.1007/s00439-023-02553-1. Epub 2023 Apr 19.
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Faktiske)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- 2019/0401/HP
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .