De Novo -mutaatioiden toistumisen riski: Isän idun mosaikismin tutkimus ja kvantifiointi genomien työkalujen yhteiskäytöllä (RRMUT)
- 5 perheen sisällyttäminen Inkluusioineen tekee Rouenin yliopistollisen sairaalan kliinisen genetiikan osasto (monosentrinen tutkimus), ja ne vastaavat vanhempien + lapsen kolmikkoa, jolla on selittämättömiä kehityshäiriöitä. Potilaiden osallistaminen integroidaan rutiinihoitoon ja tuo mukanaan oleville perheille välittömänä hyödynä probandin ja heidän vanhempiensa genomien laaja analyysi lyhyt- ja pitkälukusekvensointitekniikoilla, jotka edustavat kattavimpia kehityssairauksien diagnostisia testejä. ja joita ei tällä hetkellä ole rutiininomaisesti saatavilla. Genominlaajuisten analyysien määräämiseen tottuneiden kliinisten asiantuntijoiden sisällyttäminen kliiniseen genetiikkaan mahdollistaa selkeän ja täydellisen tiedon perheille. Suostumusten kerääminen. Kolmion DNA on jo saatavilla molekyyligenetiikan laboratoriossa, ja tarvittaessa voidaan ehdottaa uutta verinäytettä. Siittiöiden keräys isältä.
- Tunnistaa suuri joukko de novo -mutaatioita. Veren DNA:n uuttaminen ja täydellisen genomin sekvensointia varten lähettäminen National Center for Human Genomicsin tutkimuskeskukseen (CNRGH, Evry) jo aloitetun yhteistyön puitteissa. Sekvensointitietojen analyysi Rouenissa jo olemassa olevan asiantuntemuksen ansiosta. Noin 40-120 de novo -mutaatioiden tunnistaminen triota kohti. Tässä vaiheessa: niiden muunnelmien tulkinta, joiden toissijainen tavoite on tunnistaa lasten taudin syy. Pitkät luetut genomit mahdollistavat de novo -varianttien vaiheistuksen isän tai äidin haplotyyppiin.
- Etsi de novo -mutaatioita isän siittiönäytteistä. Spermaattisen DNA:n uuttaminen. Eri trioissa tunnistettuihin geneettisiin muunnelmiin kohdistuvan sekvensointipaneelin suunnittelu. Kirjastojen valmistelu, kohdennettu korkean suorituskyvyn sekvensointi suurella syvyydellä jo toimivien tekniikoiden ja laitteiden ansiosta. Tarkka haku koettimissa (kohdassa 2.) tunnistetuille de novo -variaatioille, jossa kussakin arvioinnissa on (i) vaihtelun esiintyminen siittiönäytteessä, (ii) mosaiikkisuuden määrä, joka kuvastaa kantaja siittiöiden osuutta ja siksi uusiutumisen riski, (iii) vaihteluni esiintyminen molempien vanhempien verinäytteessä syvässä sekvensoinnissa.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Tila
Ehdot
Ehdot
Interventio / Hoito
Interventio / Hoito
Opintotyyppi
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Ilmoittautuminen
Vaihe
Vaihe
- Ei sovellettavissa
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
Opiskeluyhteys
- Nimi: François LECOQUIERRE, MD
- Puhelinnumero: 8858 +3323288
- Sähköposti: francois.lecoquierre@chu-rouen.fr
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Julien BLOT
- Puhelinnumero: +3323288
- Sähköposti: julien.blot@chu-rouen.fr
Opiskelupaikat
-
-
-
Rouen, Ranska
- Rouen University Hospital
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Kolmikko, johon kuuluu kehityshäiriöinen lapsi ja molemmat terveet vanhemmat
- Etiologian puuttuminen kliinisen asiantuntemuksen ja geneettisen testauksen jälkeen
- Indikaatio genominlaajuisesta sekvensointianalyysistä
- Lapsi spontaanista raskaudesta ilman ovulaation stimulaatiohoitoa
- DNA-verinäytteiden saatavuus
- Sosiaalivakuutuksen kuuluminen
- Potilas tai potilaan laillinen edustaja, joka on lukenut ja ymmärtänyt tiedotteen ja allekirjoittanut suostumuslomakkeen
Poissulkemiskriteerit:
- Indikaatioiden puute genominlaajuiseen analyysiin koettimessa
- Kehityshäiriön etiologia on jo tunnistettu
- Proband syntynyt koeputkihedelmöityksen jälkeen
- Ei-invasiivisen siittiöiden keräämisen mahdottomuus isältä
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Ensisijainen käyttötarkoitus: Diagnostiikka
- Jako: Ei käytössä
- Inventiomalli: Yksittäinen ryhmätehtävä
- Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)
Aseiden lukumäärä
Aseet ja interventiot
Osallistujaryhmä / ArmOsallistujaryhmä / Arm |
Interventio / HoitoInterventio / Hoito |
|---|---|
|
Kokeellinen: Indikaatio genominlaajuiselle analyysille probandissa
|
genominlaajuiset analyysit tehdään potilaille ja vanhemmille (isä, äiti)
Siittiöanalyysi tehdään isänäytteistä
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Aikaikkuna |
|---|---|
|
Potilaan isän siittiöstä havaittavissa olevien de novo -mutaatioiden osuus
Aikaikkuna: Päivä 1
|
Päivä 1
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Aikaikkuna |
|---|---|
|
Niiden potilaiden lukumäärä, joille on tehty molekyylidiagnoosi (kehityshäiriön syy tunnistettu) ≥1
Aikaikkuna: Päivä 1
|
Päivä 1
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Sponsori
Tutkijat
Tutkijat
- Päätutkija: François LECOQUIERRE, MD, University Hospital, Rouen
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Lecoquierre F, Drouot N, Coutant S, Quenez O, Fourneaux S, Jumeau F, Rives N, Charbonnier F, Derambure C, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Goldenberg A, Guerrot AM, Charbonnier C, Nicolas G. Parental germline mosaicism in genome-wide phased de novo variants: Recurrence risk assessment and implications for precision genetic counselling. PLoS Genet. 2025 Mar 31;21(3):e1011651. doi: 10.1371/journal.pgen.1011651. eCollection 2025 Mar.
- Lecoquierre F, Quenez O, Fourneaux S, Coutant S, Vezain M, Rolain M, Drouot N, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Dabbagh D, Gilles I, Gayet C, Saugier-Veber P, Goldenberg A, Guerrot AM, Nicolas G. High diagnostic potential of short and long read genome sequencing with transcriptome analysis in exome-negative developmental disorders. Hum Genet. 2023 Jun;142(6):773-783. doi: 10.1007/s00439-023-02553-1. Epub 2023 Apr 19.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Opiskelun aloitus
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Ensimmäinen Lähetetty
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin päivitys julkaistu
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
Muut tutkimustunnusnumerot
- 2019/0401/HP
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .