Risiko for gjentakelse av de Novo-mutasjoner: forskning og kvantifisering av paternal germinal mosaikk ved kombinert bruk av genomiske verktøy (RRMUT)
- Inkludering av 5 familier Inkluderinger vil bli gjort av den kliniske genetikkavdelingen ved Rouen Universitetssykehus (monosentrisk studie) og vil tilsvare trioer av foreldre + barn med uforklarlige utviklingsavvik. Inkludering av pasienter vil bli integrert i rutinemessig behandling og vil ha som umiddelbar fordel for de inkluderte familiene den omfattende analysen av probandet og deres foreldres genomer ved hjelp av kort- og langlest sekvenseringsteknikker, som representerer de mest omfattende diagnostiske testene for utviklingssykdommer, og som for øyeblikket ikke er rutinemessig tilgjengelige. Inkludering i klinisk genetikk av klinikere som er vant til å foreskrive genomomfattende analyser vil tillate klar og fullstendig informasjon til familier. Innhenting av samtykker. Trioens DNA vil allerede være tilgjengelig ved det molekylærgenetiske laboratoriet, og en ny blodprøve kan bli foreslått ved behov. Innsamling av sæd fra faren.
- Identifikasjon av et stort sett av de novo mutasjoner. Ekstraksjon av blod-DNA og sending for sekvensering av det komplette genomet til Nasjonalt senter for forskning i humangenomikk (CNRGH, Evry), innenfor rammen av et allerede igangsatt samarbeid. Analyse av sekvenseringsdataene takket være den allerede eksisterende ekspertisen i Rouen. Identifikasjon av ca 40-120 de novo mutasjoner per trio. På dette stadiet: tolkning av variasjonene identifisert med det sekundære målet om å identifisere årsaken til sykdommen hos barn. Langt leste genomer vil tillate å fase de novo-variantene til den faderlige eller til mors haplotype.
- Søk etter de novo mutasjoner i fars sædprøver. Ekstraksjon av spermatisk DNA. Design av et sekvenseringspanel rettet mot de genetiske variasjonene identifisert i de forskjellige trioene. Forberedelse av bibliotekene, målrettet sekvensering med høy gjennomstrømning på stor dybde takket være teknikkene og utstyret som allerede er i drift. Spesifikt søk etter de novo-variasjonene identifisert i probandene (i 2.), med for hver evaluering av (i) tilstedeværelsen av variasjonen i sædprøven, (ii) mengden mosaikk, som gjenspeiler andelen bærerspermatozoer og derfor risikoen for tilbakefall, (iii) tilstedeværelsen av min variasjon i blodprøven til begge foreldrene i dyp sekvensering.
Studieoversikt
Status
Status
Forhold
Forhold
Intervensjon / Behandling
Intervensjon / Behandling
Studietype
Studietype
Registrering (Faktiske)
Registrering
Fase
Fase
- Ikke aktuelt
Kontakter og plasseringer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: François LECOQUIERRE, MD
- Telefonnummer: 8858 +3323288
- E-post: francois.lecoquierre@chu-rouen.fr
Studer Kontakt Backup
- Navn: Julien BLOT
- Telefonnummer: +3323288
- E-post: julien.blot@chu-rouen.fr
Studiesteder
-
-
-
Rouen, Frankrike
- Rouen University Hospital
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Barn
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Trio bestående av et barn med utviklingsforstyrrelse og begge upåvirkede foreldre
- Fravær av etiologi etter klinisk ekspertise og genetisk testing
- Indikasjon på en genomomfattende sekvenseringsanalyse
- Barn fra spontan graviditet uten eggløsningsstimulerende behandling
- Tilgjengelighet av DNA-blodprøver
- Tilknytning til en sosialforsikring
- Pasient eller pasients prosessfullmektig som har lest og forstått informasjonsbrevet og har signert samtykkeerklæringen
Ekskluderingskriterier:
- Mangel på indikasjon for en genomomfattende analyse i probandet
- Etiologien til utviklingsforstyrrelsen er allerede identifisert
- Proband født etter in-vitro-fertilisering
- Umulighet for ikke-invasiv sædinnsamling fra far
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Primært formål: Diagnostisk
- Tildeling: N/A
- Intervensjonsmodell: Enkeltgruppeoppdrag
- Masking: Ingen (Open Label)
Antall våpen
Våpen og intervensjoner
Deltakergruppe / ArmDeltakergruppe / Arm |
Intervensjon / BehandlingIntervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Eksperimentell: Indikasjon for en genomvidde analyse i probanden
|
genomomfattende analyser vil bli gjort hos pasienter og foreldre (far, mor)
Spermanalyse vil bli gjort i farsprøver
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tidsramme |
|---|---|
|
Andel av pasientens de novo-mutasjoner som kan påvises i fars sædceller
Tidsramme: Dag 1
|
Dag 1
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tidsramme |
|---|---|
|
Antall pasienter som har fått molekylær diagnose (årsak til utviklingshemming identifisert) ≥1
Tidsramme: Dag 1
|
Dag 1
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Sponsor
Etterforskere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: François LECOQUIERRE, MD, University Hospital, Rouen
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Lecoquierre F, Drouot N, Coutant S, Quenez O, Fourneaux S, Jumeau F, Rives N, Charbonnier F, Derambure C, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Goldenberg A, Guerrot AM, Charbonnier C, Nicolas G. Parental germline mosaicism in genome-wide phased de novo variants: Recurrence risk assessment and implications for precision genetic counselling. PLoS Genet. 2025 Mar 31;21(3):e1011651. doi: 10.1371/journal.pgen.1011651. eCollection 2025 Mar.
- Lecoquierre F, Quenez O, Fourneaux S, Coutant S, Vezain M, Rolain M, Drouot N, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Dabbagh D, Gilles I, Gayet C, Saugier-Veber P, Goldenberg A, Guerrot AM, Nicolas G. High diagnostic potential of short and long read genome sequencing with transcriptome analysis in exome-negative developmental disorders. Hum Genet. 2023 Jun;142(6):773-783. doi: 10.1007/s00439-023-02553-1. Epub 2023 Apr 19.
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær fullføring (Faktiske)
Primær fullføring
Studiet fullført (Faktiske)
Studiet fullført
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Først lagt ut
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Sist oppdatering lagt ut
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
Andre studie-ID-numre
- 2019/0401/HP
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .